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第1列和第2列,即Z(i,1:2)包含了被两两连接生成一个新类的所有对象的索引。生 成的新类索引为m+j。共有m-1个级别更高的类,它们对应于聚类树中的内部节点。 第三列,Z(i,3)包含了相应的在类中的两两对象间的连接距离。 3) cluster T= cluster(Z, cutoff)从连接输出( linkage)中创建聚类。 cutoff为定义 cluster 函数如何生成聚类的阈值,其不同的值含义如表4所示。 表4 cutoff取值及含义 cutoff.取值 含义 utofff为不一致系数的阈值。不一致系数对聚类树中对象间的差 异进行了量化。如果一个连接的不一致系数大于阙值,则 cluster 函数将其作为聚类分组的边界。 2=cutoff cutoff作为包含在聚类树中的最大分类数 T= cluster(Z, cutoff, depth,flag)从连接输出( linkage)中创建聚类。参数 depth 指定了聚类数中的层数,进行不一致系数计算时要用到。不一致系数将聚类树中两对象 的连接与相邻的连接进行比较。详细说明见函数 inconsistent。当参数 depth被指定时 cutoff通常作为不一致系数阈值。 参数f1ag重载参数 cutoff的缺省含义。如flag为’ inconsistent’,则 cutoff作为 不一致系数的阈值。如f1ag为’ cluster’,则 cutoff作为分类的最大数目。 输出T为大小为m的向量,它用数字对每个对象所属的类进行标识。为了找到包含 在类i中的来自原始数据集的对象,可用find(T==i) 4) sore(X 对数据矩阵进行标准化处理,处理方式为 其中矩阵X=(xn)mxn看作是m个大小为n的向量,xS是每一列的均值和标准差。 5)H=dendrogram(Z, P) 由 linkage产生的数据矩阵Z画聚类树状图。P是结点数,默认值是30 6)T=clusterdata(, cutoff) 将矩阵X的数据分类。X为m×n矩阵,被看作m个大小为n的向量。它与以下几个 命令等价: Y= pdist(X,’ euclid') kage(Y,’ single’) T=cluster (Z, cutoff) 将 pdist的输出转换为方阵。-451- 第1列和第2列,即Z(i,1:2)包含了被两两连接生成一个新类的所有对象的索引。生 成的新类索引为 m + j 。共有 m −1个级别更高的类,它们对应于聚类树中的内部节点。 第三列,Z(i,3)包含了相应的在类中的两两对象间的连接距离。 3)cluster T=cluster(Z,cutoff)从连接输出(linkage)中创建聚类。cutoff为定义cluster 函数如何生成聚类的阈值,其不同的值含义如表4所示。 表4 cutoff取值及含义 cutoff取值 含 义 0<cutoff<2 cutoff作为不一致系数的阈值。不一致系数对聚类树中对象间的差 异进行了量化。如果一个连接的不一致系数大于阈值,则cluster 函数将其作为聚类分组的边界。 2<=cutoff cutoff作为包含在聚类树中的最大分类数 T=cluster(Z,cutoff,depth,flag)从连接输出(linkage)中创建聚类。参数depth 指定了聚类数中的层数,进行不一致系数计算时要用到。不一致系数将聚类树中两对象 的连接与相邻的连接进行比较。详细说明见函数inconsistent。当参数depth被指定时, cutoff通常作为不一致系数阈值。 参数flag重载参数cutoff的缺省含义。如flag为’inconsistent’,则cutoff作为 不一致系数的阈值。如flag为’cluster’,则cutoff作为分类的最大数目。 输出T为大小为 m 的向量,它用数字对每个对象所属的类进行标识。为了找到包含 在类i中的来自原始数据集的对象,可用find(T==i)。 4)zsore(X) 对数据矩阵进行标准化处理,处理方式为 j ij j ij s x x x − = ~ 其中矩阵 ij m n X x = × ( ) 看作是 m 个大小为n 的向量, j j x ,s 是每一列的均值和标准差。 5)H=dendrogram(Z,P) 由linkage产生的数据矩阵Z画聚类树状图。P是结点数,默认值是30。 6)T=clusterdata(X,cutoff) 将矩阵X的数据分类。X为 m× n 矩阵,被看作 m 个大小为n 的向量。它与以下几个 命令等价: Y=pdist(X,’euclid’) Z=linkage(Y,’single’) T=cluster(Z,cutoff) 7)squareform 将pdist的输出转换为方阵
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