Phase 2: Seeding 门对查询序列作如下处理 鲁给定单词(word)长度γ(一般蛋白质为3 核酸为11)和打分矩阵,将长度为n的查询序 列从第一位到最后一位拿到n-1+1个单词 ●创建一个单词列表,其中的单词为经与上述 单词比对打分后分数高于T的长度为ν的单词。 ●单词表中的单词称为种子(seed) Genomics and Bioinformatics 2015. TMMLGenomics and Bioinformatics 2015, TMMU Phase 2:Seeding 对查询序列作如下处理: 给定单词(word)长度w(一般蛋白质为3, 核酸为11)和打分矩阵,将长度为n的查询序 列从第一位到最后一位拿到n-w+1个单词 创建一个单词列表,其中的单词为经与上述 单词比对打分后分数高于T的长度为w的单词。 单词表中的单词称为种子(seed)