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3,DNA聚合酶( DNA polymerase):以DNA为模板,催化核苷酸残基加到已存在的聚核苷酸3末端反 应的酶。某些DNA聚全酶具有外切核酸酶的活性,可用来校正新合成的核苷酸的序列 4, Klenow片段( Klenow fragment): E coli DNA聚合酶I经部分水解生成的C末端605个氨基酸残基片 段。该片段保留了DNA聚合酶I的5-3聚合酶和3-5外切酶活性,但缺少完整酶的5-3外切酶 5,前导链( eading strand):与复制叉移动的方向一致,通过连续的53聚合合成的新的DNA链 6,滞后链( lagging strand):与复制叉移动的方向相反,通过不连续的53聚合合成的新的DNA链。 7,冈崎片段( Okazaki fragment):相对比较短的DNA链(大约1000核苷酸残基),是在DNA的滞后链 的不连续合成期间生成的片段,这是 Reiji Okazaki在DNA合成实验中添加放射性的脱氧核苷酸前体观察到 的 引发体( prosome):一种多蛋白复合体,Ecoi中的引发体包括催化DNA滞后链不连续DNA合成所 必需的,短的RNA引物合成的引发酶,解旋酶。 9,复制体( replisome):一种多蛋白复合体,包含DNA聚合酶,引发酶,解旋酶,单链结合蛋白和其它 辅助因子。复制体位于每个复制叉处进行细菌染色体DNA复制的聚合反应。 10,单链结合蛋白(SsB):一种与单链DNA结合紧密的蛋白,它的结构可以防止复制叉处单链DNA本身 重新折叠回双链区。 11,滚环复制( rolling circle replication):复制环状DNA的一种模式,在该模式中,DNA聚合酶结合在 个缺口链的3端绕环合成与模板链互补的DNA,每一轮都是新合成的DNA取代前一轮合成的DNA 12,逆转录酶( reverse transcriptase):一种催化以RNA为模板合成DNA的DNA聚合酶,具有RNA指导 的DNA合成,水解RNA和DNA指导的DNA合成的酶活性 13,互补NDA(cDNA):通过逆转录酶由mRNA模板合成的双链DNA 14,聚合酶链式反应(PCR):扩增样品中的DNA量和富集众多DNA分子中的一个特定的DNA序列的一 种技术。在该反应中,使用与目的DNA序列互补的寡核苷酸作为引物,进行多轮的DNA合成。其中包括 DNA变性,引物退火和在 Tap DNA聚合酶催化下的DNA合成 15,直接修复( direct repair):是通过一种可连续扫描DNA,识别出损伤部位的蛋白质,将损伤部位直接 修复的方法。该修复方法不用切断DNA或切除碱基。 16切除修复( excision repaIr):通过切除-修复内切酶使DNA损伤消除的修复方法。一般是切除损伤区 然后在DNA聚合酶的作用下,以露出的单链为模板合成新的互补链,最后用连接酶将缺口连接起来。 17,错配修复( mismatch repair):在含有错配碱基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢复的修复方式 这种修复方式的过程是:识别出下正确地链,切除掉不正确链的部分,然后通过DNA聚合酶和DNA连接 酶的作用,合成正确配对的双链 第十八章 1,遗传学中心法则( genetic central dogma):描述从一个基因到相应蛋白质的信息流的途径。遗传信息 贮存在DNA中,DNA被复制传给子代细胞,信息被拷贝或由DNA转录成RNA,然后RNA翻译成多肽。不 过,由于逆转录酶的反应,也可以以RNA为模板合成DNA 2,转录( transcription):在由RNA聚合酶和辅助因子组成的转录复合物的催化下,从双链DNA分子中拷 贝生物信息生成一条RNA链的过程 3,模板链( template strand):可作为模板转录为RNA的那条链该链与转录的RNA碱基互补(AU,GC)。 在转录过程中,RNA聚合酶与模板链结合,并沿着模板链的3&aCU;58acu;方向移动,按照5&aαute; 3& acute;方向催化RNA的合成 4,编码链( coding strand):双链DNA中,不能进行转录的那一条DNA链,该链的核苷酸序列与转录生 成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA中的T)。 5,核心酶( core enzyme):大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基组成(a2B,B),没有6基的酶叫核 心酶。核心酶只能使己开始合成的RNA链延长,但不具有起始合成RNA的能力,必须加入δ基才表现出3,DNA 聚合酶(DNA polymerase):以 DNA 为模板,催化核苷酸残基加到已存在的聚核苷酸 3ˊ末端反 应的酶。某些 DNA 聚全酶具有外切核酸酶的活性,可用来校正新合成的核苷酸的序列。 4,Klenow 片段(Klenow fragment):E.coli DNA 聚合酶 I 经部分水解生成的 C 末端 605 个氨基酸残基片 段。该片段保留了 DNA 聚合酶 I 的 5ˊ-3ˊ聚合酶和 3ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的 5ˊ-3ˊ外切酶 活性。 5,前导链(leading strand):与复制叉移动的方向一致,通过连续的 5ˊ-3ˊ聚合合成的新的 DNA 链。 6,滞后链(lagging strand):与复制叉移动的方向相反,通过不连续的 5ˊ-3ˊ聚合合成的新的 DNA 链。 7,冈崎片段(Okazaki fragment):相对比较短的 DNA 链(大约 1000 核苷酸残基),是在 DNA 的滞后链 的不连续合成期间生成的片段,这是 Reiji Okazaki 在 DNA 合成实验中添加放射性的脱氧核苷酸前体观察到 的。 8,引发体(primosome):一种多蛋白复合体,E.coli 中的引发体包括催化 DNA 滞后链不连续 DNA 合成所 必需的,短的 RNA 引物合成的引发酶,解旋酶。 9,复制体(replisome):一种多蛋白复合体,包含 DNA 聚合酶,引发酶,解旋酶,单链结合蛋白和其它 辅助因子。复制体位于每个复制叉处进行细菌染色体 DNA 复制的聚合反应。 10,单链结合蛋白(SSB):一种与单链 DNA 结合紧密的蛋白,它的结构可以防止复制叉处单链 DNA 本身 重新折叠回双链区。 11,滚环复制(rolling-circle replication):复制环状 DNA 的一种模式,在该模式中,DNA 聚合酶结合在一 个缺口链的 3ˊ端绕环合成与模板链互补的 DNA,每一轮都是新合成的 DNA 取代前一轮合成的 DNA。 12,逆转录酶(reverse transcriptase):一种催化以 RNA 为模板合成 DNA 的 DNA 聚合酶,具有 RNA 指导 的 DNA 合成,水解 RNA 和 DNA 指导的 DNA 合成的酶活性。 13,互补 NDA(cDNA):通过逆转录酶由 mRNA 模板合成的双链 DNA。 14,聚合酶链式反应(PCR):扩增样品中的 DNA 量和富集众多 DNA 分子中的一个特定的 DNA 序列的一 种技术。在该反应中,使用与目的 DNA 序列互补的寡核苷酸作为引物,进行多轮的 DNA 合成。其中包括 DNA 变性,引物退火和在 Tap DNA 聚合酶催化下的 DNA 合成。 15,直接修复(direct repair):是通过一种可连续扫描 DNA,识别出损伤部位的蛋白质,将损伤部位直接 修复的方法。该修复方法不用切断 DNA 或切除碱基。 16 切除修复(excision repair):通过切除-修复内切酶使 DNA 损伤消除的修复方法。一般是切除损伤区, 然后在 DNA 聚合酶的作用下,以露出的单链为模板合成新的互补链,最后用连接酶将缺口连接起来。 17,错配修复(mismatch repair):在含有错配碱基的 DNA 分子中,使正常核苷酸序列恢复的修复方式。 这种修复方式的过程是:识别出下正确地链,切除掉不正确链的部分,然后通过 DNA 聚合酶和 DNA 连接 酶的作用,合成正确配对的双链 DNA。 第十八章 1,遗传学中心法则(genetic central dogma):描述从一个基因到相应蛋白质的信息流的途径。遗传信息 贮存在 DNA 中,DNA 被复制传给子代细胞,信息被拷贝或由 DNA 转录成 RNA,然后 RNA 翻译成多肽。不 过,由于逆转录酶的反应,也可以以 RNA 为模板合成 DNA。 2,转录(transcription):在由 RNA 聚合酶和辅助因子组成的转录复合物的催化下,从双链 DNA 分子中拷 贝生物信息生成一条 RNA 链的过程。 3,模板链(template strand):可作为模板转录为 RNA 的那条链该链与转录的 RNA 碱基互补(A-U,G-C)。 在转录过程中,RNA 聚合酶与模板链结合,并沿着模板链的 3´→5´方向移动,按照 5´ →3´方向催化 RNA 的合成。 4,编码链(coding strand):双链 DNA 中,不能进行转录的那一条 DNA 链,该链的核苷酸序列与转录生 成的 RNA 的序列一致(在 RNA 中是以 U 取代了 DNA 中的 T)。 5,核心酶(core enzyme):大肠杆菌的 RNA 聚合酶全酶由 5 个亚基组成(α2β,βδ),没有 δ 基的酶叫核 心酶。核心酶只能使已开始合成的 RNA 链延长,但不具有起始合成 RNA 的能力,必须加入 δ 基才表现出
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