索查询工作。对于检索获得的记录,用户可以选择需要显示的数据,保存查询结果,甚至以图形方式观看 检索获得的序列。更详细的 Entrez使用说明可以在该主页上获得。 (2)向 Genbank提交序列数据 测序工作者可以把自己工作中获得的新序列提交给NCBI,添加到 Genbank数据库。这个任务可以由基于Web 界面的 Bankit或独立程序 Sequin来完成。 BankIt是一系列表单,包括联络信息、发布要求、引用参考信息、序列来源信息、以及序列本身的信息等 用户提交序列后,会从电子邮件收到自动生成的数据条目, Genbank的新序列编号,以及完成注释后的完 整的数据记录。用户还可以在 BankIt页面下修改已经发布序列的信息。 BankIt适合于独立测序工作者提 交少量序列,而不适合大量序列的提交,也不适合提交很长的序列,EST序列和GSS序列也不应用 BankIt 提交。 BankIt使用说明和对序列的要求可详见其主页面。 大量的序列提交可以由 Sequin程序完成。 Sequin程序能方便的编辑和处理复杂注释,并包含一系列内建 的检查函数来提高序列的质量保证。它还被设计用于提交来自系统进化、种群和突变研究的序列,可以 入比对的数据。 Sequin除了用于编辑和修改序列数据记录,还可以用于序列的分析,任何以 FASTA或ASN.1 格式序列为输入数据的序列分析程序都可以整合到 Sequin程序下。在不同操作系统下运行的 Sequin程序 都可以在ftp://ncbi.nlm.nih.gov/ sequin/下找到, Sequin的使用说明可详见其网页。 NCBI的网址是:htp://w.ncbi,nlm,nih,gov Entrez的网址是:http://www.ncbi.nlmnihgov/entrez BankIt的网址是http://www.ncbi.nlmnihgov/bankit. Sequin的相关网址是:http://www.ncbinim.nihgov/sequin/ 2.BRL核酸序列数据库 EMBL核酸序列数据库由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的核酸序列数据构成,由于与 Genbank和DDBJ的 数据合作交换,它也是一个全面的核酸序列数据库。该数据库由 Oracal数据库系统管理维护,查询检索可 以通过通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成。向EMBL核酸序列数据库提交序列可以通过基于Web 的WBIN工具,也可以用 Sequin软件来完成 数据库网址是:http://www.ebi.ac.uk/emb1/. SRS的网址是http://srs.ebiac.uk/o WEBIN的网址是:http://www.ebiac.uk/emb1/submission/webin.htmla 3.DDBJ数据库 日本DNA数据仓库(DDB也是一个全面的核酸序列数据库,与 Genbank和EMBL核酸库合作交换数据。可以 使用其主页上提供的SRS工具进行数据检索和序列分析。可以用 Sequin软件向该数据库提交序列。索查询工作。对于检索获得的记录，用户可以选择需要显示的数据，保存查询结果，甚至以图形方式观看 检索获得的序列。更详细的 Entrez 使用说明可以在该主页上获得。 (2) 向 Genbank 提交序列数据 测序工作者可以把自己工作中获得的新序列提交给 NCBI，添加到 Genbank 数据库。这个任务可以由基于 Web 界面的 BankIt 或独立程序 Sequin 来完成。 BankIt 是一系列表单，包括联络信息、发布要求、引用参考信息、序列来源信息、以及序列本身的信息等。 用户提交序列后，会从电子邮件收到自动生成的数据条目，Genbank 的新序列编号，以及完成注释后的完 整的数据记录。用户还可以在 BankIt 页面下修改已经发布序列的信息。BankIt 适合于独立测序工作者提 交少量序列，而不适合大量序列的提交，也不适合提交很长的序列，EST 序列和 GSS 序列也不应用 BankIt 提交。BankIt 使用说明和对序列的要求可详见其主页面。 大量的序列提交可以由 Sequin 程序完成。Sequin 程序能方便的编辑和处理复杂注释，并包含一系列内建 的检查函数来提高序列的质量保证。它还被设计用于提交来自系统进化、种群和突变研究的序列，可以加 入比对的数据。Sequin 除了用于编辑和修改序列数据记录，还可以用于序列的分析，任何以 FASTA 或 ASN.1 格式序列为输入数据的序列分析程序都可以整合到 Sequin 程序下。在不同操作系统下运行的 Sequin 程序 都可以在 ftp://ncbi.nlm.nih.gov/sequin/下找到，Sequin 的使用说明可详见其网页。 NCBI的网址是： http://www.ncbi.nlm.nih.gov 。 Entrez的网址是： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/ 。 BankIt的网址是： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt 。 Sequin的相关网址是： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/ 。 2. EMBL 核酸序列数据库 EMBL 核酸序列数据库由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的核酸序列数据构成，由于与 Genbank 和 DDBJ 的 数据合作交换，它也是一个全面的核酸序列数据库。该数据库由 Oracal 数据库系统管理维护，查询检索可 以通过通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成。向 EMBL 核酸序列数据库提交序列可以通过基于 Web 的 WEBIN 工具，也可以用 Sequin 软件来完成。 数据库网址是： http://www.ebi.ac.uk/embl/ 。 SRS的网址是： http://srs.ebi.ac.uk/ 。 WEBIN 的网址是： http://www.ebi.ac.uk/embl/Submission/webin.html 。 3. DDBJ 数据库 日本 DNA 数据仓库(DDBJ)也是一个全面的核酸序列数据库，与 Genbank 和 EMBL 核酸库合作交换数据。可以 使用其主页上提供的 SRS 工具进行数据检索和序列分析。可以用 Sequin 软件向该数据库提交序列