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3、稳定双螺旋结构的因紊 ①碱基堆积力(主要因素)形成疏水环境。 ②碱基配对的氢键。GC含量越多,越稳定。 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键,中和了磷酸基上的负电荷间的斥力,有助 于DNA稳定 ④碱基处于双螺旋内部的疏水环境中,可免受水溶性活性小分子的攻击 三、DNA二级结构的不均性和多型性 DNA二级结构的不均性 l、反向重复序列(回文序列) DNA序列中,以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同,即对称轴一侧的片段旋转180°后, 与另一侧片段对称重复 较长的回文结构,在某些因素作用下,可形成茎环式的十字结构和发夹结构。功能还不完全清楚,但转录的终止作用 与回文结构有关。 较短的回文序列,可作为一种特别信号,如限制性核酸内切酶的识别位点。 2、富含AT的序列 高等生物中,A+T与C+G的含量差不多相等,但在它们的染色体的某一区域,AT含量可能很高。 在很多有重要调节功能(不是蛋白质编码区)的DNA区段都富含AT碱基对。特别是在复制起点和启动的Pbw框 的DNA区中,富含AT对。这对于复制和转录的起始十分重要,因为GC对有三个氢键,而AT对只有两个氢键,此处 双键易解开。 DNA二级结构的多型性 P339表5-6A-、B-、ZDNA的比较 l、B-DNA:典型的 Watson-Crick双螺旋DN 右手双股螺旋 每圈螺旋104个碱基对 每对 螺旋扭角36 螺距:3.32nm 碱基倾角:1° 2、ADNA 在相对湿度75%以下所获得的DNA纤维3、稳定双螺旋结构的因素 ①碱基堆积力(主要因素) 形成疏水环境。 ②碱基配对的氢键。GC含量越多,越稳定。 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键,中和了磷酸基上的负电荷间的斥力,有助 于 DNA 稳定。 ④碱基处于双螺旋内部的疏水环境中,可免受水溶性活性小分子的攻击。 三、 DNA 二级结构的不均一性和多型性 (一) DNA 二级结构的不均一性 1、反向重复序列(回文序列) DNA序列中,以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同,即对称轴一侧的片段旋转180°后, 与另一侧片段对称重复。 较长的回文结构,在某些因素作用下,可形成茎环式的十字结构和发夹结构。功能还不完全清楚,但转录的终止作用 与回文结构有关。 较短的回文序列,可作为一种特别信号,如限制性核酸内切酶的识别位点。 2、富含 A T的序列 高等生物中,A+T 与C+G的含量差不多相等,但在它们的染色体的某一区域,A T 含量可能很高。 在很多有重要调节功能(不是蛋白质编码区)的DNA区段都富含A T碱基对。特别是在复制起点和启动的Pribnow框 的 DNA区中,富含A T对。这对于复制和转录的起始十分重要,因为G C对有三个氢键,而A T对只有两个氢键,此处 双键易解开。 (二) DNA 二级结构的多型性 P339 表 5-6 A-、B-、Z-DNA 的比较 1、B—DNA:典型的Watson-Crick双螺旋DNA 右手双股螺旋 每圈螺旋10.4个碱基对 每对 螺旋扭角36° 螺距:3.32nm 碱基倾角:1° 2、A-DNA 在相对湿度75%以下所获得的DNA 纤维
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