Bonhoeffer S.Stability and complexity in model ecosystems. Nature,Level 2 module in"Modelling course in population and evolutionary biology" 《生态系统模型的复杂性和稳定性》 一、背景 作者Sebastian Bonhoeffer借用二十世纪七十年代著名的理论生态学家Robert M. My所著《模拟生态系统的复杂性和稳定性》一书书名为论文标题，旨在探究模拟生态系 统中物种多样性与系统总的稳定程度的相关性。在My深入研究此问题以前，长久以来生 物学界广泛的教条式认知是：越复杂的生态系统抗外界干扰能力越强，群落的复杂性导致生 态系统的稳定性。这种判定被大量的事实例证所支持亦最初被My同意，但在随后的1972 年，他通过随机交互矩阵的本征值分析方法模拟了一个随机聚集而相互作用的物种群，观察 整个系统的发展情况，得出了大相径庭的结论一生态系统的稳定性随着系统中物种间相 互作用的比重和强度衰减，即，简单系统比复杂系统更可能趋于稳定。Bonhoeffer在May 所做的研究基础上，以一种全新的方法和视角，去审视这个问题。 二、创新点 My的随机交互矩阵的本征值分析法存在的弊端在于，他假设生态系统各种群之间的 交互作用是随机的，各物种灭绝的可能性也是随机的。这与实际并不吻合，现实中种群间的 相互影响由物种本身的特点决定，同时稀缺物种相比数量大的物种更有可能灭绝。 Bonhoeffer放弃了May的思路，通过一种以Lotka-Volterra模型(LVM)为理论基础的， 以R语言为分析工具的数学模型法去考察问题并得出结论，这也是论文最新颖独特之处。 首先，R语言是主要用于统计分析和绘图的一种数学计算环境，它提供一些集成的统计 工具及各种数学计算、统计计算的函数，使用者只需指定数据库和若干参数便可灵活机动地Bonhoeffer S. Stability and complexity in model ecosystems. Nature,Level 2 module in “Modelling course in population and evolutionary biology” 《生态系统模型的复杂性和稳定性》 一、背景 作者 Sebastian Bonhoeffer 借用二十世纪七十年代著名的理论生态学家 Robert M. May 所著《模拟生态系统的复杂性和稳定性》一书书名为论文标题，旨在探究模拟生态系 统中物种多样性与系统总的稳定程度的相关性。在 May 深入研究此问题以前，长久以来生 物学界广泛的教条式认知是：越复杂的生态系统抗外界干扰能力越强，群落的复杂性导致生 态系统的稳定性。这种判定被大量的事实例证所支持，亦最初被 May 同意。但在随后的 1972 年，他通过随机交互矩阵的本征值分析方法模拟了一个随机聚集而相互作用的物种群，观察 整个系统的发展情况，得出了大相径庭的结论——生态系统的稳定性随着系统中物种间相 互作用的比重和强度衰减，即，简单系统比复杂系统更可能趋于稳定。Bonhoeffer 在 May 所做的研究基础上，以一种全新的方法和视角，去审视这个问题。 二、创新点 May 的随机交互矩阵的本征值分析法存在的弊端在于，他假设生态系统各种群之间的 交互作用是随机的，各物种灭绝的可能性也是随机的。这与实际并不吻合，现实中种群间的 相互影响由物种本身的特点决定，同时稀缺物种相比数量大的物种更有可能灭绝。 Bonhoeffer 放弃了 May 的思路，通过一种以 Lotka-Volterra 模型(LVM)为理论基础的、 以 R 语言为分析工具的数学模型法去考察问题并得出结论，这也是论文最新颖独特之处。 首先，R 语言是主要用于统计分析和绘图的一种数学计算环境，它提供一些集成的统计 工具及各种数学计算、统计计算的函数，使用者只需指定数据库和若干参数便可灵活机动地