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基因工程原理实验指导 实验一质粒的制备 质粒是携带外源基因进入细菌中扩增或表达的主要载体,它在基因操作中具 有重要作用。质粒的分离与提取是最常用、最基本的实验技术】 质粒的提取方法很多,大多包括3个主要步骤:细菌的培养、细菌的收集和裂 解、质粒DNA的分离和纯化。本实验以碱裂解法为例,介绍质粒的抽提过程。 实验目的:掌握碱裂解法抽提质粒的原理、步骤及各试剂的作用。 实验材料:含有质粒pUC18载体的大肠杆菌菌液,克降有水稻外源片段 的BAC的大肠杆菌菌液。 实验原理:在pH12.0~12.6碱性环境中,细菌的线性大分子量染色体 DNA变性分开,而共价闭环的质粒DNA虽然变性但仍处于拓扑缠绕状态。将 pH调至中性并有高盐存在及低温的条件下,大部分染色体DNA、大分子量的 RNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍然为可溶状 态。通过离心,可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质 粒DNA尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。 实验步骤: 1.取含有pUC18质粒的大肠杆菌菌液于LA培养基上37℃过夜培养 2.用无菌牙签挑取单菌落,接种于含有Amp抗生素的LB培养基中,37℃ 摇床,250rmin过夜培养: 3.吸取1.5ml菌液,12000g离心2分钟,收集菌体,倒掉菌液:吸取1.5 ml菌液,再次收集菌体,尽量将菌液倒干净: 4.加入300μ1溶液1振荡打匀,重新悬浮细胞,震荡混匀(注意:应彻底 打匀沉淀或碎块): 5.加入300μ1溶液Ⅱ,轻柔颠倒混匀,放置至清亮,一般不超过5分钟: 6.加入300μ1溶液Ⅲ颠倒混匀,放置于冰上10分钟,使杂质充分沉淀: 12000g离心10分钟: 7.吸取8O0μ1上清液(注意:不要吸取到飘浮的杂质)至另一Eppendorf管 中,加入23体积的异丙醇,室温下放置5分钟: 12000g常温离心15分钟: 8.倒尽上清,加75%乙醇浸洗除盐(放置片刻或离心3分钟后倒去上清): 9.室温放置或超净台上风干DNA: 10.加40μ1灭菌超纯水或TE溶解: 11.质粒、BAC的质量检测,于-20℃保存. 基因工程原理实验指导 6 实验一 质粒的制备 质粒是携带外源基因进入细菌中扩增或表达的主要载体,它在基因操作中具 有重要作用。质粒的分离与提取是最常用、最基本的实验技术。 质粒的提取方法很多,大多包括 3 个主要步骤:细菌的培养、细菌的收集和裂 解、质粒 DNA 的分离和纯化。本实验以碱裂解法为例,介绍质粒的抽提过程。 实验目的: 掌握碱裂解法抽提质粒的原理、步骤及各试剂的作用。 实验材料: 含有质粒 pUC18 载体的大肠杆菌菌液,克隆有水稻外源片段 的 BAC 的大肠杆菌菌液。 实验原理: 在 pH 12.0~12.6 碱性环境中,细菌的线性大分子量染色体 DNA 变性分开,而共价闭环的质粒 DNA 虽然变性但仍处于拓扑缠绕状态。将 pH 调至中性并有高盐存在及低温的条件下,大部分染色体 DNA 、大分子量的 RNA 和蛋白质在去污剂 SDS 的作用下形成沉淀,而质粒 DNA 仍然为可溶状 态。通过离心,可除去大部分细胞碎片、染色体 DNA 、 RNA 及蛋白质,质 粒 DNA 尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提进一步纯化质粒 DNA 。 实验步骤: 1. 取含有 pUC18 质粒的大肠杆菌菌液于 LA 培养基上 37 ℃过夜培养; 2. 用无菌牙签挑取单菌落,接种于含有 Amp 抗生素的 LB 培养基中, 37 ℃ 摇床,250 r/min 过夜培养; 3. 吸取 1.5 ml 菌液, 12000 g 离心 2 分钟,收集菌体,倒掉菌液;吸取 1.5 ml 菌液,再次收集菌体,尽量将菌液倒干净; 4. 加入 300 μl 溶液 I 振荡打匀,重新悬浮细胞,震荡混匀(注意:应彻底 打匀沉淀或碎块); 5. 加入 300 μl 溶液 II ,轻柔颠倒混匀,放置至清亮,一般不超过 5 分钟; 6. 加入 300 μl 溶液 III 颠倒混匀,放置于冰上 10 分钟,使杂质充分沉淀; 12000 g 离心 10 分钟; 7. 吸取 800 μl 上清液(注意:不要吸取到飘浮的杂质)至另一 Eppendorf 管 中,加入 2/3 体积的异丙醇,室温下放置 5 分钟; 12000 g 常温离心 15 分钟; 8. 倒尽上清,加 75 %乙醇浸洗除盐(放置片刻或离心 3 分钟后倒去上清); 9. 室温放置或超净台上风干 DNA ; 10. 加 40 μl 灭菌超纯水或 TE 溶解; 11. 质粒、 BAC 的质量检测,于 -20 ℃保存
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