导言 该手册是关于R的一个入门教材.由于主要针对初学者，我将重点放在了 对R的工作原理的解释上。R涉及广泛，因此对于初学者来讲，了解和掌握一 些基本概念及原理是很有必要的。在打下扎实的基础后，进行更深入的学习 将会变得轻松许多。本着深入浅出的宗旨，本手册将大量配合图表等形式， 尽可能使用通俗的语言，使读者容易理解而并不失细节。 R是一个有着统计分析功能及强大作图功能的软件系统，是由Ross Ihaka 和Robert Gentlemanl共同创立。R语言可以看作是由AT&T贝尔实验室所 创的$语言发展出的一种方言1。因此，R即是一种软件也可以说是一种语 言。S语言现在主要内含在由Insightful公司经营的S-PLUS软件中。R和S在 设计理念上存在有着许多不同：关于这方面的详细内容大家可以参考haka& Gentleman(1996)或R-FAQ3,该文档同时随R一起发布。 R是在GNU协议General Public Licence4下免费发行的，它的开发及维护 现在则由R开发核心小组R Development Core Team.具体负责。 R的安装文件有多种形式，有在Uniⅸ或Linux系统下所需的一些源代 码（主要用C及Fortran编写），及在Windows,Linux及Macintosh上使用的预编 译二进制码。这些安装文件以及安装说明都可以在Comprehensive R Archive Network(CRAN)5网站上下载。该网站提供的关于Linux的安装文件只适用 于较新版本的Linux。详情请参考CRAN网站。 R内含了许多实用的统计分析及作图函数。作图函数能将产生的图片展 示在一个独立的窗口中，并能将之保存为各种形式的文件(jPg,png,bmp,ps, pdf,emf,pictex,xfig;具体形式取决于操作系统)。统计分析的结果也能被直 接显示出来，一些中间结果（如P值，回归系数，残差等）既可保存到专门的 文件中，也可以直接用作进一步的分析。 在R语言中，使用者可以使用循环语句来连续分析多个数据集，也可将多 个不同的统计函数结合在一个语句中执行更复杂的分析。R使用者还可以借鉴 网上提供的用S编写的大量程序6，而且大多数都能被R直接调用。 非专业人员起初可能觉得R相对比较复杂。其实，R的一个非常突出的优 点正是它的灵活性。一般的软件往往会直接展示分析的结果，而R则将这些结 果都存在一个对象“object”里面，所以常常在分析执行结束后并不显示任何结 Thaka R.Gentleman R.1996.R:a language for data analysis and graphics.Journal of Computational and Graphical Statistics 5:299-314. 2 http://www.insightful.com/products/splus/default.asp 3http://cran.r-project.org/doc/FAQ/R-FAQ.html 4For more information:http://www.gnu.org/ 5http://cran.r-project.org/ For example:http://stat.cmu.edu/S/1 导言 该手册是关于R的一个入门教材.由于主要针对初学者，我将重点放在了 对R的工作原理的解释上。R涉及广泛，因此对于初学者来讲，了解和掌握一 些基本概念及原理是很有必要的。在打下扎实的基础后，进行更深入的学习 将会变得轻松许多。本着深入浅出的宗旨，本手册将大量配合图表等形式， 尽可能使用通俗的语言，使读者容易理解而并不失细节。 R是一个有着统计分析功能及强大作图功能的软件系统，是由Ross Ihaka 和Robert Gentleman1共同创立。R语言可以看作是由AT&T贝尔实验室所 创的S语言发展出的一种方言1。因此，R即是一种软件也可以说是一种语 言。S语言现在主要内含在由Insightful2公司经营的S-PLUS软件中。R和S在 设计理念上存在有着许多不同：关于这方面的详细内容大家可以参考Ihaka & Gentleman (1996) 或R-FAQ3，该文档同时随R一起发布。 R是在GNU协议General Public Licence4下免费发行的，它的开发及维护 现在则由R开发核心小组R Development Core Team具体负责。 R的安装文件有多种形式，有在Unix 或Linux系统下所需的一些源代 码(主要用C及Fortran 编写)，及在Windows, Linux及Macintosh上使用的预编 译二进制码。这些安装文件以及安装说明都可以在Comprehensive R Archive Network (CRAN)5 网站上下载。该网站提供的关于Linux的安装文件只适用 于较新版本的Linux。详情请参考CRAN网站。 R内含了许多实用的统计分析及作图函数。作图函数能将产生的图片展 示在一个独立的窗口中，并能将之保存为各种形式的文件(jpg, png, bmp, ps, pdf, emf, pictex, xfig; 具体形式取决于操作系统)。统计分析的结果也能被直 接显示出来，一些中间结果(如P-值，回归系数，残差等)既可保存到专门的 文件中，也可以直接用作进一步的分析。 在R语言中，使用者可以使用循环语句来连续分析多个数据集，也可将多 个不同的统计函数结合在一个语句中执行更复杂的分析。R使用者还可以借鉴 网上提供的用S编写的大量程序6 ,而且大多数都能被R直接调用。 非专业人员起初可能觉得R相对比较复杂。其实，R的一个非常突出的优 点正是它的灵活性。一般的软件往往会直接展示分析的结果，而R则将这些结 果都存在一个对象“object”里面，所以常常在分析执行结束后并不显示任何结 1 Ihaka R. & Gentleman R. 1996. R: a language for data analysis and graphics. Journal of Computational and Graphical Statistics 5: 299–314. 2 http://www.insightful.com/products/splus/default.asp 3http://cran.r-project.org/doc/FAQ/R-FAQ.html 4For more information: http://www.gnu.org/ 5http://cran.r-project.org/ 6For example: http://stat.cmu.edu/S/ 1