实验3 BLAST及多序列比对(4学时) 实验目的：学习序列比对工具BLAST、DNAMAN等的使用，能够对序列数据进行初步的分析。 实验内容：根据需要选择BLAST的方式及各种参数，用DNAMAN进行多序对比，并构建系统发树。序列的 提交Bankit的使用 实验要求：对给定的未知序列进行对库搜索，进行序列的对比分析，构建系统发育树。 实验4 DNAMAN软件绘制物理图谱(4) 实验目的：DNAMAN软件绘制物理图谱。 实验内容：DNAMAN软件绘制物理图普 实验要求：从NCBI网站上下载 一个基因工程载体，并绘制物理图谱。 实验5 DNAMAN软件的其它应用(4 实验目的：DNAMAN的其它功能。 实验内容：DNAMAN软件中物理图谱的制作、数据的转换、PCR引物的设计等。 实验要求：学会PCR引物的设计，物理图谱的制各及DNAMAN的其它功能。 实验6考试 设计 一方案 从网上下载 一个基因序列，并设计引物，用PCR方法扩增目的基因，将目的基因用大肠杆南 载体进行表达或将目的基因导入植物中。 八、教材与参考书： 本课程选用教材： 拟国屏等编《生物信息学》科学出版社，2002 本课程推荐参考书： 张成岗，贺福初《生物信息学》科学出版社2002 九、考核方式： 实验结果评定成绩。 执笔：胡汉桥 审核： 批淮人： 时间 实验 3 BLAST 及多序列比对（4 学时） 实验目的：学习序列比对工具 BLAST、DNAMAN 等的使用，能够对序列数据进行初步的分析。 实验内容：根据需要选择 BLAST 的方式及各种参数，用 DNAMAN 进行多序对比，并构建系统发树。序列的 提交 Bankit 的使用。 实验要求：对给定的未知序列进行对库搜索，进行序列的对比分析，构建系统发育树。 实验 4 DNAMAN 软件绘制物理图谱(4) 实验目的：DNAMAN 软件绘制物理图谱。 实验内容：DNAMAN 软件绘制物理图谱。 实验要求：从 NCBI 网站上下载一个基因工程载体，并绘制物理图谱。 实验 5 DNAMAN 软件的其它应用(4) 实验目的：DNAMAN 的其它功能。 实验内容：DNAMAN 软件中物理图谱的制作、数据的转换、PCR 引物的设计等。 实验要求：学会 PCR 引物的设计，物理图谱的制备及 DNAMAN 的其它功能。 实验 6 考试 设计一方案，从网上下载一个基因序列，并设计引物，用 PCR 方法扩增目的基因，将目的基因用大肠杆菌 载体进行表达或将目的基因导入植物中。 八、教材与参考书： 本课程选用教材： 赵国屏等编 《生物信息学》科学出版社，2002 本课程推荐参考书： 张成岗，贺福初 《生物信息学》 科学出版社 2002 九、考核方式: 实验结果评定成绩。 执笔:胡汉桥 审核: 批准人: 时间: