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公共数据库与专业数据库 000 公共数据库中大多数的蛋白质序列是将核酸序列中的编码序列区域 (coding sequence region,CDS)进行蛋白质翻译后,通过后续的 些计算分析(如利用BLAST进行序列相似性分析),主观人为地为序 列加上蛋白质产物名称及功能注释。也就是说,它们不是通过实验 来确定的。例如:UniProt下属的KnowledgeBase数据库,是由众多 蛋白质专家人工校正注释的高质量Swiss-Prot和由计算预测得到各种 蛋白质功能信息的TrEMBL两部分组成,是目前最大的二级蛋白质序 列数据库。 专业数据库被开发出来以满足不同生物学研究团体对特定类型信息 的需求。例如,专门研究小RNA的数据库或专门存储基因表达谱数 据的数据库,以及专门为果蝇、线虫、拟南芥等基因组研究提供各 类信息的专业数据库等。公共数据库与专业数据库 7 • 公共数据库中大多数的蛋白质序列是将核酸序列中的编码序列区域 (coding sequence region,CDS)进行蛋白质翻译后,通过后续的一 些计算分析(如利用BLAST 进行序列相似性分析),主观人为地为序 列加上蛋白质产物名称及功能注释。也就是说,它们不是通过实验 来确定的。例如:UniProt下属的KnowledgeBase数据库,是由众多 蛋白质专家人工校正注释的高质量Swiss-Prot和由计算预测得到各种 蛋白质功能信息的TrEMBL两部分组成,是目前最大的二级蛋白质序 列数据库。 • 专业数据库被开发出来以满足不同生物学研究团体对特定类型信息 的需求。例如,专门研究小RNA 的数据库或专门存储基因表达谱数 据的数据库,以及专门为果蝇、线虫、拟南芥等基因组研究提供各 类信息的专业数据库等
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