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RGP,RIS,Gramene,IRGSP,RIS,RiceGD,Riceweb 第三节人类基因组生物信息学网站 HGP.HGMP.NHGRI.HGR.SHGC. 第四节拟南芥生物信息学网站 TAIR,TIGR,CSHL,MIPS,NCBI. 第五节主要蛋白质数据库 PDB.Swiss-prot.SIB.PIR.Uniprot. 第六节EST,SNP数据库 NCBI,estnumber,WWWest,Biores 第七节文献搜索网站 天网,Google,百度,Springer,,Elservier,Faculty10OO,BSBEL,清华图书馆,国家科技 图书。 第五章序列比对(5学时) 1、教学基本要求 (1)了解序列比对的原理和方法 (2)掌握几种常用的序列比对软件的应用。 2、教学基本内容 第一节序列对位排列 一、记分矩阵 二、点标方法 三、全局比对与局部比对 第二节序列比对的主要软件 -Blast,Blastn,Blastp,Blastx,BI2seq 二、Fasta3 三、CLUSTALW 第六章基因组分析常用软件简介(4学时) 1、教学基本要求 (1)了解常用基因组分析软件:RGP, RIS, Gramene, IRGSP, RIS, RiceGD, Riceweb. 第三节 人类基因组生物信息学网站 HGP,HGMP,NHGRI,HGR,SHGC. 第四节 拟南芥生物信息学网站 TAIR, TIGR, CSHL, MIPS, NCBI. 第五节 主要蛋白质数据库 PDB, Swiss-prot, SIB, PIR, Uniprot. 第六节 EST, SNP 数据库 NCBI, estnumber, WWWest, Biores. 第七节 文献搜索网站 天网,Google,百度,Springer,Elservier,Faculty1000,BSBEL,清华图书馆,国家科技 图书。 第五章 序列比对(5 学时) 1、教学基本要求 (1)了解序列比对的原理和方法; (2)掌握几种常用的序列比对软件的应用。 2、教学基本内容 第一节 序列对位排列 一、记分矩阵 二、点标方法 三、全局比对与局部比对 第二节 序列比对的主要软件 一、Blast, Blastn, Blastp, Blastx, Bl2seq 二、Fasta3 三、CLUSTALW 四、Clustalx 1.83 第六章 基因组分析常用软件简介(4 学时) 1、教学基本要求 (1)了解常用基因组分析软件;
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