至少7-60%利用宏基因组测序得到的序列因公开数据库有限的参考基因组无法 完成恰当归类。另一显而易见的问题是，当微生物个体非常小、无完整代谢网络 时，增加了实验室对菌培养纯化的内源难度。因此，发展新的有预测微生物关系 支持的分离环境微生物群的方法很是重要。分离新的或稀有的菌种，使我们不仅 可以分析它们的理化特征，还可以让我们分析其基因组并将新的基因组作为参考 基因组探索更多的有机生物群落。我们认为培养技术与非培养技术不仅是一种互 补关系，而且是相互需要的关系。多组学需要更多的参考基因组去分析新的微生 物组，生态学家需要多组学技术去掌握群落中菌群的构成及哪些菌可以进行培养 (组学的预测功能)。为了更好的研究微生物组，在将来，需利用多组学数据分 析代谢模型而基于代谢网络预测难以培养微生物的必须营养物质。因此，微生物 组的研究不能看作是多组学数据简单的组合，而应该是多组学、纯培养及生态学 特征的交叉整合。 近来，基于比例法则(scaling law)的计算发现，数以亿计的微生物还没有 被发现。研究这些未被发现微生物是微生物学的一个巨大挑战，我们认为超越组 学范畴的策略对于发现微生物群落组成及生态学特征至关重要。简单的结合高通 量数据来发现海量的未知基因、微生物物种或代谢物，仅能提高数据库及方法学 的进步，但群落生物学性质的研究仍原地踏步。人们时常认为生物多样性只不过 是生物学研究中的一个启发点，而不去研究其真正的内涵：原始材料未来会成为 知识，现在请不要将它与知识混为一谈(impressive yet raw sources of future knowledge.something not to be confused with knowledge itself). 评语 多组学方法只是微生物研究中的一种选择，而不是唯一选择。多组学及用于 分析多组学产生数据的生物信息学的发展，使微生物研究由早期的单一菌到群落 菌，但很多微生物研究仍脱离不了对单一菌的研究，如常规的发酵过程、微生物 相关生物技术的应用。另外就是新的、稀有的菌，因有限的参考基因组，并不能 得到很好的研究。海量的组学数据将组成群落的微生物本身架空了，研究者不关 注群落本身的生态学特征，一味“俯瞰”生物群落，这是本末倒置的现象。微生物 至少 7-60%利用宏基因组测序得到的序列因公开数据库有限的参考基因组无法 完成恰当归类。另一显而易见的问题是，当微生物个体非常小、无完整代谢网络 时，增加了实验室对菌培养纯化的内源难度。因此，发展新的有预测微生物关系 支持的分离环境微生物群的方法很是重要。分离新的或稀有的菌种，使我们不仅 可以分析它们的理化特征，还可以让我们分析其基因组并将新的基因组作为参考 基因组探索更多的有机生物群落。我们认为培养技术与非培养技术不仅是一种互 补关系，而且是相互需要的关系。多组学需要更多的参考基因组去分析新的微生 物组，生态学家需要多组学技术去掌握群落中菌群的构成及哪些菌可以进行培养 （组学的预测功能）。为了更好的研究微生物组，在将来，需利用多组学数据分 析代谢模型而基于代谢网络预测难以培养微生物的必须营养物质。因此，微生物 组的研究不能看作是多组学数据简单的组合，而应该是多组学、纯培养及生态学 特征的交叉整合。 近来，基于比例法则（scaling law）的计算发现，数以亿计的微生物还没有 被发现。研究这些未被发现微生物是微生物学的一个巨大挑战，我们认为超越组 学范畴的策略对于发现微生物群落组成及生态学特征至关重要。简单的结合高通 量数据来发现海量的未知基因、微生物物种或代谢物，仅能提高数据库及方法学 的进步，但群落生物学性质的研究仍原地踏步。人们时常认为生物多样性只不过 是生物学研究中的一个启发点，而不去研究其真正的内涵：原始材料未来会成为 知识，现在请不要将它与知识混为一谈（impressive yet raw sources of future knowledge,something not to be confused with knowledge itself ）。 评语 多组学方法只是微生物研究中的一种选择，而不是唯一选择。多组学及用于 分析多组学产生数据的生物信息学的发展，使微生物研究由早期的单一菌到群落 菌，但很多微生物研究仍脱离不了对单一菌的研究，如常规的发酵过程、微生物 相关生物技术的应用。另外就是新的、稀有的菌，因有限的参考基因组，并不能 得到很好的研究。海量的组学数据将组成群落的微生物本身架空了，研究者不关 注群落本身的生态学特征，一味“俯瞰”生物群落，这是本末倒置的现象。微生物