第10章微生物的进化、系统发育和分类鉴定 1.约在36亿年前地球上出现了最原始的生命，从而开始了生物进化历程，产生了今天千姿 百态的生物种类。据估计有分类记录的生物约150万种，其中微生物大约15万种，为了认 识利用这些生物必须对它们进行分类。研究生物分类的科学称之为分类学。达尔文创立“进 化论"不仅提出了研究生物进化的历史使命，也给分类学带来了按亲缘关系进行分类的指导 思想 2.20世纪6070年代以前，主要是根据表型特征推测微生物的亲缘关系进行分类。此后， 随着分子生物学的发展，逐渐以生物大分子的序列特征（亦可称之为遗传学特征）作为判断微 生物亲缘关系进行系统分类的主要依据。要准确判断生物进化谱系和系统分类，必须挑选适 当的生物大分子，由于rRNA,特别是16SRNA(或1 8S rRNA)所具有的优点，因而被选为微生 物系统发有研究的主要对象。 要比较不同生物的rRNA序列就要进行序列测定，其方法分两类：一是寡核苷酸编目分 析法，二是全序列分析法，目前主要用后者。在获得各生物的序列资料后要进行各生物间的 序列特征比较，需要计算各生物间的序列相似性系数或者寻找印迹序列。 3.系统学上常用系统树米直观地反映各种（类）生物之间的亲缘关系和进化过程的大致轮廓。 书中所引用的全生命系统树就是伍斯等用16S(或18S)RNA的序列资料构建的分子系统树， 这是一颗有根的树，它企图让人们看到生物由共同祖先沿者3条主干线最后演化成今天的三 域生物的大致轮郭。将细胞生物分成细菌、古生菌和真核生物3个域的理论，虽然它最初是 根16SRNA序列分析提出来的，其他遗传学、生理生化学和形态学特征的研究也在一定程 度上进一步支持了这一思想。目前已被生物学家特别是微生物学家的广泛认同。 4,微生物分类学包括3个互相依存又有区别的组成部分：分类、命名和鉴定。系统分类所 划分的类群称分类单元。分类单元分7个基本的分类等级，由上而下依次是界、门、纲、目、 科、属、种在需要时还可增亚等级，在种（亚种之下还可分为不同的型。近年来在微生物分 类中，在界之上用域”作为分类的最高等级