CH 2+CH -C00 苄基 +NH3甘氨酰基 第二部分与给定甘氨酸的转移自由能相似,因而从该氨基酸和甘氨酸的转移 自由能之差,可以表示出侧链的疏水性。 ΔΔG:°(侧链)=ΔG:°(氨基酸)一△G°(甘氨酸) 表5-4给出了某些氨基酸侧链的疏水性数值。用这些数据可以预测氨基酸在 疏水性载体上的吸附行为(它可作为疏水性的一个函数),像聚苯乙烯或连接脂 肪族C或C链的二氧化硅,吸附系数与疏水程度成正比。具有较大的正△G1°的氨 基酸侧链是疏水性的,因此易溶于有机相而不是水相。蛋白质分子中的疏水氨 基酸残基倾向于处在蛋白质分子内部,氨基酸侧链的△G为负值时则是亲水的, 这些氨基酸残基趋向于蛋白质分子表面。这里必须提出,赖氨酸尽管被认为是 种亲水性氨基酸,但△G为正值(这是由于它有4个易溶于有机相的CH2-基)。 事实上,蛋白质分子中的赖氨酸侧链被埋藏的同时,它的ε-氨基则突出在蛋白 质分子的表面。 表5-3氨基酸的pKa和pl(25℃C) 名称 pKa pK (a-C00) C a-NH3) (R=侧链) 侧链 丙氨酸 2.34 9.69 6.00 精氨酸 9.04 12.48>12.00 天冬酰胺 2.02 8.80 5.41 天冬氨酸 1.88 9.60 3.654.60 2.77 半胱氨酸 1.96 10.28 8.188.80 5.07 谷氨酰胺 2.17 9.13 5.65 谷氨酸 2.19 9.67 4.254.60 甘氨酸 2.34 9.60 5.98 组氨酸 1.82 7.00 7.59 异亮氨酸 9.68 6.02 亮氨酸 9.60 5.98 蛋氨酸 9.21 5.74 赖氨酸 8.95 9.74 苯丙氨酸 1.83 9.13 5.48 脯氨酸 1.94 10.60 6.30苄基 甘氨酰基 3 C H - + N H C H 2 C O O 第二部分与给定甘氨酸的转移自由能相似，因而从该氨基酸和甘氨酸的转移 自由能之差，可以表示出侧链的疏水性。 ∆ ∆ Gt 0 （侧链）= ∆ Gt 0 （氨基酸）—∆ Gt 0 （甘氨酸） 表 5-4 给出了某些氨基酸侧链的疏水性数值。用这些数据可以预测氨基酸在 疏水性载体上的吸附行为（它可作为疏水性的一个函数），像聚苯乙烯或连接脂 肪族C8或C18链的二氧化硅，吸附系数与疏水程度成正比。具有较大的正∆ Gt 0 的氨 基酸侧链是疏水性的，因此易溶于有机相而不是水相。蛋白质分子中的疏水氨 基酸残基倾向于处在蛋白质分子内部，氨基酸侧链的∆ Gt 0 为负值时则是亲水的， 这些氨基酸残基趋向于蛋白质分子表面。这里必须提出，赖氨酸尽管被认为是一 种亲水性氨基酸，但 △ Gt 0 为正值（这是由于它有 4 个易溶于有机相的-CH2- 基）。 事实上，蛋白质分子中的赖氨酸侧链被埋藏的同时，它的ε-氨基则突出在蛋白 质分子的表面。 表 5-3 氨基酸的 pKa 和 pI（25℃） 名称 pKa1 （α-COO- ） pKa2 （α-NH3 + ） pKaR （R=侧链） AA 侧链* pI 丙氨酸 2.34 9.69 — 6.00 精氨酸 2.17 9.04 12.48 >12.00 10.76 天冬酰胺 2.02 8.80 — 5.41 天冬氨酸 1.88 9.60 3.65 4.60 2.77 半胱氨酸 1.96 10.28 8.18 8.80 5.07 谷氨酰胺 2.17 9.13 － 5.65 谷氨酸 2.19 9.67 4.25 4.60 3.22 甘氨酸 2.34 9.60 5.98 组氨酸 1.82 9.17 6.00 7.00 7.59 异亮氨酸 2.36 9.68 — 6.02 亮氨酸 2.30 9.60 — 5.98 蛋氨酸 2.28 9.21 — 5.74 赖氨酸 2.18 8.95 10.53 10.20 9.74 苯丙氨酸 1.83 9.13 — 5.48 脯氨酸 1.94 10.60 — 6.30