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个记录之间的交叉引用通过并、交、非等逻辑操作进行快速查询。SRS的另一个特点是允许 用户将自己的数据库整合到该系统中,并与其它数据库之间实现链接。 2.9 NCBI 以上介绍了欧洲分子生物信息学和计算生物学中心。在生物信息学领域中,美国国家生 物技术信息中心( National Center for Biotechnology Information,简称NCBI)具有特殊的地 位。NCBⅠ创建于1988年,隶属于美国华盛顿北郊马里兰州的 Bethesda美国国家健康研究 院( National Institutes of health,简称NIH的美国国家医学图书馆( National Library of Medicine,简称NLM)。NCBl在维护生物医学数据库和开发计算生物学软件方面做出了特 殊贡献。 NCBI的主要任务是应用最新的信息技术,从分子水平上研究与疾病相关的基因,搞清 健康与疾病的分子机理。具体来说,包括创建自动的信息存储和分析系统,开发先进的生物 信息处理方法,编写方便实用的数据库查询和分析软件,协调世界范围的生物信息资源。 1992年起,核酸序列数据库 Gen Bank转由NCBI维护。从科技文献或其它渠道获取有 关资料,对 Gen Bank进行注释,并将这些数据与国际核酸数据库EMBL和DDBJ进行交换 是NCBI的主要任务之 2.9.1 Entrez NCBⅠ开发了 Entrez数据库查询系统,用于对 Gen Bank等分子生物学数据库以及生物 医学文献摘要( Medline)等数据库的查询( Schuler等,1996)。 Entrez采取自动列出相关记 录的方法,实现同一数据库中不同条目或不同数据库之间的链接。当用户以关键词查找某个 条目时,可以从查询结果所列出的条目中找到与其相关的其它条目,包括文献摘要、基因组 和染色体图谱、核酸和蛋白质序列数据库、蛋白质结构数据库等,使用十分方便。与SRS 不同, Entrez是一个封闭的数据库系统,无法由用户添加自己的数据库 SRS和 Entrez等查询系统为生物信息资源的利用提供了极为有效的工具。它们把各种 类型的数据库集成在一起,通过统一的界面和查询方法,利用计算机网络,实现了信息共享 2.10网络导游 近年来,随着计算机网络的迅速普及,商业、文化、娱乐等网络用户的数量激增,尽管 网络传输通道不断加宽,网络传输速度却在下降。开发网络导游工具,以便更加有效地利用 网络资源,是解决以上问题的途径之一。 网络导游是一个非常便利的工具,可以从世界任何一个地方对信息进行搜索。可以提供 的信息类型是无穷无尽的,从商业领域,当前事件,教育,娱乐,金融,购物,运动到旅游 等方面。通过不同的搜索引擎和带有超链接的地图等就可以实现对全球各个角落的浏览和访 虚拟旅游者( The Virtual Tourist)站点提供了网络导游工具,通过这些工具可以获得世 界上各国WWW服务器的导游图。点击导游图上的相关链接,可以得到世界各国和这些国 家主要城市的相关信息。例如,要想找到位于澳大利亚的国家基因组信息中心,只要点击世 界地图上的澳大利亚,就可以调出澳大利亚和太平洋地区的地图,点击图中澳洲大陆的位置, 即可调出澳大利亚地图。点击图中的城市悉尼,即可进入悉尼市,找到有关大学目录,点击 悉尼大学,就会找到澳大利亚国家基因组信息中心( ANGIS),即澳大利亚的 EMBnet国家 节点 如此便利的浏览工具使许多团体和个人被吸引到网络上来,他们迎接着信息和网络时代 的到来。但是,随之也出现了两个问题:(i)随着上网浏览人数的增加,特别在网络使用的 高峰期,网络传输速度显著减慢,有时甚至无法正常浏览网页;(ⅱ)此外,网络上带有不 健康色彩的信息,使未成年的学生在享受网络所带来的便利的同时,也受到一定程度的危害 直到现在,网络管理尚无健全的法规。但这种情况不会持续太久,我们最终会看到相关 法规的出台。由于网络用户的增加,必须尽快建立这样的法规。同时,网络的使用和管理 既需要政府部门的参与,也需要网络用户的支持个记录之间的交叉引用通过并、交、非等逻辑操作进行快速查询。SRS 的另一个特点是允许 用户将自己的数据库整合到该系统中,并与其它数据库之间实现链接。 2.9 NCBI 以上介绍了欧洲分子生物信息学和计算生物学中心。在生物信息学领域中,美国国家生 物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,简称 NCBI)具有特殊的地 位。NCBI 创建于 1988 年,隶属于美国华盛顿北郊马里兰州的 Bethesda 美国国家健康研究 院(National Institutes of Health,简称 NIH)的美国国家医学图书馆(National Library of Medicine,简称 NLM)。NCBI 在维护生物医学数据库和开发计算生物学软件方面做出了特 殊贡献。 NCBI 的主要任务是应用最新的信息技术,从分子水平上研究与疾病相关的基因,搞清 健康与疾病的分子机理。具体来说,包括创建自动的信息存储和分析系统,开发先进的生物 信息处理方法,编写方便实用的数据库查询和分析软件,协调世界范围的生物信息资源。 1992 年起,核酸序列数据库 GenBank 转由 NCBI 维护。从科技文献或其它渠道获取有 关资料,对 GenBank 进行注释,并将这些数据与国际核酸数据库 EMBL 和 DDBJ 进行交换, 是 NCBI 的主要任务之一。 2.9.1 Entrez NCBI 开发了 Entrez 数据库查询系统,用于对 GenBank 等分子生物学数据库以及生物 医学文献摘要(Medline)等数据库的查询(Schuler 等,1996)。Entrez 采取自动列出相关记 录的方法,实现同一数据库中不同条目或不同数据库之间的链接。当用户以关键词查找某个 条目时,可以从查询结果所列出的条目中找到与其相关的其它条目,包括文献摘要、基因组 和染色体图谱、核酸和蛋白质序列数据库、蛋白质结构数据库等,使用十分方便。与 SRS 不同,Entrez 是一个封闭的数据库系统,无法由用户添加自己的数据库。 SRS 和 Entrez 等查询系统为生物信息资源的利用提供了极为有效的工具。它们把各种 类型的数据库集成在一起,通过统一的界面和查询方法,利用计算机网络,实现了信息共享。 2.10 网络导游 近年来,随着计算机网络的迅速普及,商业、文化、娱乐等网络用户的数量激增,尽管 网络传输通道不断加宽,网络传输速度却在下降。开发网络导游工具,以便更加有效地利用 网络资源,是解决以上问题的途径之一。 网络导游是一个非常便利的工具,可以从世界任何一个地方对信息进行搜索。可以提供 的信息类型是无穷无尽的,从商业领域,当前事件,教育,娱乐,金融,购物,运动到旅游 等方面。通过不同的搜索引擎和带有超链接的地图等就可以实现对全球各个角落的浏览和访 问。 虚拟旅游者(The Virtual Tourist)站点提供了网络导游工具,通过这些工具可以获得世 界上各国 WWW 服务器的导游图。点击导游图上的相关链接,可以得到世界各国和这些国 家主要城市的相关信息。例如,要想找到位于澳大利亚的国家基因组信息中心,只要点击世 界地图上的澳大利亚,就可以调出澳大利亚和太平洋地区的地图,点击图中澳洲大陆的位置, 即可调出澳大利亚地图。点击图中的城市悉尼,即可进入悉尼市,找到有关大学目录,点击 悉尼大学,就会找到澳大利亚国家基因组信息中心(ANGIS),即澳大利亚的 EMBnet 国家 节点。 如此便利的浏览工具使许多团体和个人被吸引到网络上来,他们迎接着信息和网络时代 的到来。但是,随之也出现了两个问题:(i)随着上网浏览人数的增加,特别在网络使用的 高峰期,网络传输速度显著减慢,有时甚至无法正常浏览网页;(ii)此外,网络上带有不 健康色彩的信息,使未成年的学生在享受网络所带来的便利的同时,也受到一定程度的危害。 直到现在,网络管理尚无健全的法规。但这种情况不会持续太久,我们最终会看到相关 法规的出台。由于网络用户的增加,必须尽快建立这样的法规。同时,网络的使用和管理, 既需要政府部门的参与,也需要网络用户的支持
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