正在加载图片...
杨海燕etal 神经胶质瘤多组学研究进展 通过与端粒序列竞争性结合端粒酶,抑制端的研究多是集中在单一方向研究,且受到生 粒延长阿。因而 TERRA表达降低是胶质母物信息学分析能力的限制,多数研究缺乏相 细胞瘤恶化和不良预后的潜在标志。此外,同样本的基因组学、转录组学、蛋白质组学 还发现在胶质瘤中 IncRNA H19髙表达,而的联合分析,这也是机制研究的瓶颈问题。 该 IncANA通过调节 microRNA-675的表达 改变黏连蛋白13的活性,从而影响肿瘤的7展望 侵袭能力的。多种胶质瘤特异性的非编码 RNA以及甲基化、乙酰化位点的发现,为胶 近年来随着生物技术的不断更新,胶质瘤的 质瘤的分型早期诊断提供了丰富的靶点和理 多组学研究取得了飞速的发展。随着单细胞 论依据 测序技术的成熟和人工智能的发展和生物信 息学分析能力的不断提升,将来胶质瘤的精 准诊断治疗一定是多组学水平的联合,发现 6存在的问题 真正能够应用于胶质瘤诊断、分型和预后的 虽然在二代测序成本不断降低与生物信息学分子标记和进行精准靶向治疗的靶点。另外, 快速发展的前提下,胶质瘤的分型、诊断发对已发现的分子标记在中、大样本中的验证, 展速度很快,IDH突变、1p/19q联合缺失、将去粗取精,找到真正能够应用于临床的分 TERT突变、ATRX突变、MGMT启动子甲子标记和治疗靶点。对多组学水平发现的真 基化等在胶质瘤的诊断和预后预测上起到了正有价值的差异分子进行深入研究,不但能够 重要的作用,但是仍存在以下问题:(1)加深我们对胶质瘤发病机制的认识,而且能够 新一代测序技术的突破发生于最近几年,对促进胶质瘤的精准治疗的发展。随着测序技术 于硬件和软件要求很高,需要具备生物大数的发展和成本的降低、分析规范标准的建立、 据和生物信息学的分析能力,并且尚无统一安全有效分子靶向药物的丰富以及法律法规 的分析标准,对于绝大部分医疗工作人员难的完善,必将使胶质瘤患者在正确的时间得到 以准确理解和运用。(2)虽然目前多组学精准的诊疗,达到最佳的治疗效果。 研究发现了众多的差异基因与差异蛋白,但 发现的许多新的分子标记缺乏大规模临床样参考文献 本的验证来避免组学中发现的偶然现象,而 且我们对大部分基因和蛋白质功能尚缺乏深1. Chen J, McKay RM, Parada LF. Malignant glioma: lessons from genomics, mouse models, 入研究,即使发现了潜在的驱动因素,仍然 and stem cells. Cell 2012, 149 (1): 36-47. 缺乏有效的靶向治疗方法。(3)我国开展2.№ux, Sun nr, Jang HT, Guo SW, Lian MX 基因组信息检测的中心较少,所测数据及相 Associations between EGFR gene 应临床治疗信息并无统一的存储平台,无法 polymorphisms and susceptibility to glioma 为临床工作者提供全面系统的、个体特异的 GWAS and case-control studies. Oncotarget 数据,从而成为精准医学发展的一个障碍。 2017,8(49):86877-86885 (4)血液与脑脊液是胶质瘤无创诊断的新3.WuQ, Peng Y, Zhao x. An Updated and 的方向,但是体液与组织之间的多组学水平 Comprehensive Meta-Analysis of Association 均存在异质性,受目前技术的限制,体液与 Between Seven Hot Loci Polymorphisms 组织之间的一致率仍有待提高。(5)目前 from Eight GWAS and Glioma Risk. Mol Neurobiol2016,53(7):4397-4405 IMRF2018;2(1)2:DO:10.12208/mt20180002 收稿日期2018-0826出刊日期201809-10杨海燕 et al. 神经胶质瘤多组学研究进展 IMRF 2018; 2:(1)2; DOI:10.12208/j.imrf.20180002 12 收稿日期 2018-08-26 出刊日期 2018-09-10 通过与端粒序列竞争性结合端粒酶,抑制端 粒延长 [50]。因而 TERRA 表达降低是胶质母 细胞瘤恶化和不良预后的潜在标志。此外 , 还发现在胶质瘤中 lncRNA H19 高表达,而 该 lncRNA 通过调节 microRNA-675 的表达 改变黏连蛋白 13 的活性,从而影响肿瘤的 侵袭能力 [51]。多种胶质瘤特异性的非编码 RNA 以及甲基化、乙酰化位点的发现,为胶 质瘤的分型早期诊断提供了丰富的靶点和理 论依据。 6 存在的问题 虽然在二代测序成本不断降低与生物信息学 快速发展的前提下,胶质瘤的分型、诊断发 展速度很快,IDH 突变、1p/19q 联合缺失、 TERT 突变、ATRX 突变、MGMT 启动子甲 基化等在胶质瘤的诊断和预后预测上起到了 重要的作用,但是仍存在以下问题:(1) 新一代测序技术的突破发生于最近几年,对 于硬件和软件要求很高,需要具备生物大数 据和生物信息学的分析能力,并且尚无统一 的分析标准,对于绝大部分医疗工作人员难 以准确理解和运用。(2)虽然目前多组学 研究发现了众多的差异基因与差异蛋白,但 发现的许多新的分子标记缺乏大规模临床样 本的验证来避免组学中发现的偶然现象,而 且我们对大部分基因和蛋白质功能尚缺乏深 入研究,即使发现了潜在的驱动因素,仍然 缺乏有效的靶向治疗方法。(3)我国开展 基因组信息检测的中心较少,所测数据及相 应临床治疗信息并无统一的存储平台,无法 为临床工作者提供全面系统的、个体特异的 数据,从而成为精准医学发展的一个障碍。 (4)血液与脑脊液是胶质瘤无创诊断的新 的方向,但是体液与组织之间的多组学水平 均存在异质性,受目前技术的限制,体液与 组织之间的一致率仍有待提高。(5)目前 的研究多是集中在单一方向研究,且受到生 物信息学分析能力的限制,多数研究缺乏相 同样本的基因组学、转录组学、蛋白质组学 的联合分析,这也是机制研究的瓶颈问题。 7 展望 近年来随着生物技术的不断更新,胶质瘤的 多组学研究取得了飞速的发展。随着单细胞 测序技术的成熟和人工智能的发展和生物信 息学分析能力的不断提升,将来胶质瘤的精 准诊断治疗一定是多组学水平的联合,发现 真正能够应用于胶质瘤诊断、分型和预后的 分子标记和进行精准靶向治疗的靶点。另外, 对已发现的分子标记在中、大样本中的验证, 将去粗取精,找到真正能够应用于临床的分 子标记和治疗靶点。对多组学水平发现的真 正有价值的差异分子进行深入研究,不但能够 加深我们对胶质瘤发病机制的认识,而且能够 促进胶质瘤的精准治疗的发展。随着测序技术 的发展和成本的降低、分析规范标准的建立、 安全有效分子靶向药物的丰富以及法律法规 的完善,必将使胶质瘤患者在正确的时间得到 精准的诊疗,达到最佳的治疗效果。 参考文献 1.Chen J, McKay RM, Parada LF. Malignant glioma: lessons from genomics, mouse models, and stem cells. Cell 2012, 149(1): 36-47. 2.Yu X, Sun NR, Jang HT, Guo SW, Lian MX. Associations between EGFR gene polymorphisms and susceptibility to glioma: a systematic review and meta-analysis from GWAS and case-control studies. Oncotarget 2017, 8(49): 86877-86885. 3.Wu Q, Peng Y, Zhao X. An Updated and Comprehensive Meta-Analysis of Association Between Seven Hot Loci Polymorphisms from Eight GWAS and Glioma Risk. Mol Neurobiol 2016, 53(7): 4397-4405
<<向上翻页向下翻页>>
©2008-现在 cucdc.com 高等教育资讯网 版权所有