第二章生物信息学中的计算机技术 2.1本章简介 本章介绍因特网( Internet)和万维网( World wide Web,简称wwW),介绍世界各国 生物信息中心和服务机构。因特网的诞生,国际生物信息中心的建立,大大推动了生物信息 学革命。基于因特网的浏览器的出现,为生物信息资源的开发和应用提供了有效途径。本章 将简单介绍浏览器和通过浏览器进行数据库查询的方法,并给出一些重要生物信息中心的网 22什么是因特网 网是一个全球性的计算机网络,连接着政府机构、科研院校以及公司企业。因特网 通过通信协议传递信息,即传输控制协议网际协议( Transmission Control protocol/internet Protocol,简称TCPP)。这一协议使不同类型的计算机能以一个共同的方式进行数据交流。 网络中的一台计算机称作一个节点,节点和节点之间通过传输数据包( packets)进行 通信。与传统的电话、传真等通讯方式不同,数据包可能并不直接从一台计算机传到另一台 计算机,而是通过路由器经若干节点到达最后的目标计算机。网络协议用来控制和协调数据 的有效传输。数据包传输过程中,如果该通路上的某个节点出了故障,则可绕过该节点而通 过别的路径传输。 23什么是IP地址 如同每台电话机有一个电话号码一样,因特网上的每一台计算机都有一个“号码”,即 IP地址。IP地址是一个由四个字段组成的数字串,中间用小数点分隔。每个字段的数字值 在0-255之间,如202.112.7.13就是一个IP地址。 使用IP地址便于计算机之间的互相识别,但却不便记忆,也容易搞错。为此,TCPP 协议制定了域名( domain name)系统。域名系统由若干字段组成,每个字段通常由字母和 数字组成(包括连字符“-”和下划线“”)。其顺序依次是:计算机名、计算机所处位置 域名或子域名。例如,上述PP地址202.11279的域名为:www.cbipku.edu.cn。其含义为, 北京大学生物生物信息中心( Centre of Bioinformatics, Peking University,PkU)的web服 务器www.cbi,,连接在北京大学校园网pku,属“中国教育和科研计算机网络”"Chinaeducation and Research Network,简称 CERnet)一部分,域名为 edu.cn.。表2.1列举了一些因特网域 名和子域名 袅21A部分国家因特网域名一览表 国家 域名国家 Country 域名 澳大利亚 中国 丹麦 Denmark dk芬兰 Finland 法国 france 德国 希腊 gr匈牙利 Hungary 爱尔兰 Ireland 以色列 Israel 意大利 日本 Jp 荷兰 Netherlands nl新西兰 New zealand 波兰 Poland pl葡萄牙 pt 南非 South africa za西班牙 瑞典 Sweden 瑞士 Switzerland 英国 United Kingdom 美国 USA第二章 生物信息学中的计算机技术 2. 1 本章简介 本章介绍因特网（Internet）和万维网（World Wide Web，简称 WWW），介绍世界各国 生物信息中心和服务机构。因特网的诞生，国际生物信息中心的建立，大大推动了生物信息 学革命。基于因特网的浏览器的出现，为生物信息资源的开发和应用提供了有效途径。本章 将简单介绍浏览器和通过浏览器进行数据库查询的方法，并给出一些重要生物信息中心的网 址。 2.2 什么是因特网 因特网是一个全球性的计算机网络，连接着政府机构、科研院校以及公司企业。因特网 通过通信协议传递信息，即传输控制协议/网际协议（Transmission Control Protocol/Internet Protocol，简称 TCP/IP）。这一协议使不同类型的计算机能以一个共同的方式进行数据交流。 网络中的一台计算机称作一个节点，节点和节点之间通过传输数据包（packets）进行 通信。与传统的电话、传真等通讯方式不同，数据包可能并不直接从一台计算机传到另一台 计算机，而是通过路由器经若干节点到达最后的目标计算机。网络协议用来控制和协调数据 的有效传输。数据包传输过程中，如果该通路上的某个节点出了故障，则可绕过该节点而通 过别的路径传输。 2.3 什么是 IP 地址 如同每台电话机有一个电话号码一样，因特网上的每一台计算机都有一个“号码”，即 IP 地址。IP 地址是一个由四个字段组成的数字串，中间用小数点分隔。每个字段的数字值 在 0~255 之间，如 202.112.7.13 就是一个 IP 地址。 使用 IP 地址便于计算机之间的互相识别，但却不便记忆，也容易搞错。为此，TCP/IP 协议制定了域名（domain name）系统。域名系统由若干字段组成，每个字段通常由字母和 数字组成（包括连字符“-”和下划线“_”）。其顺序依次是：计算机名、计算机所处位置、 域名或子域名。例如，上述 IP 地址 202.112.7.9 的域名为：www.cbi.pku.edu.cn。其含义为， 北京大学生物生物信息中心（Centre of Bioinformatics, Peking University，PKU）的 Web 服 务器www.cbi，连接在北京大学校园网pku，属“中国教育和科研计算机网络”（China Education and Research Network，简称 CERnet）一部分，域名为 edu.cn。表 2.1 列举了一些因特网域 名和子域名。 表 2.1A 部分国家因特网域名一览表 国家 Country 域名 国家 Country 域名 澳大利亚 Australia au 中国 China cn 丹麦 Denmark dk 芬兰 Finland fi 法国 France fr 德国 Germany de 希腊 Greece gr 匈牙利 Hungary hu 爱尔兰 Ireland ie 以色列 Israel il 意大利 Italy it 日本 Japan jp 荷兰 Netherlands nl 新西兰 New Zealand nz 波兰 Poland pl 葡萄牙 Portugal pt 南非 South Africa za 西班牙 Spain es 瑞典 Sweden se 瑞士 Switzerland ch 英国 United Kingdom uk 美国 USA us