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二、生物信息学中的XML格式 000八 可扩展标记语言XML(extensible markup language)是一种在文本文件中 组织数据的语言。万维网联盟(http:/www.w3c.com/)已经定义并建议 将XML作为一个通用的独立平台结构化文件。在过去的10年中,ML已 经成为在计算机系统与应用程序之间交换数据的首选语言。 一个ML文件代表一个嵌套的信息树。树中的每一个节点能包含像一串 子节点或者一些属性这样的数据,并且一个XML文件始于根节点。一个 ML文件有一个文本,在文本中每一个节点的内容及其子节点被一对相 互封闭的标签划定。 。) ML作为一种数据格式被广泛地用于生物信息学中。越来越多的生物数 据库已经不再是仅仅把XML格式的数据作为备选数据格式与Flat File格式 平行提供给用户,而是彻底基于ML文件构建数据库管理系统并使用 ML的查询语言Query/XPath进行各种应用程序的编写。 如LRRML等数据库。 16二、生物信息学中的XML 格式 16 • 可扩展标记语言XML(extensible markup language)是一种在文本文件中 组织数据的语言。万维网联盟(http://www.w3c.com/)已经定义并建议 将XML 作为一个通用的独立平台结构化文件。在过去的10 年中,XML 已 经成为在计算机系统与应用程序之间交换数据的首选语言。 • 一个XML 文件代表一个嵌套的信息树。树中的每一个节点能包含像一串 子节点或者一些属性这样的数据,并且一个XML 文件始于根节点。一个 XML 文件有一个文本,在文本中每一个节点的内容及其子节点被一对相 互封闭的标签划定。 • XML 作为一种数据格式被广泛地用于生物信息学中。越来越多的生物数 据库已经不再是仅仅把XML 格式的数据作为备选数据格式与Flat File 格式 平行提供给用户,而是彻底基于XML 文件构建数据库管理系统并使用 XML 的查询语言XQuery/XPath 进行各种应用程序的编写。 • 如LRRML 等数据库
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