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断裂与水分子形成的氢键不能被新的碱基配对氢键替代,就无法形成双链DNA。也就是说,两条 DNA单链序列不互补,形成双链就不利。(3)在双螺旋结构中,配对碱基是平行的,一层一层堆 积。两层之间的距离是3.4A。此时碱基平面间大多数原子间的距离是3.6A左右,处于范德华力范围 内。即使在单链DNA中,碱基也倾向于堆积。但是在双螺旋DNA结构中,碱基堆积和范德华力达 到最佳的状态。(4)疏水效应有助于碱基堆积。碱基疏水,将碱基置于双螺旋内部有助于它们远 离水分子更为有利。 c. 图1.13DNA分子中的静电相互作用。DNA双螺旋的每个单位都有一个磷酸基团(磷原子用紫色标 出),磷酸基团带有负电荷。用红线标出了一个磷酸基团与其它几个磷酸基团的相互排斥作用。这 种排斥作用不利于双螺旋的形成。 van der Waals contacts 图1.14碱基堆积。在DNA双链中,相邻的碱基对平面间相互堆积,每个碱基对的原子与相邻碱基 对的原子密切接触至范德华距离。中心的一对碱基用深蓝色标出,相邻碱基对用浅蓝色标出。用红 色标出了几个范德华作用。断裂与水分子形成的氢键不能被新的碱基配对氢键替代,就无法形成双链DNA。也就是说,两条 DNA单链序列不互补,形成双链就不利。(3)在双螺旋结构中,配对碱基是平行的,一层一层堆 积。两层之间的距离是3.4A。此时碱基平面间大多数原子间的距离是3.6A左右,处于范德华力范围 内。即使在单链DNA中,碱基也倾向于堆积。但是在双螺旋DNA结构中,碱基堆积和范德华力达 到最佳的状态。(4)疏水效应有助于碱基堆积。碱基疏水,将碱基置于双螺旋内部有助于它们远 离水分子更为有利。 图1.13 DNA分子中的静电相互作用。DNA双螺旋的每个单位都有一个磷酸基团(磷原子用紫色标 出),磷酸基团带有负电荷。用红线标出了一个磷酸基团与其它几个磷酸基团的相互排斥作用。这 种排斥作用不利于双螺旋的形成。 图1.14 碱基堆积。在DNA双链中,相邻的碱基对平面间相互堆积,每个碱基对的原子与相邻碱基 对的原子密切接触至范德华距离。中心的一对碱基用深蓝色标出,相邻碱基对用浅蓝色标出。用红 色标出了几个范德华作用
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