Istituto di Genomica Applicata, Parco Scientifico e Tecnologico di Udine, Via Linussio 51, 33100 Udine, Italy Dipartimento di Matematica ed Informatica, Universita degli Studi di Udine, via delle Scienze 208 33100 Udine, Italy. URGV, UMR INRA 1165, CNRS-Universite d' Evry genomique Vegetale, 2 rue Gaston Cremieux BP5708, 91057 Evry cedex, France Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali, Universita degli Studi di Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy CRIBL, Universita degli Studi di Padova, viale G. Colombo 3, 35 121 Padova, Italy URGI, URI164 Genomique Info, 523, Place des Terrasses, 91034 Evry Cedex, France UMR INRA 1131, Universite de Strasbourg Sante de la Vigne et Qualite du Vin, 28 rue de Herrlisheim. BP20507. 68021 Colmar france Dipartimento di Scienze biomolecolari e Biotecnologie, Universita degli Studi di milano, via Celoria 26, 20133 Milano, Italy Dipartimento di biochimica e Biologia Molecolare, Universita degli Studi di bari, via Orabona 4 70125 Bari, Italy Istituto Tecnologie Biomediche, Consiglio Nazionale delle ricerche, via Amendola 122/D, 70125 UMR INRA 1097, IRD-Montpellier SupAgro-Univ Montpellier Il, Diversite et Adaptation des Plantes Cultivees, 2 Place Pierre Viala, 34060 Montpellier Cedex 1, France UMR INRA 1098, IRD-Montpellier SupAgro-CIRAD, Developpement et Amelioration des Plantes, 2 Place Pierre Viala, 34060 Montpellier Cedex 1, france Dipartimento Scientifico e Tecnologico, Universita degli Studi di verona Strada Le grazie 15 Ca' Vignal, 37134 Verona, Italy Dipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino, Universita degli Studi di Verona, via della Pieve, 70 37029S. Floriano (VR), Italy VIGNA-CRA Initiative; Consorzio Interuniversitario Nazionale per la Biologia Molecolare delle Piante, c/o Universita degli Studi di Siena, via Banchi di sotto 55, 53100 Siena, Italy A list of participants and their affiliations appears at the end of the paper These authors contributed equally to this workIstituto di Genomica Applicata, Parco Scientifico e Tecnologico di Udine, Via Linussio 51, 33100 Udine, Italy. Dipartimento di Matematica ed Informatica, Università degli Studi di Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy. URGV, UMR INRA 1165, CNRS-Université d'Evry Genomique Végétale, 2 rue Gaston Crémieux, BP5708, 91057 Evry cedex, France. Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali, Università degli Studi di Udine, via delle Scienze 208, 33100 Udine, Italy. CRIBI, Università degli Studi di Padova, viale G. Colombo 3, 35121 Padova, Italy. URGI, UR1164 Génomique Info, 523, Place des Terrasses, 91034 Evry Cedex, France. UMR INRA 1131, Université de Strasbourg, Santé de la Vigne et Qualité du Vin, 28 rue de Herrlisheim, BP20507, 68021 Colmar, France. Dipartimento di Scienze Biomolecolari e Biotecnologie, Università degli Studi di Milano, via Celoria 26, 20133 Milano, Italy. Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare, Università degli Studi di Bari, via Orabona 4, 70125 Bari, Italy. Istituto Tecnologie Biomediche, Consiglio Nazionale delle Ricerche, via Amendola 122/D, 70125 Bari, Italy. UMR INRA 1097, IRD-Montpellier SupAgro-Univ. Montpellier II, Diversité et Adaptation des Plantes Cultivées, 2 Place Pierre Viala, 34060 Montpellier Cedex 1, France. UMR INRA 1098, IRD-Montpellier SupAgro-CIRAD, Développement et Amélioration des Plantes, 2 Place Pierre Viala, 34060 Montpellier Cedex 1, France. Dipartimento Scientifico e Tecnologico, Università degli Studi di Verona Strada Le Grazie 15 – Ca’ Vignal, 37134 Verona, Italy. Dipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino, Università degli Studi di Verona, via della Pieve, 70 37029 S. Floriano (VR), Italy. VIGNA-CRA Initiative; Consorzio Interuniversitario Nazionale per la Biologia Molecolare delle Piante, c/o Università degli Studi di Siena, via Banchi di Sotto 55, 53100 Siena, Italy. A list of participants and their affiliations appears at the end of the paper. These authors contributed equally to this work