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江苏农业研究B30218 江苏农业研究 旧万数据瓷源系统 JANG SU AGRICULTU RAL RESEARCH 字出期型 1999年第20卷第2期Vol.20No.21999 数量性状基因定位的回归方法 Ⅱ.两侧标记回归分析 莫惠栋 REGRESSION METHODS FOR LOCATING QUANTITATIVE TRAIT LOCUS(QTL) II.FLAN K ING M ARKER REG RESSION AN ALYSIS Mo Huidong (Lab of Quantitative Genetics.Agric.Coll..Yangzhou Univ..Yangzhou 225009) 1一般基础 两侧标记回归是应用回归方法,搜索在染色体上的任何两个标记之间是否存在被研究的QTL及其最可 能的位置和效应。它要解决的基本问题是:1)两个标记之间如果存在一个QTL,该QTL的位置和效应与个 体或品系的表型值有什么遗传关系?②)如何发现此种关系对于前一问题,关键是要导出三点重组率。设有 AQB3个位点,AB的重组率为AB,AQ、QB的重组率分别为和电,如下图。则A和B未发生交换的概率1 AB)等于A和Q、Q和B均未发生交换的概率1T)1电)加上A和Q、Q和B均发生交换的概率电),即: 1B=)1)+电 移项得: xAB=a+电2aB 1) 式)是三点重组率数量关系的基本公式,它的假定是区间AQ和QB的交换无干扰,即彼此独立。如果完全 干扰,即AQ区间发生交换,QB区间就不能发生交换,反之亦然,则式)变为: IABh+电 在缺乏完全干扰的确实证据时,一般都使用式①)描述QTL在AB间的任一位置上的重组率。 f正7作%kmhn抽取20be6ekke0810/mymy9/my9902/90218hm(第1/9页)209H231233840 江苏农业研究/990218 江苏农业研究 JIANG SU AGRICULTURAL RESEARCH 1999年 第20卷 第2期 Vol.20 No.2 1999 数量性状基因定位的回归方法 Ⅱ. 两侧标记回归分析 莫惠栋 REGRESSION METHODS FOR LOCATING QUANTITATIVE TRAIT LOCUS (QTL) Ⅱ. FLANKING MARKER REGRESSION ANALYSIS Mo Huidong (Lab of Quantitative Genetics, Agric. Coll., Yangzhou Univ., Yangzhou 225009) 1 一般基础 两侧标记回归是应用回归方法,搜索在染色体上的任何两个标记之间是否存在被研究的QTL及其最可 能的位置和效应。它要解决的基本问题是: (1) 两个标记之间如果存在一个QTL,该QTL的位置和效应与个 体或品系的表型值有什么遗传关系? (2) 如何发现此种关系?对于前一问题,关键是要导出三点重组率。设有 AQB 3个位点,AB的重组率为rAB, AQ、 QB的重组率分别为rA和rB,如下图。则A和B未发生交换的概率(1- rAB)等于A和Q、Q和B均未发生交换的概率(1-rA)(1-rB)加上A和Q、 Q和B均发生交换的概率(rArB),即: 1-rAB=(1-rA)(1-rB)+rArB 移项得: r•AB=rA+rB-2rArB (1) 式(1)是三点重组率数量关系的基本公式,它的假定是区间AQ和QB的交换无干扰,即彼此独立。如果完全 干扰, 即AQ区间发生交换,QB区间就不能发生交换,反之亦然,则式(1)变为: r AB=rA+rB (2) 在缺乏完全干扰的确实证据时,一般都使用式(1)描述QTL在AB间的任一位置上的重组率。 file:///F|/qikan_htm抽取_2000before/kjqk(200810)/jsnyyj/jsny99/jsny9902/990218.htm(第 1/9 页)2009-12-31 23:58:40
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