化合物。这些生物大分子结构的解析,包括一级结构(序列)和高级结构(空间结构)的解 析,是一项十分艰巨的工作。现在有十万余种蛋白质的一级结构已测得,其中近万种三维结 构已获得,并达到高分辨率。人类所有基因的DNA序列测定已完成。生物大分子的序列测 定和空间结构的测定或模建都离不开计算机的辅助。比如在蛋白质测序中,用二维聚丙烯酰 胺凝胶电泳技术,将蛋白质经过二次垂直方向上的分离,其结果可能为一拥有近千个蛋白点 的电泳图。根据氨基酸分析鉴定,用计算机软件进行图像分析和数据处理,以此结果上网查 询蛋白质数据库或与之对应的基因库,分析与已知的结构是否匹配,确定出是否为一新的蛋 白质。利用计算机的计算、图形显示等功能,可以模拟出分子的三维结构 1.7计算机辅助合成路线设计 药物研究与开发的重要一环是药物的合成。合成路线的设计,可以凭合成化学家的经验 并参考文献方法,也可以从已知知识中找出共同规律,类比推断出合成路线。利用计算机辅 助设计(CAD)技术进行有机合成设计自20世纪60年代后期以来日益得到重视,其理论与 实践日臻完善。基于已知合成路线的检索型设计是用合成反应管理软件把文献中已积累的大 量有机合成路线存人计算机,同时将可供选择使用的原料信息也存储起来,制成合成反应数 据库。只要研究人员提出欲合成的化合物,计算机就可以根据特定的要求去选择最佳的合成 路线。在人工智能技术的辅助下,基于反应规律的推理型设计还可推断出数据库中所没有的 新的合成路线。 1.8化学制药过程 一般的药品开发都要经过实验室小试、中试,再到工业大规模生产这几个过程。利用计 算机模拟技术,可以绕过小试和中试这两个阶段,直接进行一次放大。这项技术根据实验室 所做的化学反应实验结果和工业生产中的各种经验及规律,提出合理的数学模型,通过计算 机模拟工业生产,获得大规模工业生产设计所需要的各种数据,缩短药物开发生产的时间 现已出现了用计算机和机器人控制的自动化制药工厂,药物在密闭的空间生产,使药物生产 污染少、品质优、效率高 1.9数据源的共享、国际联检与计算机网络通讯 随着药学科学的飞速发展和与其他相关学科的相互渗透,文献数量剧增,人工检索已难 于适应要求。借助计算机检索服务,可以在几分钟内完成一个课题的全面检索工作,大大节 省科研人员查找资料的时间。世界各科技强国都致力于发展计算机检索系统,并进行国际性 大协作,把科学技术情报作为世界各国共享的财富。 使用计算机可进行定期情报检索,根据用户预定的主题词定期从现刊中检索出有关情 报,跟踪同类专题的动态和进展;也可进行追溯检索,普查一定时段内的情报资料,全面系 统了解有关课题的信息;还可进行国际联机检索,解决某些课题检索的急需,有着较高的时 效性。国际联检系统终端往往通过电话线或通讯网络与多个世界联机系统相联,可多达几百个 数据库,具有极大的信息量,数据库更新周期又较短。缺点是上机操作复杂,检索费用高 DIALOG是目前世界上最大的国际联检系统,从1963年开始建造,1972年正式使用 存储专业面很广,包括自然科学和社会科学各个领域,其中与药物设计有关的有CA SEARCH等数据库。据统计,在国内已开通十多个国际联检系统, DIALOG使用最多,占