率，为这项研究的细致和深入奠定了基础。 背景知识 本文论证观点的关键步骤是基因转移率的测量，其结果的准确性决定了文章 分析的正确程度。作者采用的方法是检测细菌中水平转移的16 S rRNA基因的量来 推算基因转移的频率。 16 S rRNA基因是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列，其特点是存在于所 有细菌的基因组中，并且具有高度的保守性和特异性，因此可以通过比较RNA 的种类来判断是否有新的DNA序列进入了细菌中。同时，RNA的基因序列足够 长，包含了约50个功能域，因此可以通过它更加细致地判断究竞是怎样功能或种 类的基因，以及大约多长的基因转入了细菌中。 创新点 首先，文章论题的出发点就非常与众不同。大多数研究人员对基因和DNA的 研究处于微观层面，比如DNA在化学物质的影响下产生的变异，或者通过改变化 学或物理环境来研究DNA的理化性质，对DNA水平转移的认识也仅停留在微观 和简单外界作用的情况下。可见，传统的研究并没有确切解释生态环境对细菌基 因交换产生的作用，很大程度上限制了我们对微生物的认识4。而本文章中提出了 从生态学的角度研究微生物的水平基因交换，很好地弥补了这方面研究的空白， 同时生态学也是一个较为宏观的概念，即使是人体的微观内环境对于寄生细菌而 言也是一个极为复杂和广阔的环境，这种环境中的变量种类繁多，因此研究只能 通过宏观上的分类来大致进行。不过这样的研究已经尝试将微观下DNA的转移和 宏观的生态环境结合了起来，更具有实用的价值，也让我们对DNA有了新的认识。 文章中将不同长度的16 S rRNA基因的转移率从不同的生态条件下生存的细 4Unprecedented levels of horizontal gene transfer among spatially co-occurring Shewanella bacteria fromthe Baltic Sea,However,a robust understanding of the rates of genetic exchange for most bacterial species under natural conditions and the influence of the ecological settings on the rates remain elusive,severely limiting our view of the microbial world. 22 率，为这项研究的细致和深入奠定了基础。 背景知识 本文论证观点的关键步骤是基因转移率的测量，其结果的准确性决定了文章 分析的正确程度。作者采用的方法是检测细菌中水平转移的 16S rRNA 基因的量来 推算基因转移的频率。 16S rRNA 基因是细菌上编码 rRNA 相对应的 DNA 序列，其特点是存在于所 有细菌的基因组中，并且具有高度的保守性和特异性，因此可以通过比较 rRNA 的种类来判断是否有新的 DNA 序列进入了细菌中。同时，rRNA 的基因序列足够 长，包含了约 50 个功能域，因此可以通过它更加细致地判断究竟是怎样功能或种 类的基因，以及大约多长的基因转入了细菌中。 创新点 首先，文章论题的出发点就非常与众不同。大多数研究人员对基因和 DNA 的 研究处于微观层面，比如 DNA 在化学物质的影响下产生的变异，或者通过改变化 学或物理环境来研究 DNA 的理化性质，对 DNA 水平转移的认识也仅停留在微观 和简单外界作用的情况下。可见，传统的研究并没有确切解释生态环境对细菌基 因交换产生的作用，很大程度上限制了我们对微生物的认识4。而本文章中提出了 从生态学的角度研究微生物的水平基因交换，很好地弥补了这方面研究的空白， 同时生态学也是一个较为宏观的概念，即使是人体的微观内环境对于寄生细菌而 言也是一个极为复杂和广阔的环境，这种环境中的变量种类繁多，因此研究只能 通过宏观上的分类来大致进行。不过这样的研究已经尝试将微观下 DNA 的转移和 宏观的生态环境结合了起来，更具有实用的价值，也让我们对 DNA 有了新的认识。 文章中将不同长度的 16S rRNA 基因的转移率从不同的生态条件下生存的细 4 摘自 Unprecedented levels of horizontal gene transfer among spatially co-occurring Shewanella bacteria fromthe Baltic Sea，原文为 However, a robust understanding of the rates of genetic exchange for most bacterial species under natural conditions and the influence of the ecological settings on the rates remain elusive, severely limiting our view of the microbial world