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3.CRISPR/Cas9基因组编辑技术 CRISPR/Cas系统由Cas9核酸内切酶与sgRNA构成.转录的SgRNA折叠成特定的三 维结构后与Cas9蛋白形成复合体,指导Cas9核酸内切酶识别特定靶标位点,在P4M 序列上游处切割DNA造成双链DNA断裂,并启动DNA损伤修复机制.从不同菌种中 分离的CRISPR/Cas系统,其CrRNA(或者是人工构建的sgRNA)靶向序列的长度不同, PAM序列也可能不同。最新报道,CRISPR-C2c2系统能够根据靶向序列特异地编辑单 链RNA. 三、 三种编辑技术的比较 1.共同点 结构的相似性:无论是ZFN、TALEN还是CRISPR/Cas9,都是由DNA识别域和 核酸内切酶两部分组成。其中ZFN技术具有锌指结构域能够识别靶点DNA,而TALEN 的DNA识别区域是重复可变双残基的重复,DNA剪切区域都是一种名为FON的核酸 内切酶结构域。CRISPR的DNA识别区域是crRNA或向导RNA,Cas9蛋白负责DNA 的剪切。当DNA结合域识别靶点DNA序列后,核酸纳切酶或Cas9蛋白将DNA剪切 靶DNA双链断裂,再启动DNA损伤修复机制,实现基因敲除、插入等。 作用过程的相似性:通过DNA识别模块对特异性的DNA位点识别并结合,然 后在相关核酸内切酶的作用下完成特定位点的剪切,从而借助于细胞内固有的HD (同源定向修复)或NHE(非同源末端连接)途径修复过程完成特定序列的插入、删 除及基因融合。 2.不同点 三种基因编辑技术的差异 ZFN TALEN CRISRP系统 识别模式 蛋白质一DNA 蛋白质一DNA RNA-DNA 靶向元件 ZF array蛋白 TALE array蛋白 sgRNA蛋白 切割元件 FOkI蛋白 FOkI蛋白 Cas9蛋白 识别长度 (3-6)×3×2bp (12-20)×2bp 20bp 识别序列特点 以3bp为单位 5前一位为T 3'序列为NGC 213 2 / 3 3. CRISPR /Cas9 基因组编辑技术 CRISPR/Cas 系统由 Cas9 核酸内切酶与 sgRNA 构成. 转录的 sgRNA 折叠成特定的三 维结构后与 Cas9 蛋白形成复合体, 指导 Cas9 核酸内切酶识别特定靶标位点, 在 PAM 序列上游处切割 DNA 造成双链 DNA 断裂, 并启动 DNA 损伤修复机制. 从不同菌种中 分离的 CRISPR/Cas 系统, 其 CrRNA(或者是人工构建的 sgRNA)靶向序列的长度不同, PAM 序列也可能不同。最新报道,CRISPR-C2c2 系统能够根据靶向序列特异地编辑单 链 RNA。 三、 三种编辑技术的比较 1.共同点 结构的相似性:无论是 ZFN、TALEN 还是 CRISPR /Cas9,都是由 DNA 识别域和 核酸内切酶两部分组成。其中 ZFN 技术具有锌指结构域能够识别靶点 DNA,而 TALEN 的 DNA 识别区域是重复可变双残基的重复,DNA 剪切区域都是一种名为 Fokl 的核酸 内切酶结构域。CRISPR 的 DNA 识别区域是 crRNA 或向导 RNA,Cas9 蛋白负责 DNA 的剪切。当 DNA 结合域识别靶点 DNA 序列后,核酸内切酶或 Cas9 蛋白将 DNA 剪切, 靶 DNA 双链断裂,再启动 DNA 损伤修复机制,实现基因敲除、插入等。 作用过程的相似性:通过DNA识别模块对特异性的DNA位点识别并结合,然 后在相关核酸内切酶的作用下完成特定位点的剪切,从而借助于细胞内固有的 HDR (同源定向修复)或 NHEJ(非同源末端连接)途径修复过程完成特定序列的插入、删 除及基因融合。 2.不同点 三种基因编辑技术的差异 ZFN TALEN CRISRP 系统 识别模式 蛋白质—DNA 蛋白质—DNA RNA—DNA 靶向元件 ZF array 蛋白 TALE array 蛋白 sgRNA 蛋白 切割元件 Fok I 蛋白 Fok I 蛋白 Cas9 蛋白 识别长度 (3-6)x 3 x 2 bp (12-20) x 2 bp 20 bp 识别序列特点 以 3 bp 为单位 5‘前一位为 T 3‘序列为 NGC
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