双序列比对打分 口序列1: V D S 门序列2: Vs工cY J match/mismatch pair score: 4 2 4 97 gaps penalty: 口两序列比对的总分: Score =2(Aa pair scores)-gap penalty 4+2+4+9+7-11 15 Genomics and Bioinformatics 2015. TMMLGenomics and Bioinformatics 2015, TMMU 双序列比对打分  序列1： V D S – C Y  序列2： V E S L C Y  match/mismatch pair score：4 2 4 9 7  gaps penalty： -11  两序列比对的总分： Score = Σ(AA pair scores) – gap penalty = 4+2+4+9+7-11 = 15