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BLAST Search The sequence search is performed using either BLASTP or BLASTX(from the WU-BLAST package), depending on the type of the input 2.用序列检索GO数据库 BLAST Query 对于未知基因名的序列,可 以用序列直接检索GO数据库 Enter a UniProt accession or upload a text file of quenes or paste in FASTA sequence(s) Uni Prot accession:□ 点击AmGO首页上方的 Text file(maximum file size 500K) [览 BLAST。 FASTA sequence(s) Sequences should be separated with an empty line 界面风格类似于其他数据库 BLAST搜索的网页,在检索 框中铁如氨基酸或核酸序列, 网页能自动识别并相应地做 LAIACIGGGAGIGGA BLASTP或 BLASTX和数据库 IATI521I3CA5SIIAATAAAACAGEGEGGEGCO 中的序列比对。 这里以检索RPIA基因的序列 Maximum number of sequences: 100 Maximum total length of sequence: 3,000,000 residues 为例,如图所示。 提交查询内容 BLAST settings日 Expect threshold 01 v Maximum number of alignments 50 v BLAST flter: on C off 查内音2. 用序列检索GO数据库 ◼ 对于未知基因名的序列,可 以用序列直接检索GO 数据库。 点 击 AmiGO 首页上方的 “BLAST”。 ◼ 界面风格类似于其他数据库 BLAST搜索的网页,在检索 框中铁如氨基酸或核酸序列, 网页能自动识别并相应地做 BLASTP或BLASTX和数据库 中的序列比对。 ◼ 这里以检索RPIA基因的序列 为例,如图所示
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