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Squared euclidean distance:二分差平方和,最小为0,最大无限; Size difference:最小距离为0,最大无限 Pattern difference:从0至1的无级测距; Variance:以方差为距,最小为0,最大无限 Lance and Williams:Bray- Curtis非等距系数,界于0至1之间。 选择 Similarities时各种数据类型可用的测距方法有: 1、计量资料 Pearson correlation:以 Pearson相关系数为距离 Cosine:以变量矢量的余弦值为距离,界于-1至+1之间。 2、二分类变量 Russell and rao:以二分点乘积为配对系数 Simple matching:以配对数与总对数的比例为配对系数 Jaccard:相似比例,分子与分母中的配对数与非配对数给予相同的权重 Dice:Dice配对系数,分子与分母中的配对数给予加倍的权重 Rogers and Tanimoto: Rogers and Tanimoto配对系数,分母为配对数, 分子为非配对数,非配对数给予加倍的权重 Sokal and sneath l: Sokal and Sneath I型配对系数,分母为配对数, 分子为非配对数,配对数给予加倍的权重 Sokal and sneath2: Sokal and sneathⅡ型配对系数,分子与分母均 为非配对数,但分子给予加倍的权重 Sokal and sneath3: Sokal and sneathⅢ型配对系数,分母为配对数, 分子为非配对数,分子与分母的权重相同 Kuczynski1: Kuczynski I型配对系数,分母为总数与配对数之差, 分子为非配对数,分子与分母的权重相同; Kuczynski2: Kuczynski平均条件概率; Sokal and sneath4: Sokal and sneath条件概率; Hamann: Hamann概率 Lambda: Goodman- Kruskal相似测量的λ值: Anderberg'sD:以一个变量状态预测另一个变量状态 Yule’sY:Yule综合系数,属于2×2四格表的列联比例函数; Yule'sQ: Goodman- Kruskalγ值,属于2×2四格表的列联比例函数。 3、其他类型变量 0 chiai:0 chiai二分余弦测量 Sokal and sneath5: Sokal and sneathⅤ型相似测量 Phi4 point correlation: Pearson相关系数的平方值 Dispersion: Dispersion相似测量。 同时,还可以选择数据转换形式: None:不作数据转换;• Squared Euclidean distance:二分差平方和,最小为 0,最大无限; • Size difference:最小距离为 0,最大无限; • Pattern difference:从 0 至 1 的无级测距; • Variance:以方差为距,最小为 0,最大无限; • Lance and Williams:Bray-Curtis 非等距系数,界于 0 至 1 之间。 选择 Similarities 时各种数据类型可用的测距方法有: 1、计量资料 • Pearson correlation:以 Pearson 相关系数为距离; • Cosine:以变量矢量的余弦值为距离,界于-1 至+1 之间。 2、二分类变量 • Russell and Rao:以二分点乘积为配对系数; • Simple matching:以配对数与总对数的比例为配对系数; • Jaccard:相似比例,分子与分母中的配对数与非配对数给予相同的权重; • Dice:Dice 配对系数,分子与分母中的配对数给予加倍的权重; • Rogers and Tanimoto:Rogers and Tanimoto 配对系数,分母为配对数, 分子为非配对数,非配对数给予加倍的权重; • Sokal and Sneath 1:Sokal and Sneath Ⅰ型配对系数,分母为配对数, 分子为非配对数,配对数给予加倍的权重; • Sokal and Sneath 2:Sokal and Sneath Ⅱ型配对系数,分子与分母均 为非配对数,但分子给予加倍的权重; • Sokal and Sneath 3:Sokal and Sneath Ⅲ型配对系数,分母为配对数, 分子为非配对数,分子与分母的权重相同; • Kulczynski 1:Kulczynski Ⅰ型配对系数,分母为总数与配对数之差, 分子为非配对数,分子与分母的权重相同; • Kulczynski 2:Kulczynski 平均条件概率; • Sokal and Sneath 4:Sokal and Sneath 条件概率; • Hamann:Hamann 概率; • Lambda:Goodman-Kruskai 相似测量的 λ 值; • Anderberg's D:以一个变量状态预测另一个变量状态; • Yule's Y:Yule 综合系数,属于 2×2 四格表的列联比例函数; • Yule's Q:Goodman-Kruskal γ 值,属于 2×2 四格表的列联比例函数。 3、其他类型变量 • Ochiai:Ochiai 二分余弦测量; • Sokal and Sneath 5:Sokal and Sneath Ⅴ型相似测量; • Phi 4 point correlation:Pearson 相关系数的平方值; • Dispersion:Dispersion 相似测量。 • 同时,还可以选择数据转换形式: • None:不作数据转换;
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