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·356 智能系统学报 第12卷 断AD和MCI,对尽早治疗和减缓疾病的恶化是非 1 数据集 常重要的。医学上的诊断主要依靠NINCDS. ADRDA、DSM-IV等临床诊断标准,这些方法无法 本文所分析的数据集来源于阿尔茨海默病神 自动地诊断病人的病情发展状态,因此需要可以识 经影像学ADNI(htp:/adni.loni.usc.edu/),ADNI 别出细微生物标志的算法。 由国际老年研究所,生物医学成像和生物工程研究 近些年来,神经影像技术迅速发展,主要包括 所,美国食品和药物管理局,民营医药企业和非营 结构核磁共振成像(structural magnetic resonance 利组织于2003年启动。ADNI是许多学术机构和私 imaging,SMRI),弥散张量成像(diffusion tensor 营机构共同努力的结果,被招募被试者来自于美国 imaging,.DTI),功能核磁共振成像(functional MRI, 和加拿大中超过50个以上的地区。ADNI的最初目 fMRI),脑电图(electro-encephalogram,EEG)和脑磁 标是招募800名成人,年龄55~90岁之间,其中大 图(magnetoencephalography,MEG)。在fMRl、EEG 约有200个认知能力正常的老年人,400个轻度认 和MEG图像中,人们可以获取功能连接网络,用于 知障碍(MCI)患者,200个阿尔茨海默病(AD)患 者。认知正常人和MCI数据是连续3年跟踪测试 反映不同脑区的解剖连接模式。 得到的,而AD数据是连续2年跟踪测试得到的。 最近出现的研究认为,临床变量值可以用于评 在本文的研究中使用了包含临床变量值简易 估AD的阶段以及预测病情的发展。在现有的研究 精神状态检查(Mini mental state examination, 中,Cheng等t)提出了一种新的半监督多模态向量 MMSE)值的fMRI模态数据(总共139个样本),其 回归法预测临床评分:Zhang等[6提出了一种多模 中40个正常人(normal control,NC),79个MCI病人 态多任务的方法同时解决脑疾病的回归和分类问 (45个EMCI(early MCI)病人和34个LMCI(late 题:Zhu等)提出了一种基于损失函数的相似性度 MCI)病人),20个AD病人。表1给出了这些受试 量矩阵,充分利用高阶信息解决脑疾病的回归和分 者的详细信息。 类问题。然而,上述的方法都是基于脑影像的研 表1受试者信息统计表 究,而目前大多数有关功能连接网络的研究[8-]主 Table 1 Demographic information of the subjects 要关注于诊断受试人员是否患有该疾病,并不能很 AD NC EMCI LMCI 好地判断出受试人员目前所处的状态,以及受试人 样本数/个 20 40 45 34 员是否有潜在患AD的隐患。基于功能网络的研究 已经成功地应用于AD/MCI的分类诊断[o-),说 男/女 9/11 18/22 20/25 20/14 明AD/MCI引起了功能网络的变化,这为功能网络 年龄/岁 75.7±6.8 75.6±6.472.2±6.9 72.8±7.2 用于预测临床得分提供了理论保证。 MMSE 为解决已有研究所存在的不足,本文提出了一 21.0±3.5 28.4±1.7 27.5±1.7 26.7±2.3 评分 种基于脑连接网络的阿尔茨海默病临床变量值预 测的方法,用于对AD/MCI病人的临床评分进行回 2 数据预处理及特征提取方法 归分析。具体来说,首先对获取到的MRI图像做预 AD/MCI回归预测主要分为5个步骤:1)预处 处理,获得对应的功能连接网络。其次,从功能网 理,通过处理原始的MRI图像来构建功能连接网 络中提取两种特征,一种是节点的聚类系数,整个 络:2)网络节点特征提取;3)网络边权重特征的选 网络的聚类系数定义为各个节点的聚类系数的均 择:4)特征融合:5)使用SVR进行回归预测。图1 值,它可以描述网络中节点之间的连接紧密程度; 给出了本文的方法框架。 另一种是边的权重,对边的权重使用LASS0算法选 2.1数据预处理 择出具有判别性的边。最后,将上一步中经过提 对采集到的原始数据,我们使用Data Processing 取、选择后的特征合并成一个向量,用支持向量回 Assistant for Resting-State fMRI DPARSF)[12] 归机(support vector regression machine,SVRM)进行 切片时间校正(slice timing)、头动校正(motion 回归预测。 correlation)和空间正则化(spatial normalization)等标断 AD 和 MCI,对尽早治疗和减缓疾病的恶化是非 常重 要 的。 医 学 上 的 诊 断 主 要 依 靠 NINCDS⁃ ADRDA、 DSM⁃IV 等临床诊断标准,这些方法无法 自动地诊断病人的病情发展状态,因此需要可以识 别出细微生物标志的算法。 近些年来,神经影像技术迅速发展,主要包括 结构 核 磁 共 振 成 像 ( structural magnetic resonance imaging, SMRI ), 弥 散 张 量 成 像 ( diffusion tensor imaging, DTI),功能核磁共振成像( functional MRI, fMRI),脑电图(electro⁃encephalogram, EEG)和脑磁 图( magnetoencephalography, MEG)。 在 fMRI、EEG 和 MEG 图像中,人们可以获取功能连接网络,用于 反映不同脑区的解剖连接模式。 最近出现的研究认为,临床变量值可以用于评 估 AD 的阶段以及预测病情的发展。 在现有的研究 中,Cheng 等[5]提出了一种新的半监督多模态向量 回归法预测临床评分;Zhang 等[6] 提出了一种多模 态多任务的方法同时解决脑疾病的回归和分类问 题;Zhu 等[7]提出了一种基于损失函数的相似性度 量矩阵,充分利用高阶信息解决脑疾病的回归和分 类问题。 然而,上述的方法都是基于脑影像的研 究,而目前大多数有关功能连接网络的研究[8-9] 主 要关注于诊断受试人员是否患有该疾病,并不能很 好地判断出受试人员目前所处的状态,以及受试人 员是否有潜在患 AD 的隐患。 基于功能网络的研究 已经成功地应用于 AD/ MCI 的分类诊断 [10-11] ,说 明 AD/ MCI 引起了功能网络的变化,这为功能网络 用于预测临床得分提供了理论保证。 为解决已有研究所存在的不足,本文提出了一 种基于脑连接网络的阿尔茨海默病临床变量值预 测的方法,用于对 AD/ MCI 病人的临床评分进行回 归分析。 具体来说,首先对获取到的 fMRI 图像做预 处理,获得对应的功能连接网络。 其次,从功能网 络中提取两种特征,一种是节点的聚类系数,整个 网络的聚类系数定义为各个节点的聚类系数的均 值,它可以描述网络中节点之间的连接紧密程度; 另一种是边的权重,对边的权重使用 LASSO 算法选 择出具有判别性的边。 最后,将上一步中经过提 取、选择后的特征合并成一个向量,用支持向量回 归机(support vector regression machine, SVRM)进行 回归预测。 1 数据集 本文所分析的数据集来源于阿尔茨海默病神 经影像学 ADNI ( http: / / adni. loni. usc. edu / ),ADNI 由国际老年研究所,生物医学成像和生物工程研究 所,美国食品和药物管理局,民营医药企业和非营 利组织于 2003 年启动。 ADNI 是许多学术机构和私 营机构共同努力的结果,被招募被试者来自于美国 和加拿大中超过 50 个以上的地区。 ADNI 的最初目 标是招募 800 名成人,年龄 55 ~ 90 岁之间,其中大 约有 200 个认知能力正常的老年人,400 个轻度认 知障碍(MCI) 患者,200 个阿尔茨海默病(AD) 患 者。 认知正常人和 MCI 数据是连续 3 年跟踪测试 得到的,而 AD 数据是连续 2 年跟踪测试得到的。 在本文的研究中使用了包含临床变量值简易 精 神 状 态 检 查 ( Mini mental state examination, MMSE)值的 fMRI 模态数据(总共 139 个样本),其 中 40 个正常人(normal control,NC),79 个 MCI 病人 (45 个 EMCI ( early MCI) 病人和 34 个 LMCI ( late MCI)病人),20 个 AD 病人。 表 1 给出了这些受试 者的详细信息。 表 1 受试者信息统计表 Table 1 Demographic information of the subjects AD NC EMCI LMCI 样本数/ 个 20 40 45 34 男/ 女 9 / 11 18 / 22 20 / 25 20 / 14 年龄/ 岁 75.7±6.8 75.6±6.4 72.2±6.9 72.8±7.2 MMSE 评分 21.0±3.5 28.4±1.7 27.5±1.7 26.7±2.3 2 数据预处理及特征提取方法 AD/ MCI 回归预测主要分为 5 个步骤:1) 预处 理,通过处理原始的 fMRI 图像来构建功能连接网 络;2)网络节点特征提取;3)网络边权重特征的选 择;4)特征融合;5)使用 SVR 进行回归预测。 图 1 给出了本文的方法框架。 2.1 数据预处理 对采集到的原始数据,我们使用 Data Processing Assistant for Resting⁃State fMRI ( DPARSF) [12] 进行 切片 时 间 校 正 ( slice timing )、 头 动 校 正 ( motion correlation)和空间正则化(spatial normalization)等标 ·356· 智 能 系 统 学 报 第 12 卷
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