第1期 尹宁，等：采用最小误差阙值分割算法的基因芯片图像分析 .31· 点个数/待区分的基因样点总数).通过多组图片的 [3]张晶，王黎，高晓蓉，等.数字图像处理中的图像分割技 分类实验，分别计算准确率，最终求得准确率的平均值 术及其应用[J].信息技术，2010(11)：33-39 结果如表1. ZHANG Jing,WANG Li,GAO Xiaorong,et al.The image 表1分类准确率汇总 segmentation technology and its application in digital image Table 1 Accuracy summary processing[J].Information Technology,2010(11):33- 39. 病毒名称 病毒与对照样本分类 病毒浓度分类 [4]CECCARELLI M,ANTONIOL G.A deformable grid-mate- 基孔肯亚 0.9288 0.6694 hing approach for microarray images[J].IEEE Transactions 辛德毕斯 0.8255 0.7168 on Image Processing,2006,15(10):3178-3188. 从表1可以看出，受到基因芯片制备条件和处 [5]BAJCSY P.An overview of DNA microarray grid alignment 理算法的影响，每组实验结果的准确率有很大的不 and foreground separation approaches[J].EURASIP Jour- nal on Applied Signal Processing,2006,2006 (1): 同.总体来看，对于同一组小芯片中不同基因样点的 080163, 分类结果要好于不同组小芯片中基因样点的分类. [6]王宇，陈殿仁，沈美丽，等.基于形态学梯度重构和标记 基因样点病毒间差异的分类结果要优于同病毒不同 提取的分水岭图像分割[J].中国图象图形学报，2008， 浓度的分类结果.尤其是针对样点信号和背景图像 13(11):2176-2180. 对比不大的情况，算法的分割效果较好 WANG Yu,CHEN Dianren,SHEN Meili,et al.Watershed segmentation based on morphological gradient reconstruction 3结束语 and marker extraction[J].Joural of Image and Graphics, 上述实验表明，应用最小误差阚值分割算法设 2008,13(11):2176-2180 计的基因样点识别系统能够成功地把基因芯片中大 [7]刘华军，任明武，杨静字.一种改进的基于模糊聚类的图 量的基因样点区分出来，并且计算描述基因样点的 像分割方法[J].中国图象图形学报，2006,11(9)： 1312-1316. 特征参量数值.通过分析这些数据基因芯片系统实 LIU Huajun,REN Mingwu,YANG Jingyu.An improved 现了基因样点分类的功能，但准确率还不是很高，对 image segmentation method based on fuzzy clustering[J]. 于基因样点间的细微差别还是无法识别，有待于今 Jourmal of Image and Graphics,2006,11(9):1312-1316. 后在算法上进一步完善 [8]范九伦，雷博.二维直线型最小误差阈值分割法[J].光 同时，由于基因芯片种类较多，制备方法不尽相 电工程，2009,31(8)：1801-1806. 同，而且基因芯片扫描仪型号各异，因此不同种类基 FAN Jiulun,LEI Bo.Two-dimensional linear-type minimum 因芯片图像存在很大的差异.本文基因芯片图像来 error threshold segmentation method[J].Joural of Elec- 源有限，很多类型的基因芯片图像还未应用到本文 tronics Information Technology,2009,31(8):1801- 描述的基因芯片识别系统进行分析处理.今后还需 1806. [9]谭优，王泽勇.图像阈值分割算法实用技术研究与比较 多方搜集实验样本，检测该系统的性能，使其不断完 [J].计算机信息，2007,23(24)：233,298-299 善以及有更广泛的适用范围， TAN You,WANG Zeyong.Study on applied technology a- 参考文献： rithmetic of image threshold segmentation[J].Microcom- puter Information,2007,23(24):233,298-299 [1]MALEKINEJAD H,SCHOEVERS E J,DAEMEN J,et a1. [10]凡敏，田明尧，赵权，等.基孔肯亚病毒和辛德毕斯病毒 Exposure oocytes to the Fusarium toxins zearalenone and de- 检测基因芯片的建立[J].中国兽医学报，2012,32 oxynivalenol causes aneuploidy and abnormal embryo devel- (10):1493-1497. opment in pigs J].Biology of Reproduction,2007,77 FAN Min,TIAN Mingrao,ZHAO Quan,et al.Establish- (5):840-847 ment and application of gene chip for Chikungunya virus [2]WIESE K C,EICHER C.Graph drawing tools for bioinfor- and Sindbis virus[J].Chinese Joural of Veterinary Sci- matics research:an overview computer based medical sys- ence,2012,32(10):1493-1497. tems C]//Proceedings of the 19th IEEE Symposium on [11]王晓凯，李峰.改进的自适应中值滤波[J].计算机工程 Computer-Based Medical Systems.Washington,DC,USA: 与应用，2010,46(3)：175-176,218 IEEE Computer Society,2006:653-658. WANG Xiaokai,LI Feng.Improved adaptive median filte-