咐录词汇表 页码,1/ 附录1词汇表 al gori thm(算法):为完成一个特定任务而进行的一系列动作(例如,一些计算步骤) browser(浏览器):用来访问万维网的程序,超文本标识语言(HTM)使得浏览器可以在 不同的计算机平台上以相同的方式来显示一个网页。 characters and character states(特性及状态):在系统发生学中,特性指不同物种之 间的同源的特征。这些特征在某个个体上的具体表现称为状态。例如,对于“发色”,可以 有“金色”,“红色”,“黄色”等几种状态。在分子生物学中,状态可以是4种核苷酸 (A,T,C,G)之一,或20种氨基酸之一。也有一些作者将” character”定义为状态。 client(客户端):与远端计算机(服务器)交互的一台计算机或计算机上运行的软件。 descri ptor(描述符):关于一个序列或序列集的信息,它所包含的内容范围取决于其在记 录中的位置。对一个序列集定义描述符可以避免在每条记录中重复拷贝冗余的信息。 domai n name(域名):指因特网组织结构的某个层次,用来表示网络主机并对其分类。顶 级域名表示站点的类型或主机所在的国家。 dowηload(下载):将一个文件通过FTP从远端主机传到本地计算机。 e-mai(电子邮件):指在计算机上编辑并通过因特网在几秒钟之内传送到其他地方的消 息 EST( Espressed sequence tag:表达序列标签):EST是从mRNA(cDNA)上生成的大量很短 的序列(30-500b0)。它们代表了在特定组织或发育阶段表达的基因。它们代表在给定的 CDNA文库中的表达标签(有些是编码的,有些不是)。这些记录通常很少有注释,只有文库 和生物来源信息。很多数据库中都有这样的记录,包括DBJ/EMBL/ Gen Bank, dbEST, Uni gene (见第二章和第四章)。参考http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbest/可以获得更多的信息。 FAQ(常见问题) 个计算机文件,包含了一些常见的问题。确切的说,是一系列编辑好 的问题及相应的回答。这有助于新手使用计算机资源,例如邮件列表或新闻组。 feature(特性):在给定序列中的特定位置出现的注释 fi rewal丨(防火墙):将公司或组织的内部网络与公共网络隔离开,这样可以防止对私有计 算机系统的未授权访问 FTP( File transfer protocol:文件传输协议):将文件在主机之间传输的方法。 Gopher:一个文档发布系统,允许检索和显示文本文件。 GSs( Genome survey sequences:基因组综述序列):DBJ/EMBL/ GenBank中的这个部分 与EST很相似,不同之处只在于这些序列是来自于基因组,而不是cDNA(mRNA)。GSs部分包 含(但不限于)下列类型的数据:随机的基因组序列片段, cosmi d/BAC/YAC末端序列(这些 可能但并不必须与染色体有关),外显子标记的基因组序列,Au PCR序列。参考 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbgss/可以获得更多的信息。 GUl( Graphi cal uer interface:图形用户界面):指依靠图形和图标来指导用户和应用程 序进行交互的前端软件。 file://E:\wcb\生物信息学(中译本)\附录词汇表.htm 2005-1-18䰘ᔩˍ䆡∛㸼 algorithm˄ㅫ⊩˅˖Ўᅠ៤ϔϾ⡍ᅮӏࡵ㗠䖯㸠ⱘϔ㋏߫ࡼ˄԰՟བˈϔѯ䅵ㅫℹ偸˅DŽ browser˄⌣㾜఼˅˖ ⫼ᴹ䆓䯂ϛ㓈㔥ⱘ⿟ᑣˈ䍙᭛ᴀᷛ䆚䇁㿔˄HTML˅Փᕫ⌣㾜఼ৃҹ೼ ϡৠⱘ䅵ㅫᴎᑇৄϞҹⳌৠⱘᮍᓣᴹᰒ⼎ϔϾ㔥义DŽ characters and character states˄⡍ᗻঞ⢊ᗕ˅˖೼㋏㒳থ⫳ᄺЁˈ⡍ᗻᣛϡৠ⠽⾡П 䯈ⱘৠ⑤ⱘ⡍ᕕDŽ䖭ѯ⡍ᕕ೼ᶤϾϾԧϞⱘ݋ԧ㸼⦄⿄Ў⢊ᗕDŽ՟བˈᇍѢĀথ㡆āˈৃҹ ᳝Ā䞥㡆āˈĀ㑶㡆āˈĀ咘㡆āㄝ޴辵⢊ᗕDŽ೼ߚᄤ⫳⠽ᄺЁˈ⢊ᗕৃҹᰃː⾡Ḍ㣋䝌 ˄$ˈ7ˈ&ˈ*˅Пϔˈ៪ˎˌ⾡⇼෎䝌ПϔDŽг᳝ϔѯ԰㗙ᇚ“character”ᅮНЎ⢊ᗕDŽ client˄ᅶ᠋ッ˅˖Ϣ䖰ッ䅵ㅫᴎ˄᳡ࡵ˅఼ѸѦⱘϔৄ䅵ㅫᴎ៪䅵ㅫᴎϞ䖤㸠ⱘ䕃ӊDŽ descriptor˄ᦣ䗄ヺ˅˖݇ѢϔϾᑣ߫៪ᑣ߫䲚ⱘֵᙃˈᅗ᠔ࣙ৿ⱘݙᆍ㣗ೈপއѢ݊೼䆄 ᔩЁⱘԡ㕂DŽᇍϔϾᑣ߫䲚ᅮНᦣ䗄ヺৃҹ䙓ܡ↣೼ᴵ䆄ᔩЁ䞡໡ᣋ䋱ݫԭⱘֵᙃDŽ domain name˄ඳৡ˅˖ ᣛ಴⡍㔥㒘㒛㒧ᵘⱘᶤϾሖ⃵ˈ⫼ᴹ㸼⼎㔥㒰Џᴎᑊᇍ݊ߚ㉏DŽ乊 㑻ඳৡ㸼⼎キ⚍ⱘ㉏ൟ៪Џᴎ᠔೼ⱘ೑ᆊDŽ download˄ϟ䕑˅˖ᇚϔϾ᭛ӊ䗮䖛FTPҢ䖰ッЏᴎӴࠄᴀഄ䅵ㅫᴎDŽ e-mail˄⬉ᄤ䚂ӊ˅˖ ᣛ೼䅵ㅫᴎϞ㓪䕥ᑊ䗮䖛಴⡍㔥೼޴金䩳ПݙӴ䗕ࠄ݊Ҫഄᮍⱘ⍜ ᙃDŽ EST˄Espressed sequence tag˖㸼䖒ᑣ߫ᷛㅒ˅˖ ESTᰃҢmRNA˄cDNA˅Ϟ⫳៤ⱘ໻䞣ᕜⷁ ⱘᑣ߫˄300-500bp˅DŽᅗӀҷ㸼њ೼⡍ᅮ㒘㒛៪থ㚆䰊↉㸼䖒ⱘ෎಴DŽᅗӀҷ㸼೼㒭ᅮⱘ cDNA᭛ᑧЁⱘ㸼䖒ᷛㅒ˄᳝ѯᰃ㓪ⷕⱘˈ᳝ѯϡᰃ˅DŽ䖭ѯ䆄ᔩ䗮ᐌᕜᇥ᳝⊼䞞ˈা᳝᭛ᑧ ੠⫳⠽ᴹ⑤ֵᙃDŽᕜ໮᭄᥂ᑧЁ䛑᳝䖭ḋⱘ䆄ᔩˈࣙᣀDDBJ/EMBL/GenBankˈdbESTˈUnigene ˄㾕㄀Ѡゴ੠㄀ಯゴ˅DŽখ㗗http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/ ৃҹ㦋ᕫ᳈໮ⱘֵᙃDŽ FAQ˄ᐌ㾕䯂乬˅˖ ϔϾ䅵ㅫᴎ᭛ӊˈࣙ৿њϔѯᐌ㾕ⱘ䯂乬DŽ⹂ߛⱘ䇈ˈᰃϔ㋏߫㓪䕥ད ⱘ䯂乬ঞⳌᑨⱘಲㄨDŽ䖭᳝ࡽѢᮄ᠟Փ⫼䅵ㅫᴎ䌘⑤ˈ՟བ䚂ӊ߫㸼៪ᮄ䯏㒘DŽ feature˄⡍ᗻ˅˖೼㒭ᅮᑣ߫Ёⱘ⡍ᅮԡ㕂ߎ⦃ⱘ⊼䞞DŽ firewall˄䰆☿๭˅˖ᇚ݀ৌ៪㒘㒛ⱘݙ䚼㔥㒰Ϣ݀݅㔥㒰䱨⾏ᓔˈ䖭ḋৃҹ䰆ℶᇍ⾕᳝䅵 ㅫᴎ㋏㒳ⱘ᳾ᥜᴗ䆓䯂DŽ FTP˄File transfer protocol˖᭛ӊӴ䕧ण䆂˅˖ᇚ᭛ӊ೼ЏᴎП䯈Ӵ䕧ⱘᮍ⊩DŽ Gopher˖ϔϾ᭛ḷথᏗ㋏㒳ˈܕ䆌Ẕ㋶੠ᰒ⼎᭛ᴀ᭛ӊDŽ GSS˄Genome survey sequences˖෎಴㒘㓐䗄ᑣ߫˅˖ DDBJˋEMBLˋGenBankЁⱘ䖭Ͼ䚼ߚ ϢESTᕜⳌԐˈϡৠП໘া೼Ѣ䖭ѯᑣ߫ᰃᴹ㞾Ѣ෎಴㒘ˈ㗠ϡᰃcDNA˄mRNA˅DŽGSS䚼ࣙߚ ৿˄Ԛϡ䰤Ѣ˅ϟ߫㉏ൟⱘ᭄᥂˖䱣ᴎⱘ෎಴㒘ᑣ߫⠛↉ˈcosmid/BAC/YAC᳿ッᑣ߫˄䖭ѯ ৃ㛑Ԛᑊϡᖙ乏Ϣᶧ㡆ԧ᳝݇˅ˈ໪ᰒᄤᷛ䆄ⱘ෎಴㒘ᑣ߫ˈAlu PCRᑣ߫DŽখ㗗 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbGSS/ ৃҹ㦋ᕫ᳈໮ⱘֵᙃDŽ GUI˄Graphical uer interface˖೒ᔶ⫼᠋⬠䴶˅˖ᣛձ䴴೒ᔶ੠೒ᷛᴹᣛᇐ⫼᠋੠ᑨ⫼⿟ ᑣ䖯㸠ѸѦⱘࠡッ䕃ӊDŽ 䰘ᔩ䆡∛㸼 义ⷕˈ1/4 file://E:\wcb\⫳⠽ֵᙃᄺ˄Ё䆥ᴀ˅?䰘ᔩ䆡∛㸼.htm 2005-1-18 Click to buy NOW! PDF-XCHANGE www.docu-track.com Click to buy NOW! PDF-XCHANGE www.docu-track.com