在时,α-螺旋中断,产生一个结节。 (2)β-折叠片:第二种常见的二级结构 两条或多条相当伸展的多肽链侧向通过氢键形成的折叠片状结构, 如P210图5-17。 肽链主链呈锯齿状,肽链长轴互相平行。 氢键:在不同的肽链间或同一肽链的不同肽段间形成,氢键与肽链 长轴接近垂直 R基:交替分布在片层平面两侧。 有两种类型:平行结构(相邻肽链同向)和反平行结构(相邻肽链反向), 见P210图5-18。 (3)β转角和β-凸起 β-转角是球状蛋白的一种简单的二级结构元件。为第一个氨基酸残 基的羰基与第四个残基的NH氢键键合,形成一紧密的环在肽链回折或 弯曲时形成,使多肽链出现180急剧回折,见P211图5-19。 B-转角处Gly和Pro出现几率很高。 β-凸起:是在β-折叠股中额外插入一个残基,凸起股产生小弯曲 (P212图5-20),可引起肽链方向稍有改变 (4)无规卷曲:泛指那些不能归入明确的二级结构的多肽区段,实际上不是 完全无规,而是像其他二级结构那样具有明确而稳定的结构。常构成酶 的活性部位和蛋白质的功能部位。 (五)超二级结构 若干相邻的二级结构单元彼此相互作用,形成种类不多、有规则的 级结构组合或二级结构串,在多种蛋白质中充当三级结构的构件,如P221 图5-29所示,有αa,βαβ等。 (六)结构域 多肽链在二级结构或超二级结构基础上形成的三级结构(局部折叠 区),是相对独立的紧密球状实体,称为结构域或域,是球状蛋白质的独 立折叠单位。 对于较小的球状蛋白质分子或亚基,结构域就是三级结构;对于较大的球 状蛋白之或亚基,其三级结构往往由两个或多个结构域缔合而成,为多结 构域 结构域形成再缔合成三级结构动力学更为合理,特定三维排布的结构 域形成,有利于结构域之间活性中心的形成,结构域之间的柔性肽链形成 的铰链区有利于活性中心与底物结合,以及别构中心结合调节物发生别构 效应 (七)球状蛋白质的三级结构 球状蛋白质三级结构具有明显的折叠层次 二级结构—-超二级结构—结构域一-三级结构一-四级结构(多 聚体) 分子是紧密球体或椭球状实体,所有原子体积占72-77%,空腔约 25%。疏水侧链埋藏在分子内部,亲水侧链暴露在分子表面,球状蛋白是 水溶性的。球状蛋白表面上的疏水空穴常用于结合底物、效应物等配体, 为行使生物功能的活性部位。 (八)蛋白质折叠和结构预测在时，α-螺旋中断，产生一个结节。 （2） β-折叠片：第二种常见的二级结构 两条或多条相当伸展的多肽链侧向通过氢键形成的折叠片状结构， 如 P210 图 5-17。 肽链主链呈锯齿状，肽链长轴互相平行。 氢键：在不同的肽链间或同一肽链的不同肽段间形成，氢键与肽链 长轴接近垂直。 R 基：交替分布在片层平面两侧。 有两种类型：平行结构（相邻肽链同向）和反平行结构（相邻肽链反向）， 见 P210 图 5-18。 （3） β-转角和β-凸起 β-转角是球状蛋白的一种简单的二级结构元件。为第一个氨基酸残 基的羰基与第四个残基的 N-H 氢键键合，形成一紧密的环在肽链回折或 弯曲时形成，使多肽链出现 1800 急剧回折，见 P211 图 5-19。 β-转角处 Gly 和 Pro 出现几率很高。 β-凸起：是在β-折叠股中额外插入一个残基，凸起股产生小弯曲 （P212 图 5-20），可引起肽链方向稍有改变。 （4） 无规卷曲：泛指那些不能归入明确的二级结构的多肽区段，实际上不是 完全无规，而是像其他二级结构那样具有明确而稳定的结构。常构成酶 的活性部位和蛋白质的功能部位。 （五）超二级结构 若干相邻的二级结构单元彼此相互作用，形成种类不多、有规则的二 级结构组合或二级结构串，在多种蛋白质中充当三级结构的构件，如 P221 图 5-29 所示，有αα，βαβ等。 （六）结构域 多肽链在二级结构或超二级结构基础上形成的三级结构（局部折叠 区），是相对独立的紧密球状实体，称为结构域或域，是球状蛋白质的独 立折叠单位。 对于较小的球状蛋白质分子或亚基，结构域就是三级结构；对于较大的球 状蛋白之或亚基，其三级结构往往由两个或多个结构域缔合而成，为多结 构域。 结构域形成再缔合成三级结构动力学更为合理，特定三维排布的结构 域形成，有利于结构域之间活性中心的形成，结构域之间的柔性肽链形成 的铰链区有利于活性中心与底物结合，以及别构中心结合调节物发生别构 效应。 （七）球状蛋白质的三级结构 球状蛋白质三级结构具有明显的折叠层次： 二级结构→超二级结构→结构域→三级结构→四级结构（多 聚体）。 分子是紧密球体或椭球状实体，所有原子体积占 72~77%，空腔约 25%。疏水侧链埋藏在分子内部，亲水侧链暴露在分子表面，球状蛋白是 水溶性的。球状蛋白表面上的疏水空穴常用于结合底物、效应物等配体， 为行使生物功能的活性部位。 （八）蛋白质折叠和结构预测