锥虫属Trypanosoma 双滴目Diplomonadida 双滴亚目Diplomonadina 六鞭科Hexamitidae 贾第属Giardia 毛滴目Trichomonadida 毛商虫属Trichomonas 三毛滴虫属Tritrichomonas 根鞭毛目Rhizomastigida 鞭毛阿米巴科Mastigamoebida 组织滴虫属Histomonas 阿米巴目Amoebida 管足亚目Tubulinorina 肉足总纲Sarcodina 根足纲Rhizopodae 内阿米巴科Endamoebidae 肠阿米巴属Entamoeba 内蜒属Endolimax 复顶亚门Apicomplexa(Apicocomplexa) 孢子虫纲Sporozoa 球虫亚纲Coccidia 真球虫目Eucoccidia 艾美耳亚目Eimeriina 艾美耳科Eimeriidae 艾美耳属Eimeria 等孢子属Isospora 泰泽属Tyzzeria 温扬属Wenyonella 隐孢科Cryptosporididae 隐孢属Cryptosporidium 兰卡科Lankesterellidae 兰卡属L,ankesterella 肉孢子虫科Sarcocystidae 肉孢子虫属Sarcocystis 贝诺孢子虫属Besnoitia 弓形虫科Toxoplasmatidae 弓形虫属Toxoplasma 血孢子虫亚目Haemosporina 疟原虫科Plasmodiidae 疟原虫属P1 asmodium 住白细胞虫科Leucocytozoidae 住白细胞虫属Leucocytozoon锥虫属Trypanosoma         双滴目Diplomonadida           双滴亚目Diplomonadina             六鞭科Hexamitidae               贾第属Giardia         毛滴目Trichomonadida           毛滴虫科Trichomonadidae             毛滴虫属Trichomonas             三毛滴虫属Tritrichomonas         根鞭毛目Rhizomastigida           鞭毛阿米巴科Mastigamoebidae             组织滴虫属Histomonas           阿米巴目Amoebida             管足亚目Tubulinorina       肉足总纲Sarcodina        根足纲Rhizopodae               内阿米巴科Endamoebidae                 肠阿米巴属Entamoeba 内蜒属Endolimax 复顶亚门Apicomplexa（Apicocomplexa）     孢子虫纲Sporozoa       球虫亚纲Coccidia         真球虫目Eucoccidia           艾美耳亚目Eimeriina             艾美耳科Eimeriidae               艾美耳属Eimeria               等孢子属Isospora 泰泽属Tyzzeria               温扬属Wenyonella             隐孢科Cryptosporididae               隐孢属Cryptosporidium             兰卡科Lankesterellidae               兰卡属Lankesterella             肉孢子虫科Sarcocystidae               肉孢子虫属Sarcocystis               贝诺孢子虫属Besnoitia             弓形虫科Toxoplasmatidae               弓形虫属Toxoplasma           血孢子虫亚目Haemosporina             疟原虫科Plasmodiidae               疟原虫属Plasmodium             住白细胞虫科Leucocytozoidae               住白细胞虫属Leucocytozoon