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·902· 智能系统学报 第13卷 续表2 疾病名称 关联个数 LMFMDA RWRMDA CMFMDA RLSMDA Carcinoma,Squamous Cell 78 0.859687413 0.5 0.833772833 0.596178 Glioma 73 0.878932151 0.864338837 0.864829853 0.648836 Esophageal Neoplasms r 0.781536412 0.767331361 0.725580306 0.572707 Leukemia.Myeloid,Acute 6> 0.872459673 0.871399804 0.792075146 0.623066 Head and Neck Neoplasms 63 0.847238105 0.5 0.836495898 0.665183 表3新疾病在不同算法下的AUC结果 Table 3 The AUC results of new diseases on different algorithm 疾病名称 关联个数 LMFMDA RWRMDA CMFMDA RLSMDA Distal Myopathies 0.5 0.995505618 0.993258 Hypopharyngeal Neoplasms 0.5 0.811235955 1 Hepatitis C,Chronic 0.5 1 1 Adenoma 0.5 1 Aortic Aneurysm,Abdominal 0.5 / Carcinoma,Ductal,Breast 0.5 1 Colitis 0.5 0.9707865170.997753 Neuroma,Acoustic 0.5 0.146067416 1 Creutzfeldt-Jakob Syndrome 0.5 0.997752809 0.997753 Eczema 0.5 0.912359551 0.997753 Hepatitis B,Chronic 0.5 1 1 Hepatitis 0.5 1 Granulosa Cell Tumor 0.5 0.939325843 1 Graft vs Host Disease 0.5 Gerstmann-Straussler-Scheinker Disease 0.5 1 0.997753 Gastritis,Atrophic 1 0.5 0.24494382 0.997753 Encephalomyelitis,Autoimmune,Experimental 0.997752809 0.5 0.982022472 0.995506 Moyamoya Disease 0.995505618 0.5 0.970786517 0.995506 Cystic Fibrosis 0.995505618 0.5 0.013483146 0.997753 Focal Epithelial Hyperplasia 0.995505618 0.5 0.224719101 可以看到,不论是在关联数较多的疾病或关 联数极少的疾病上,LMFMDA均表现出了优异的 1.0 效果。 0.8 0.6 5讨论 02 在提出LMFMDA的损失函数前,曾试图对 0 1131517191111131151171191 每个miRNA和疾病标注一个先验关联值,作为 第+1维,也是不参与运算的常数维。即: 图5带常数维模型中k与AUC关系图 R'=MD-em-ed Fig.5 The relation diagram of k and AUC in a model with 然而其k值和AUC关联关系如图5所示。 constant dimensional可以看到,不论是在关联数较多的疾病或关 联数极少的疾病上,LMFMDA 均表现出了优异的 效果。 5 讨论 在提出 LMFMDA 的损失函数前,曾试图对 每个 miRNA 和疾病标注一个先验关联值,作为 第 k+1 维,也是不参与运算的常数维。即: R ′ = MT D−em−edT 然而其 k 值和 AUC 关联关系如图 5 所示。 表 3 新疾病在不同算法下的 AUC 结果 Table 3 The AUC results of new diseases on different algorithm 疾病名称 关联个数 LMFMDA RWRMDA CMFMDA RLSMDA Distal Myopathies 1 1 0.5 0.995 505 618 0.993 258 Hypopharyngeal Neoplasms 1 1 0.5 0.811 235 955 1 Hepatitis C, Chronic 1 1 0.5 1 1 Adenoma 1 1 0.5 1 1 Aortic Aneurysm, Abdominal 1 1 0.5 1 1 Carcinoma, Ductal, Breast 1 1 0.5 1 1 Colitis 1 1 0.5 0.970 786 517 0.997 753 Neuroma, Acoustic 1 1 0.5 0.146 067 416 1 Creutzfeldt-Jakob Syndrome 1 1 0.5 0.997 752 809 0.997 753 Eczema 1 1 0.5 0.912 359 551 0.997 753 Hepatitis B, Chronic 1 1 0.5 1 1 Hepatitis 1 1 0.5 1 1 Granulosa Cell Tumor 1 1 0.5 0.939 325 843 1 Graft vs Host Disease 1 1 0.5 1 1 Gerstmann-Straussler-Scheinker Disease 1 1 0.5 1 0.997 753 Gastritis, Atrophic 1 1 0.5 0.244 943 82 0.997 753 Encephalomyelitis, Autoimmune, Experimental 1 0.997752809 0.5 0.982 022 472 0.995 506 Moyamoya Disease 1 0.995505618 0.5 0.970 786 517 0.995 506 Cystic Fibrosis 1 0.995505618 0.5 0.013 483 146 0.997 753 Focal Epithelial Hyperplasia 1 0.995505618 0.5 0.224 719 101 1 0.8 1.0 0.6 0.4 0.2 0 AUC 11 31 51 71 91 111 131 151 171 191 k 图 5 带常数维模型中 k 与 AUC 关系图 Fig. 5 The relation diagram of k and AUC in a model with constant dimensional 续表 2 疾病名称 关联个数 LMFMDA RWRMDA CMFMDA RLSMDA Carcinoma, Squamous Cell 78 0.859 687413 0.5 0.833 772 833 0.596 178 Glioma 73 0.878 932 151 0.864 338 837 0.864 829 853 0.648 836 Esophageal Neoplasms 68 0.781 536 412 0.767 331 361 0.725 580 306 0.572 707 Leukemia, Myeloid, Acute 67 0.872 459 673 0.871 399 804 0.792 075 146 0.623 066 Head and Neck Neoplasms 63 0.847 238 105 0.5 0.836 495 898 0.665 183 ·902· 智 能 系 统 学 报 第 13 卷
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