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MTX:碱中心为N1,相邻的C2-NH2(PDB:1U72) 嘧啶环N1)处于亲脂性凹槽中,N1/C2-NH2阳离子与DHFR E30/T136结合。 C10-NH2与I7/Y121/V115形成氢键 Glu的a-COOH与R70侧链形成离子键相互作用 对氨基苯甲酰基处于疏水口袋:F31/F34/160 喋啶Pteridine环处于口袋:A9/F34/L22 H22 CH3 8 H2N. NH OH NH 2423 29 /2726 二氢叶酸:(PDB:4M6K) HO HO 28 20 对氨基苯甲酰和谷氨酸结合类似于MTX N1非结合,N3N11与E30成氢键 结构较为松散 Pymol Demo...MTX:碱中心为N1,相邻的C2-NH2 (PDB:1U72) 嘧啶环(N1)处于亲脂性凹槽中,N1/C2-NH2阳离子与DHFR E30/T136结合。 C10-NH2与I7/Y121/V115形成氢键 Glu的a-COOH与R70侧链形成离子键相互作用 对氨基苯甲酰基处于疏水口袋:F31/F34/I60 喋啶Pteridine环处于口袋:A9/F34/L22 二氢叶酸: (PDB: 4M6K) 对氨基苯甲酰和谷氨酸结合类似于MTX N1非结合,N3/N11与E30成氢键 结构较为松散 Pymol Demo… N 3 5 N H 1 4 10 2 N 6 21 N 9 NH 23 29 24 18 7 O 12 27 O 22 O 32 H2N 11 NH 14 O 31 8 25 19 13 17 15 26 HO 30 HO 28 16 20 N 1 N 3 9 4 10 2 N 8 22 N 5 NH 24 7 30 N 13 25 19 12 28 16 O 23 O 33 6 O 32 NH2 15 18 20 17 21 H2N 11 26 27 OH 31 OH 29 CH3 14
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