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R000000000001000 T00000000000000 Q000000000000001 N000000000000000 C000000000100000 D010000000010000 R00000000000100 Y000000000000100 Y000000000000100 Q000000000000001 表6.4 Needleman和 Wunsch算法初始矩阵 接下来开始对矩阵单元连续求和。此处,从矩阵中最后一个单元开始。具体操作时, 从最后一行、最后一列开始,先按列,后按行,逐步进行。本例中最后一列为谷氨酰胺Q 而Y轴方向的序列有两个Q,按照相同匹配的分值为1的原则,该列的两个单元的分值为1, 其它均为0。 下一步统计倒数第2列,从该列的最后一行开始。该矩阵单元对应的残基不同,X轴 方向为F,而Y轴方向为Q,因此,该单元的分值为0。从该列往上,下一个单元对应的残 基为F和Y,也是一对非匹配残基,其本身的分值为0。这一单元的总体分值为1。因为根 据连续求和原则,能够达到该单元的唯一的单元的值为1。从该单元往上,这一列中其它单 元的分值均为1,这是因为该列残基F与Y轴方向序列的残基均不匹配,单元本身的分值均 为0,而且可达到它们的单元中最大值(Q-Q单元提供)为1。 ADLIGAVIFJALICIDRY FIQ A100101001000000( D010000000010000 G|000100005432110 00000005432110 Too o 0005432111R 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 T 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Q 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 D 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 R 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 Y 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 Y 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 Q 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 表 6.4 Needleman 和 Wunsch 算法初始矩阵 接下来开始对矩阵单元连续求和。此处,从矩阵中最后一个单元开始。具体操作时, 从最后一行、最后一列开始,先按列,后按行,逐步进行。本例中最后一列为谷氨酰胺 Q, 而 Y 轴方向的序列有两个 Q,按照相同匹配的分值为 l 的原则,该列的两个单元的分值为 1, 其它均为 0。 下一步统计倒数第 2 列,从该列的最后一行开始。该矩阵单元对应的残基不同,X 轴 方向为 F,而 Y 轴方向为 Q,因此,该单元的分值为 0。从该列往上,下一个单元对应的残 基为 F 和 Y,也是一对非匹配残基,其本身的分值为 0。这一单元的总体分值为 1。因为根 据连续求和原则,能够达到该单元的唯一的单元的值为 1。从该单元往上,这一列中其它单 元的分值均为 1,这是因为该列残基 F 与 Y 轴方向序列的残基均不匹配,单元本身的分值均 为 0,而且可达到它们的单元中最大值(Q-Q 单元提供)为 1。 A D L G A V F A L C D R Y F Q A 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 D 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 L 0 0 1 0 0 0 0 0 1 4 3 2 1 1 0 G 0 0 0 1 0 0 0 0 5 4 3 2 1 1 0 R 0 0 0 0 0 0 0 0 5 4 3 3 1 1 0 T 0 0 0 0 0 0 0 0 5 4 3 2 1 1 0 Q 0 0 0 0 0 0 0 0 5 4 3 2 1 1 1
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