研究价值 小脑共济失调是一种常染色体显性遗传的神经系统疾病,疾病临床常 表现为运动失调。本研究发现了小脑共济失调家族SCA23亚型新的致病基 因TGλ6。该基因的发现,对今后阐明小脑共济失调发病机制、遗传诊断 和新药研发具有重要的科学和应用价值。 ●方法与结果 对患有小脑共济失调的同一家系4个患者进行了全外显子组测序(平均 测序深度65.1×),在每个患者的外显子区域平均检测到约5800个潜在影 响基因功能的变异,包括NS(非同义突变)、SS(剪切位点突变)和 InDel(插入缺失突变),其中包含了大量的罕见变异。 筛选流程( bioinformatics application): 1)过滤掉同义突变等不影响基因功能的突变,只保留非同义突变、剪切位 点突变、插入缺失等影响基因功能的突变; 2)过滤掉公共遗传突变数据库( dbsnP等)正常人携带的常见突变、已发表 的正常对照个体的突变; 3)根据软件对突变进行功能预测,获得对功能有影响的候选基因和突变位 点 4)最后在所有患病个体的候选基因和突变位点集合中取交集。⚫ 研究价值 小脑共济失调是一种常染色体显性遗传的神经系统疾病，疾病临床常 表现为运动失调。本研究发现了小脑共济失调家族SCA23亚型新的致病基 因TGM6。该基因的发现，对今后阐明小脑共济失调发病机制、遗传诊断 和新药研发具有重要的科学和应用价值。 ⚫ 方法与结果： 对患有小脑共济失调的同一家系4个患者进行了全外显子组测序（平均 测序深度65.1×），在每个患者的外显子区域平均检测到约5800个潜在影 响基因功能的变异，包括NS（非同义突变）、SS（剪切位点突变）和 InDel（插入缺失突变），其中包含了大量的罕见变异。 ⚫ 筛选流程（bioinformatics application）： 1）过滤掉同义突变等不影响基因功能的突变，只保留非同义突变、剪切位 点突变、插入缺失等影响基因功能的突变； 2）过滤掉公共遗传突变数据库(dbSNP等)正常人携带的常见突变、已发表 的正常对照个体的突变； 3）根据软件对突变进行功能预测，获得对功能有影响的候选基因和突变位 点； 4）最后在所有患病个体的候选基因和突变位点集合中取交集