的过程中,首先扫描待预测的氨基酸序列,利用一组规则发现可能成为特定二级结构成核区 域的短序列片段,然后对于成核区域进行扩展,不断扩大成核区域,直到二级结构类型可能 发生变化为止,最后得到的就是一段具有特定二级结构的连续区域。下面是4个简要的规则 1.α螺旋规则 沿着蛋白质序列寻找α螺旋核,相邻的6个残基中如果有至少4个残基倾向于形成α螺旋, 即有4个残基对应的Pa〉100,则认为是螺旋核。然后从螺旋核向两端延伸,直至四肽片段 Pa的平均值小于100为止。按上述方式找到的片段长度大于5,并且Pa的平均值大于P的 平均值,那么这个片段的二级结构就被预测为α螺旋。此外,不容许Pro在螺旋内部出现,但 可出现在C末端以及N端的前三位,这也用于终止螺旋的延伸。 2.β折叠规则 如果相邻6个残基中若有4个倾向于形成β折叠,即有4个残基对应的P〉100,则认 为是折叠核。折叠核向两端延伸直至4个残基P的平均值小于100为止。若延伸后片段的 P的平均值大于105,并且Pp的平均值大于Pa的平均值,则该片段被预测为折叠。 3.转角规则 转角的模型为四肽组合模型,要考虑每个位置上残基的组合概率,即特定残基在四肽模 型中各个位置的概率。在计算过程中,对于从第个残基开始的连续4个残基的片段,将上 述概率相乘,根据计算结果判断是否是转角。如果f)×(+1)×(i+2)x(计+3)大于7.5×103,四 肽片段P的平均值大于100,并且P;的均值同时大于Pa的均值以及Pa的均值,则可以预测 这样连续的4个残基形成转角 4.重叠规则 假如预测出的螺旋区域和折叠区域存在重叠,则按照重叠区域Pa均值和P均值的相对 大小进行预测,若Pa的均值大于PB的均值,则预测为螺旋;反之,预测为折叠。的过程中，首先扫描待预测的氨基酸序列，利用一组规则发现可能成为特定二级结构成核区 域的短序列片段，然后对于成核区域进行扩展，不断扩大成核区域，直到二级结构类型可能 发生变化为止，最后得到的就是一段具有特定二级结构的连续区域。下面是 4 个简要的规则。 1. α 螺旋规则 沿着蛋白质序列寻找α螺旋核，相邻的6个残基中如果有至少4个残基倾向于形成α螺旋， 即有 4 个残基对应的Pα〉100，则认为是螺旋核。然后从螺旋核向两端延伸，直至四肽片段 Pα的平均值小于 100 为止。按上述方式找到的片段长度大于 5，并且Pα的平均值大于Pβ的 平均值，那么这个片段的二级结构就被预测为α螺旋。此外，不容许Pro在螺旋内部出现，但 可出现在C末端以及N端的前三位，这也用于终止螺旋的延伸。 2. β 折叠规则 如果相邻 6 个残基中若有 4 个倾向于形成β折叠，即有 4 个残基对应的Pβ〉100，则认 为是折叠核。折叠核向两端延伸直至 4 个残基Pβ的平均值小于 100 为止。若延伸后片段的 Pβ的平均值大于 105，并且Pβ的平均值大于Pα的平均值，则该片段被预测为β折叠。 3. 转角规则 转角的模型为四肽组合模型，要考虑每个位置上残基的组合概率，即特定残基在四肽模 型中各个位置的概率。在计算过程中，对于从第i个残基开始的连续 4 个残基的片段，将上 述概率相乘，根据计算结果判断是否是转角。如果f(i)×f(i+1)×f(i+2)×f(i+3)大于 7.5×10-5，四 肽片段Pt的平均值大于 100，并且Pt 的均值同时大于Pα的均值以及Pβ的均值，则可以预测 这样连续的 4 个残基形成转角。 4. 重叠规则 假如预测出的螺旋区域和折叠区域存在重叠，则按照重叠区域Pα均值和Pβ均值的相对 大小进行预测，若Pα 的均值大于Pβ的均值，则预测为螺旋；反之，预测为折叠