第十二章鼠类和人类公用物理图谱数据库的使用 页码,10/1 6W-7796 Chr18 15CR WC18.0 8D6S1634 Chr WC6.12 1197 9W-3308 Chr 584cR WC6. 12 WC 1197 10FB10A2 Chr17 424cR WC178 WC 11 AFM198YB2 Chr 32CR WC5.0 WC-596 12 CHLC. GATA82H02 Chr WC5.0 WC-596 13D5S406 Chr WC5.0 WC-596 765D8 Posi toin Conti g STS Chrom 39CM RH Double 1D14S69 Chr14 WC-1651 2 AFMA133WF1 Chr14 C14.0 3D18s1105 Chr18 WC18.0 WC-909 4W-5528 Chr18 4CR WC18.0 5W-3058 Chr11 5CR WC18.0 WC-909 6W-5872 Chr11 145cR WC11.4 7W-6096 Chr11 143cR WC11.4 每张图对应输入的一个YAC地址,每个表包括已知YAC中的STS表,以及STS制图信息。对于每 个STS,染色体分配、基因图位置和放射性杂交图位置只要已知就会给出。另外,STS所属的 已命名的重叠群也列成表,这些表中大多数元素是超文字链接,选择合适的链接可以获得关 于一个STS或一个重叠群更多的信息。由于历史原因,许多STS有两个重叠群。双链接重叠群 (例如由成对YAC共有的重叠群)短一些,在构图的起始阶段中是可创造的更可靠的重叠群, 它们可以被放心地忽略。单个重叠群长一些,在不同方式下也应承认其合理性。 在此例中,三个YAC中有两个似乎有嵌合性,因为它们散布于几个不同的染色体的重叠群中, 很显然这三个YAC都有WC18.0重叠群,这就使尝试性的将STS分配至这个重叠群成为可能,因 为从重叠群的其它STS的基因图和放射性杂交图位置我们知道W18.0位于染色体18上,并靠 Whi tohead放射性杂交图 STS也能被置于 Whi tohead放射性杂交图中,这比STS/YAC含量图的问题简单很多,因为在放射 性杂交图上搜索一个STS只用93次PCR,而不是1000次。 Whi tohead放射性杂交图使用 Genebri dge4 radi ati on hybri d panel。与 CEPH YAC库一样,这些细胞谱系的DNA也可以从 file://E:\wcb\生物信息学(中译本)\第十二章鼠类和人类公用物理图谱 2005-1-18765_D_8 ↣ᓴ೒ᇍᑨ䕧ܹⱘϔϾYACഄഔˈ↣Ͼ㸼ࣙᣀᏆⶹYACЁⱘSTS㸼ˈҹঞSTSࠊֵ೒ᙃDŽᇍѢ↣ ϾSTSˈᶧ㡆ԧߚ䜡ǃ෎಴೒ԡ㕂੠ᬒᇘᗻᴖѸ೒ԡ㕂া㽕ᏆⶹህӮ㒭ߎDŽ঺໪ˈSTS᠔ሲⱘ Ꮖੑৡⱘ䞡঴㕸г߫៤㸼ˈ䖭ѯ㸼Ё໻໮᭄ܗ㋴ᰃ䍙᭛ᄫ䫒᥹ˈ䗝ᢽড়䗖ⱘ䫒᥹ৃҹ㦋ᕫ݇ ѢϔϾSTS៪ϔϾ䞡঴㕸᳈໮ⱘֵᙃDŽ⬅Ѣग़৆ॳ಴ˈ䆌໮STS᳝ϸϾ䞡঴㕸DŽঠ䫒᥹䞡঴㕸 ˄՟བ⬅៤ᇍYAC᳝݅ⱘ䞡঴㕸˅ⷁϔѯˈ೼ᵘ೒ⱘ䍋ྟ䰊↉Ёᰃৃ߯䗴ⱘ᳈ৃ䴴ⱘ䞡঴㕸ˈ ᅗӀৃҹ㹿ᬒᖗഄᗑ⬹DŽऩϾ䞡঴㕸䭓ϔѯˈ೼ϡৠᮍᓣϟгᑨᡓ䅸݊ড়⧚ᗻDŽ ೼ℸ՟ЁˈϝϾYACЁ᳝ϸϾԐТ᳝ጠড়ᗻˈ಴ЎᅗӀᬷᏗѢ޴Ͼϡৠⱘᶧ㡆ԧⱘ䞡঴㕸Ёˈ ᕜᰒ✊䖭ϝϾYAC䛑᳝WC18.0䞡঴㕸ˈ䖭ህՓᇱ䆩ᗻⱘᇚSTSߚ䜡㟇䖭Ͼ䞡঴㕸៤Ўৃ㛑ˈ಴ ЎҢ䞡঴㕸ⱘ݊ᅗSTS ⱘ෎಴೒੠ᬒᇘᗻᴖѸ೒ԡ㕂៥Ӏⶹ䘧WC18.0ԡѢᶧ㡆ԧ18Ϟˈᑊ䴴 䖥3ッDŽ WhiteheadᬒᇘᗻᴖѸ೒ STSг㛑㹿㕂ѢWhiteheadᬒᇘᗻᴖѸ೒Ёˈ䖭↨STS/YAC৿䞣೒ⱘ䯂乬ㅔऩᕜ໮ˈ಴Ў೼ᬒᇘ ᗻᴖѸ೒Ϟ᧰㋶ϔϾSTSা⫼93⃵PCRˈ㗠ϡᰃ1000⃵DŽWhiteheadᬒᇘᗻᴖѸ೒Փ⫼ Genebridge 4 radiation hybrid panelDŽϢCEPH YACᑧϔḋˈ䖭ѯ㒚㚲䈅㋏ⱘDNAгৃҹҢ 6 WI-7796 Chr18 - 15cR WC18.0 - 8 D6S1634 Chr6 96cM - WC6.12 WC- 1197 9 WI-3308 Chr6 - 584cR WC6.12 WC- 1197 10 FB10A2 Chr17 - 424cR WC17.8 WC- 1673 11 AFM198YB2 Chr5 - 32cR WC5.0 WC-596 12 CHLC.GATA82H02 Chr5 - - WC5.0 WC-596 13 D5S406 Chr5 12cM - WC5.0 WC-596 Map Positioin Contig STS Chrom 39cM RH Single Double 1 D14S69 Chr14 - - WC14.0 WC-1651 2 AFMA133WF1 Chr14 1cM - WC14.0 WC-1651 3 D18S1105 Chr18 - - WC18.0 WC-909 4 WI-5528 Chr18 - 4cR WC18.0 - 5 WI-3058 Chr11 - 5cR WC18.0 WC-909 6 WI-5872 Chr11 - 145cR WC11.4 - 7 WI-6096 Chr11 - 143cR WC11.4 - ㄀कѠゴ哴㉏੠Ҏ㉏݀⫼⠽⧚೒䈅᭄᥂ᑧⱘՓ⫼ 义ⷕˈ10/18 file://E:\wcb\⫳⠽ֵᙃᄺ˄Ё䆥ᴀ˅?㄀कѠゴ哴㉏੠Ҏ㉏݀⫼⠽⧚೒䈅... 2005-1-18 Click to buy NOW! PDF-XCHANGE www.docu-track.com Click to buy NOW! PDF-XCHANGE www.docu-track.com