第八章系统发育分析 系统发生(或种系发生、系统发育, phylogeny)是指生物形成或进化的历史。系统发 生学( phylogenetics研究物种之间的进化关系,其基本思想是比较物种的特征,并认为特征 相似的物种在遗传学上接近。系统发生研究的结果往往以系统发生树( phylogenetic tree)表 示,用它描述物种之间的进化关系。通过对生物学数据的建模提取特征,进而比较这些特征, 研究生物形成或进化的历史。在分子水平上进行系统发生分析具有许多优势,所得到的结果 更加科学、可靠。分子系统发生分析主要分成三个步骤:分子序列或特征数据的分析、系统 发生树的构造以及结果的检验。 TREERO Other Vertebra te Click on the binomial O Homo sapiens(human) O Bos taurus(cow) B AnopHeles gambiae (mosquito) sfaB∥aris(doq) e Saccharomyces cereris/ae(bakers yeast) 0Magn动p0 rthe grisea Plants s Arabidopsis thaliana(thale baHey) B Oryza sativa (rice)第八章 系统发育分析 系统发生（或种系发生、系统发育，phylogeny）是指生物形成或进化的历史。系统发 生学(phylogenetics)研究物种之间的进化关系，其基本思想是比较物种的特征，并认为特征 相似的物种在遗传学上接近。系统发生研究的结果往往以系统发生树（phylogenetic tree）表 示，用它描述物种之间的进化关系。通过对生物学数据的建模提取特征，进而比较这些特征， 研究生物形成或进化的历史。在分子水平上进行系统发生分析具有许多优势，所得到的结果 更加科学、可靠。分子系统发生分析主要分成三个步骤：分子序列或特征数据的分析、系统 发生树的构造以及结果的检验