葡萄基因组测定完成 2007年8月28日一项由法国科学家领导的最新研究捍卫了法国作为“葡萄酒之都"的荣誉, 他们完整测定了一种葡萄的基因组。葡萄也由此成为人类完成基因测序的第一种水果作物 和第四种开花植物(其它3种分别是小麦、拟南芥和白杨木),这有望加深科学家对开花植 物进化过程的理解。相关论文8月26日在线发表于《自然》杂志。 该项研究由法国和意大利组成的科学家团队完成,而领导他们的是法国 Genoscope国家 基因测序中心的遗传学家 Patrick Wicker。他们完整分析了制造勃艮第和香槟酒的主要原 料——“黑比诺”( Pinot noir)葡萄的基因序列 利用“黑比诺”变异较少的特点,研究人员培育出了一种稳定的葡萄种系PN40024。随后, 他们将PN40024葡萄的DNA分割成几百万个片断并分别进行了测序,再利用计算机程序 将基因编码结合起来,从而得到了完整的基因组。不出所料,硏究人员发现,该葡萄基因组 的300多个基因中有许多都是用来制造赋予葡萄香味的萜类化合物和丹宁酸(共有大约5 亿个碱基对),而且这一比例大大超过了其他的植物 研究人员此次专门研究了70至80个制造萜类化合物的基因,目的是为了能够通过基因改 造,开发味道更加独特的葡萄酒,并增强葡萄对害虫和有害物(比如霉菌)的抵抗能力。 此次葡萄基因组的测定有助于科学家了解开花植物的一个关键进化过程,也就是大约25 亿年雨双子吐植物和单子叶植物的分化。此次测定的葡萄基因组与之前的小麦基因组对 表明,双子叶植物的基因组有大规模复制成为原来3倍的明显特点和标记 不过,一位 Genoscope研究人员 Jean Weissenbach指出,遗传学家此次研究成果和认 识并不能替代进化学家和葡萄酒制造者长期以来的传统观点。他说,“我们能够创造出具有 不同香味的葡萄变种,但最终葡萄酒的品质则完全是另一回事。”(科学网任霄鹏/编译) Genome projects were initiated on grapevine(Vitis vinifera L, 2n=38, genome size 475 Annotated genes Annotated transcripts 26,346 Average number of coding exons per gene 5.95 Median gene size(bp) Average CDS size(bp) 1.137 Median exon size(bp) This Grapevine genome sequence analysis results from a collaboration between Genoscope NRA, the Institute of Applied Genomics and a consortium of italian groups. The sequence data(12X coverage)was generated by Genoscope, The Institute of Applied Genomics and the University of Verona. The assembly was done by The Institute of Applied Genomics. The gene predictions were perfomed using the GAZE computational framework This project was financed by the French Ministry of Higher Education and Research, the Consortium National de Recherche en Genomique, the Agence Nationale de la recherche NRA, the italian Ministry of Agriculture(VIGNA-CRA), and Regione Autonoma Friuli Venezia葡萄基因组测定完成 2007年8月28日 项由法国科学家领导的最新研究捍卫了法国作 “葡萄酒之都”的荣誉， 他们完整测定了一 葡萄的基因组 葡萄也由此成为人类完成基因测序的第一种水果作物 和第四种开花植物（其它 3 种分别是小麦、拟南芥和白杨木）， 有望加深科学家对开花植 物进化过程的理解。相关论文 8 月 26 日在线发表于《自然》杂志。 该项研究由法国和意 利组成的科学家团队完成，而领导他们的是法国 Genoscope 国家 基因测序中心的遗传学家 Patrick Wincker。他们完整分析了制造勃艮第和香槟酒的主要原 料——“黑比诺”（Pinot Noir）葡萄的基因序列。 利用“黑比诺”变异较少的特点，研究人员培育出了一种稳定的葡萄种系 PN 40024。随后， 他们将 PN 40024 葡萄的 DNA 分割成几百万 片断并分别进行了测序，再利用计算机程序 将基因编码结合起来，从而得到了完整的基因组。不出所料，研究人员发现，该葡萄基因组 的 3000 个基因中有许多都是用来制造赋予葡萄香味的萜类化合物和丹宁酸（共有大约 5 亿个碱基对），而且这一比例大大超过了其他的植物。 研究人员此次专门研究了 70 至 80 个制造萜类化合物的基因，目的是为了能够通过基因改 造，开发味道 加独特的葡萄酒，并增强葡萄对害虫和有害物（比如霉菌）的抵抗能力。 此次葡萄基因组的测定有助于科学家了解开花植物的一个关键进化过程，也就是大约 2.5 亿年 双子叶植物和单子叶植物的分化。此次测定的葡萄基因组与之前的小麦基因组对比 表明，双子叶植物的基因组有大规模复制成为原来 3 倍的明显特点和标记。 不过，一位 Genoscope 研究人员 Jean Weissenbach 指出，遗传学家此次研究成果和认 识并不能替代进化学家和葡萄酒制造者长期以来的传统观点。他说，“我们能够创造出具有 不同香味的葡萄变种，但最终葡萄酒的品质则完全是另一回事。”（科学网 任霄鹏/编译） Genome projects were initiated on grapevine (Vitis vinifera L., 2n=38, genome size 475 Mb) Annotated genes 26,346 Annotated transcripts 26,346 Average number of coding exons per gene 5.95 Median gene size (bp) 3,572 Average CDS size (bp) 1,137 Median exon size (bp) 122 This Grapevine genome sequence analysis results from a collaboration between Genoscope, INRA, the Institute of Applied Genomics and a consortium of Italian groups. The sequence data (12X coverage) was generated by Genoscope, The Institute of Applied Genomics and the University of Verona. The assembly was done by The Institute of Applied Genomics. The gene predictions were performed using the GAZE computational framework. This project was financed by the French Ministry of Higher Education and Research, the Consortium National de Recherche en Génomique, the Agence Nationale de la Recherche, INRA, the Italian Ministry of Agriculture (VIGNA-CRA), and Regione Autonoma Friuli Venezia