第六章 核酸 核酸是遗传物质 868年瑞士 Meshε从脓细胞的细胞核中分离出可溶于碱而不溶于稀酸的酸性物质 间接证据:同一种生物的不同种类的不同生长期的细胞,DNA含量基本恒定 直接证据:T2噬菌体DNA感染Ecoi 用35S标记噬菌体蛋白质,感染 E coli,又用3P标记噬菌体核酸,感染Ecol DNA、RNA的分布(DNA在核内,RNA在核外) 第一节核酸的化学组成 核酸是一种线形多聚核苷酸,基本组成单位是核苷酸。 构层次 核酸 核苷酸 磷酸 核苷 戊糖碱基 组成核酸的戊糖有两种::D核糖和D2-脱氧核糖,据此,可以将核酸分为两种:核糖核酸(RNA和脱氧核糖核酸 (DNA) P330表5-1两类核酸的基本化学组成 碱基 1.嘌呤碱: 腺嘌呤 鸟嘌呤 2.嘧啶碱: 胞嘧啶尿嘧啶胸腺嘧啶 P331结构式 3.修饰碱基 植物中有大量5-甲基胞嘧啶。 E.col噬菌体中,5羟甲基胞嘧啶代替C。 稀有碱基:100余种,多数是甲基化的产物 DNA由A、G、C、T碱基构成。 RNA由A、G、C、U碱基构成 核苷 核苷由戊糖和碱基缩合而成,糖环上C1与嘧啶碱的№或与嘌呤碱的N连接。 核酸中的核苷均为β型核苷
第六章 核 酸 核酸是遗传物质 1868 年瑞士Miesher.从脓细胞的细胞核中分离出可溶于碱而不溶于稀酸的酸性物质。 间接证据：同一种生物的不同种类的不同生长期的细胞，DNA含量基本恒定。 直接证据：T2噬菌体DNA感染E.coli 用 35S标记噬菌体蛋白质，感染E.coli，又用32P标记噬菌体核酸，感染E.coli DNA、RNA的分布（DNA 在核内，RNA在核外）。 第一节 核酸的化学组成 核酸是一种线形多聚核苷酸，基本组成单位是核苷酸。 结构层次： 核 酸 核苷酸 磷酸 核苷 戊糖 碱基 组成核酸的戊糖有两种：：D-核糖和 D-2-脱氧核糖，据此，可以将核酸分为两种：核糖核酸（RNA）和脱氧核糖核酸 （DNA） P330 表 5-1 两类核酸的基本化学组成 一、 碱基 1. 嘌呤碱： 腺嘌呤 鸟嘌呤 2. 嘧啶碱： 胞嘧啶 尿嘧啶 胸腺嘧啶 P331 结构式 3. 修饰碱基 植物中有大量5-甲基胞嘧啶。 E.coli噬菌体中，5-羟甲基胞嘧啶代替C。 稀有碱基：100余种，多数是甲基化的产物。 DNA 由 A、G、C、T 碱基构成。 RNA 由 A、G、C、U 碱基构成。 二、 核苷 核苷由戊糖和碱基缩合而成，糖环上C1与嘧啶碱的N1或与嘌呤碱的N9连接。 核酸中的核苷均为β-型核苷
P332结构式腺嘌呤核苷胞嘧啶脱氧核苷 DNA的戊糖是:脱氧核糖 RNA的戊糖是:核糖 核苷酸 核苷中戊糖C3、C羟基被磷酸酯化,生成核苷酸。 l、构成DNA、RNA的核苷酸 P333表53 2、细胞内游离核苷酸及其行生物 ①核苷5-多磷酸化合物 ATP、GTP、CTP、ppA、pG 在能量代谢和物质代谢及调控中起重要作用。 ②环核苷酸 CAMP (3, 5 -CAMP) CGMP (3,, 5'-CGMP) 它们作为质膜的激素的第二信使起作用,cAMP调节细胞的糖代谢、脂代谢。 ③核苷5’多磷酸3’多磷酸化合物 ppGpp pppGpp ppAp ④核苷酸衍生物 HSCOA、NAD、NADP、FAD等辅助因子 GDP半乳糖、GDP-葡萄糖等是糖蛋白生物合成的活性糖基供体。 第二节DNA的结构 级:脱氧核苷酸分子间连接方式及排列顺序 级:DNA的两条多聚核苷酸链间通过氢键形成的双螺旋结构。 三级:DNA双链进步折叠卷曲形成的构象。 DNA的一级结构 DNA的一级结构是4种脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dOMP、dIM)通过3、5磷酸二酯键连接起来的线形多聚体。 3/、5/磷酸二酯键是DNA、RNA的主链结构。 P334图5-1 书写方法:5→3/: 5'- pApCpTpG-3,或5…ACTG…3”(在DNA中,3/OH一般是游离的)
P332 结构式 腺嘌呤核苷 胞嘧啶脱氧核苷 DNA 的戊糖是：脱氧核糖 RNA 的戊糖是：核糖 三、 核苷酸 核苷中戊糖C3、C5羟基被磷酸酯化，生成核苷酸。 1、构成 DNA、RNA的核苷酸 P333 表 5-3 2、细胞内游离核苷酸及其衍生物 ①核苷 5’-多磷酸化合物 ATP、GTP、CTP、ppppA、ppppG 在能量代谢和物质代谢及调控中起重要作用。 ②环核苷酸 cAMP（3’，5’-cAMP） cGMP（3’，5’-cGMP） 它们作为质膜的激素的第二信使起作用，cAMP调节细胞的糖代谢、脂代谢。 ③核苷 5’多磷酸3’多磷酸化合物 ppGpp pppGpp ppApp ④核苷酸衍生物 HSCoA、 NAD+、NADP+、FAD 等辅助因子。 GDP-半乳糖、GDP-葡萄糖等是糖蛋白生物合成的活性糖基供体。 第二节 DNA 的结构 一级：脱氧核苷酸分子间连接方式及排列顺序。 二级：DNA 的两条多聚核苷酸链间通过氢键形成的双螺旋结构。 三级：DNA 双链进一步折叠卷曲形成的构象。 一、 DNA 的一级结构 DNA的一级结构是4种脱氧核苷酸（dAMP、dGMP、dCMP、dTMP）通过3/、5/-磷酸二酯键连接起来的线形多聚体。 3/、5/-磷酸二酯键是DNA、RNA的主链结构 。 P334 图 5-1 书写方法：5/ → 3/： 5’-pApCpTpG-3’，或5’…ACTG…3’（在DNA 中，3/-OH一般是游离的）
在DNA分子中,不变的骨架成分磷酸二酯键被逐渐省略,真正代表DNA生物学意义的是碱基的排列顺序。 遗传信息贮存在DNA的碱基排列顺序中,生物界生物的多样性即寓于DNA分子4种核苷酸千变万化的精确的排列顺 序中 DNA的二级结构 1953年, Watson和αidk根据 haran规律和DNA№a盐纤维的Ⅹ光衍射数据提出了DNA的双螺旋结构模型 l、 Watson-〔rikk双螺旋结构建立的根据 ① Changan规律1950年 a.所有DNA中,A=,G=C且A+G=C+T P334表54。 b.DNA的碱基组成具有种的特异性,即不同生物的DNA皆有自己独特的碱基组成。 c.DNA碱基组成没有组织和器官的特异性 d.年龄、营养状况、环境等因素不影响DNA的碱基组成。 ②DNA的Na盐纤维和DNA晶体的X光衍射分析 相对湿度92%,DNA钠盐结晶,B_DNA 相对湿度75%,DNA钠盐结晶,ADNA。 DNA。 生物体内DNA均为BDNA。 Franklin的工作 2、 Watson-Crick双螺旋结构模型 P335图5-2 a两条反平行的多核苷酸链绕同一中心轴相缠绕,形成右手双股螺旋,一条5→3,另·条3ˆ-5 b嘌呤与嘧啶碱位于双螺旋的内侧,磷酸与脱氧核糖在外侧。磷酸与脱氧核糖彼比通过3、5-磷酸-酯键相连接,构 成DNA分子的骨架。 2 nm 宽0m 大沟 深075nm c.螺旋平均直径2nm 每圈螺旋含10个核苷酸 碱基堆积距离:034m 螺距:34mm d两条核苷酸链,依靠彼此碱基间形成的氢链结合在一起。碱基平面垂直于螺旋轴。A=T、G=C 图5- 碱基互补原则具有极重要的生物学意义,DNA的复制、转录、反转录等的分子基础都是碱基互补
在 DNA 分子中，不变的骨架成分磷酸二酯键被逐渐省略，真正代表DNA生物学意义的是碱基的排列顺序。 遗传信息贮存在DNA的碱基排列顺序中，生物界生物的多样性即寓于DNA分子4种核苷酸千变万化的精确的排列顺 序中。 二、 DNA 的二级结构 1953 年，Watson 和Crick 根据Chargaff 规律和DNA Na 盐纤维的X 光衍射数据提出了DNA的双螺旋结构模型。 1、Watson-Crick双螺旋结构建立的根据 ①Chargaff 规律 1950年 a. 所有 DNA中，A=T，G=C 且 A+G=C+T。 P334 表 5—4。 b. DNA 的碱基组成具有种的特异性，即不同生物的DNA 皆有自己独特的碱基组成。 c. DNA 碱基组成没有组织和器官的特异性。 d. 年龄、营养状况、环境等因素不影响DNA的碱基组成。 ② DNA 的 Na 盐纤维和DNA 晶体的X 光衍射分析。 相对湿度92%，DNA 钠盐结晶，B—DNA。 相对湿度75%，DNA 钠盐结晶，A—DNA。 Z—DNA。 生物体内DNA 均为B—DNA。 Franklin 的工作 2、Watson-Crick双螺旋结构模型 P335 图 5—2 a.两条反平行的多核苷酸链绕同一中心轴相缠绕，形成右手双股螺旋，一条5’→3’，另一条3’→5’ b.嘌呤与嘧啶碱位于双螺旋的内侧，磷酸与脱氧核糖在外侧。磷酸与脱氧核糖彼此通过 3/、5/-磷酸二酯键相连接，构 成 DNA 分子的骨架。 宽 1.2 nm 宽 0.6nm 大沟 小沟 深 0.85nm 深 0.75nm c.螺旋平均直径2nm 每圈螺旋含10个核苷酸 碱基堆积距离：0.34nm 螺距：3.4nm d.两条核苷酸链，依靠彼此碱基间形成的氢链结合在一起。碱基平面垂直于螺旋轴。A=T、G=C P336 图 5—4 碱基互补原则具有极重要的生物学意义，DNA 的复制、转录、反转录等的分子基础都是碱基互补
3、稳定双螺旋结构的因紊 ①碱基堆积力(主要因素)形成疏水环境。 ②碱基配对的氢键。GC含量越多,越稳定。 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键,中和了磷酸基上的负电荷间的斥力,有助 于DNA稳定 ④碱基处于双螺旋内部的疏水环境中,可免受水溶性活性小分子的攻击 三、DNA二级结构的不均性和多型性 DNA二级结构的不均性 l、反向重复序列(回文序列) DNA序列中,以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同,即对称轴一侧的片段旋转180°后, 与另一侧片段对称重复 较长的回文结构,在某些因素作用下,可形成茎环式的十字结构和发夹结构。功能还不完全清楚,但转录的终止作用 与回文结构有关。 较短的回文序列,可作为一种特别信号,如限制性核酸内切酶的识别位点。 2、富含AT的序列 高等生物中,A+T与C+G的含量差不多相等,但在它们的染色体的某一区域,AT含量可能很高。 在很多有重要调节功能(不是蛋白质编码区)的DNA区段都富含AT碱基对。特别是在复制起点和启动的Pbw框 的DNA区中,富含AT对。这对于复制和转录的起始十分重要,因为GC对有三个氢键,而AT对只有两个氢键,此处 双键易解开。 DNA二级结构的多型性 P339表5-6A-、B-、ZDNA的比较 l、B-DNA:典型的 Watson-Crick双螺旋DN 右手双股螺旋 每圈螺旋104个碱基对 每对 螺旋扭角36 螺距:3.32nm 碱基倾角:1° 2、ADNA 在相对湿度75%以下所获得的DNA纤维
3、稳定双螺旋结构的因素 ①碱基堆积力（主要因素） 形成疏水环境。 ②碱基配对的氢键。GC含量越多，越稳定。 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键，中和了磷酸基上的负电荷间的斥力，有助 于 DNA 稳定。 ④碱基处于双螺旋内部的疏水环境中，可免受水溶性活性小分子的攻击。 三、 DNA 二级结构的不均一性和多型性 （一） DNA 二级结构的不均一性 1、反向重复序列（回文序列） DNA序列中，以某一中心区域为对称轴，其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同，即对称轴一侧的片段旋转180°后， 与另一侧片段对称重复。 较长的回文结构，在某些因素作用下，可形成茎环式的十字结构和发夹结构。功能还不完全清楚，但转录的终止作用 与回文结构有关。 较短的回文序列，可作为一种特别信号，如限制性核酸内切酶的识别位点。 2、富含 A T的序列 高等生物中，A+T 与C+G的含量差不多相等，但在它们的染色体的某一区域，A T 含量可能很高。 在很多有重要调节功能（不是蛋白质编码区）的DNA区段都富含A T碱基对。特别是在复制起点和启动的Pribnow框 的 DNA区中，富含A T对。这对于复制和转录的起始十分重要，因为G C对有三个氢键，而A T对只有两个氢键，此处 双键易解开。 （二） DNA 二级结构的多型性 P339 表 5-6 A-、B-、Z-DNA 的比较 1、B—DNA：典型的Watson-Crick双螺旋DNA 右手双股螺旋 每圈螺旋10.4个碱基对 每对 螺旋扭角36° 螺距：3.32nm 碱基倾角：1° 2、A-DNA 在相对湿度75%以下所获得的DNA 纤维
A-DNA也是右手双螺旋,外形粗短。 RNA-RNA、 RNA-DNA杂交分子具有这种结构。 3、ZDNA 左手螺旋的DNA。 天然B-DNA的局部区域可以形成Z0DNA。 4、DNA三股螺旋 在多聚嘧啶和多聚嘌呤组成的DNA螺旋区段,序列中有较铰长的镜像重复时,可形成局部三股螺旋,称H-DNA 镜像重复 TAT配对 CGC酸对 DNA的三链结构常出现在DNA复制、重组、转录的起始或调节位点,第三股链的存在可能使一些调控蛋白或RNA 聚合酶等难以与诙段结合,从而阻遏有关遗传信息的表达 四、环状DNA 生物体内有些DNA是以双链环状DNA的形式存在,包括: 某些病毒DNA 某些噬菌体DNA 某些细菌染色体DNA 细菌质粒DNA 真核细胞中的线粒体DNA、叶绿体DNA 环形DNA的不同构象 P340图5-8松驰环、解链环、负超螺旋 (1)、松弛环形DNA 线形DNA直接环化 (2)、解链环形DNA 线形DNA拧松后再现化 (3)、正超螺旋与负超螺旋DNA 线形DNA拧紧或拧松后再环化,成为超螺旋结构 绳子的两股以右旋方向缠绕,如果在·端使绳子向缠紧的方向旋转,再将绳子两端连接起来,会产生一个左旋的超螺 旋,以解除外加的旋转造成的胁变,这样的超螺旋叫正超螺旋。 如果在绳子一端向松缠方向旋转,再将绳子两端连接起来,会产生一个右旋的超螺旋,以解除外加的旋转所造成的胁
A-DNA 也是右手双螺旋，外形粗短。 RNA-RNA、RNA-DNA 杂交分子具有这种结构。 3、Z-DNA 左手螺旋的DNA。 天然 B-DNA的局部区域可以形成Z0-DNA。 4、DNA 三股螺旋 在多聚嘧啶和多聚嘌呤组成的DNA螺旋区段，序列中有较长的镜像重复时，可形成局部三股螺旋，称H-DNA。 镜像重复： TAT 配对 C +GC 酸对 DNA 的三链结构常出现在 DNA 复制、重组、转录的起始或调节位点，第三股链的存在可能使一些调控蛋白或 RNA 聚合酶等难以与该区段结合，从而阻遏有关遗传信息的表达。 四、 环状 DNA 生物体内有些DNA是以双链环状DNA的形式存在，包括： 某些病毒DNA 某些噬菌体DNA 某些细菌染色体DNA 细菌质粒DNA 真核细胞中的线粒体DNA、叶绿体DNA 1、环形 DNA的不同构象 P340 图 5-8 松驰环、解链环、负超螺旋 （1）、 松弛环形DNA 线形 DNA直接环化 （2）、 解链环形DNA 线形 DNA拧松后再环化 （3）、 正超螺旋与负超螺旋DNA 线形 DNA拧紧或拧松后再环化，成为超螺旋结构。 绳子的两股以右旋方向缠绕，如果在一端使绳子向缠紧的方向旋转，再将绳子两端连接起来，会产生一个左旋的超螺 旋，以解除外加的旋转造成的胁变，这样的超螺旋叫正超螺旋。 如果在绳子一端向松缠方向旋转，再将绳子两端连接起来，会产生一个右旋的超螺旋，以解除外加的旋转所造成的胁
变,这样的超螺旋称负超螺旋。 对于右手螺旋的DNA分子,如果每圈初级螺旋的碱基对数小于104,则其二级结构处于紧缠状态,是正超螺旋。 如果每圈初级螺旋的碱基对数大于104,则其二级结构处于松缠状态,是负超螺 2、环形DNA的拓扑学特性 以260bp组成的线形BDNA为例,螺旋周数260/104=25。 P340图25-8松驰环、解链环、负超螺旋 ①连环数(L) DNA双螺旋中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数,以L表示 松驰环:L=25 解链环:L=23 超螺旋:L=23 ②缠绕数(T) DNA分子中的 Watson-Crick螺旋数目,以T表示 松驰环T25 解链环T23 超螺旋T=25 ③超螺旋周数(扭曲数W) 松驰环W= 解链环W=0 超螺旋W=-2 L=T+W ④比连环差() 表示DNA的超螺旋程度 Lo是指松驰环形DNA的L值 天然DNA的超螺旋密度一般为003~009,平均每10bp上有39个负超螺旋。 负超螺旋DNA是由于两条链的缠绕不足引起,很易解链,易于参加DNA的复制、重组和转录等需要将两条链分开才 能进行的反应。 3、拓扑异构瘠 此酶能改变DNA拓扑异构体的L值。 ①拓扑异构酶酶Ⅰ(拧紧) 能使双链负超螺旋DNA转变成松驰形环状DAλ,每次作用可使L值增加1,同时,使松驰环状DNA转变成正超 螺旋。 ②拓扑异构酶酶Ⅱ(拧松) 能使松驰环状DNA转变成负超螺旋形DNλ,毎次催化使L减少2,冋同时能使正超螺旋转变成松驰DNA
变，这样的超螺旋称负超螺旋。 对于右手螺旋的DNA分子，如果每圈初级螺旋的碱基对数小于10.4，则其二级结构处于紧缠状态，是正超螺旋。 如果每圈初级螺旋的碱基对数大于10.4，则其二级结构处于松缠状态，是负超螺旋。 2、环形 DNA的拓扑学特性 以 260bp组成的线形B-DNA 为例，螺旋周数260/10.4=25。 P340 图 25-8 松驰环、解链环、负超螺旋 ①连环数（L） DNA 双螺旋中，一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数，以L 表示。 松驰环：L=25 解链环：L=23 超螺旋：L=23 ②缠绕数（T） DNA 分子中的Watson-Crick螺旋数目，以T 表示 松驰环 T=25 解链环 T=23 超螺旋 T=25 ③超螺旋周数（扭曲数W） 松驰环 W=0 解链环 W=0 超螺旋 W= -2 L=T+W ④比连环差（λ） 表示 DNA的超螺旋程度 λ=（L—L0）/L0 L0 是指松驰环形DNA 的L 值 天然 DNA的超螺旋密度一般为-0.03~-0.09，平均每100bp上有3-9个负超螺旋。 负超螺旋DNA是由于两条链的缠绕不足引起，很易解链，易于参加DNA的复制、重组和转录等需要将两条链分开才 能进行的反应。 3、拓扑异构酶 此酶能改变DNA 拓扑异构体的L 值。 ①拓扑异构酶酶I（拧紧） 能使双链负超螺旋 DNA 转变成松驰形环状 DNA，每一次作用可使 L 值增加 1，同时，使松驰环状 DNA 转变成正超 螺旋。 ②拓扑异构酶酶II（拧松） 能使松驰环状DNA转变成负超螺旋形DNA，每次催化使L 减少2，同时能使正超螺旋转变成松驰DNA
五、染色体的结构 l、大肠杆菌染色体 大肠杆菌染色体是由42×10bp组成的双链环状DNA分子,约300个基因。 大肠杆菌DNA结合蛋白 每个细胞 H 两个28KD的相同亚基 30000个二聚体 HU 两个各9KD的不同亚基 4000个二体聚体 HLP 17KD的亚基 2000个单体 3KD的亚基 未知 这些DNA结合蛋白,使42×10bp的Eoi染色体DNA压缩成为一个手脚架形结构,结构中心是多种DNA结合蛋 白,DNA双螺旋分子有许多位点与这些蛋白结合,形成约100个小区,每个小区的DNA都是负超螺旋,一个小区的DNA 有两个端点被蛋白质固定,每个小区相对独立。 用极微量的DNA酶Ⅰ处理时,只能使少量小区的DNA成为松驰状态,而其它小区仍然保持超螺旋状态。 2、真核生物染色体 主要由组蛋白和DNA组成 组蛋白是富含碱性aa(lys、Arg舶碱性蛋白质,根据 Lys/Arg比值不同,可分为H、HA、HB、H、H五种,均为 单链蛋白质,分子量1100021000 H2A、HB、H、H4各两分子对称聚集成组蛋白八聚体。 146bp长度的DNA双螺旋盘绕在八聚体上形成核小体。 核小体间DNA长度15-100b(般6b)其上结合有H1 2H2A、2HB、2H3、2H组蛋白八聚体146 cpDNA核小体 串联染色质拆叠染色体 DNA(直径2mm) 盘绕组蛋白八聚体上,结合H1,压缩1 核小体(一级结构) 螺旋化,压缩比1/6 螺线管(二级结构) 再螺旋化,压缩比1/40 超螺线管(三级结构) 折叠,压缩比1/5 染色单体(四级结构 总压缩比:18400-1/10000
五、 染色体的结构 1、大肠杆菌染色体 大肠杆菌染色体是由4.2×106bp组成的双链环状DNA 分子，约3000 个基因。 大肠杆菌DNA 结合蛋白： 每个细胞 H 两个 28KD的相同亚基 30000 个二聚体 HU 两个各9KD 的不同亚基 40000 个二体聚体 HLP1 17KD 的亚基 20000个单体 P 3KD的亚基 未知 这些DNA结合蛋白，使4.2×106bp的E.coli染色体DNA压缩成为一个手脚架形结构，结构中心是多种DNA结合蛋 白，DNA双螺旋分子有许多位点与这些蛋白结合，形成约100个小区，每个小区的DNA都是负超螺旋，一个小区的DNA 有两个端点被蛋白质固定，每个小区相对独立。 图 用极微量的DNA 酶I 处理时，只能使少量小区的DNA成为松驰状态，而其它小区仍然保持超螺旋状态。 2、真核生物染色体 主要由组蛋白和DNA组成。 组蛋白是富含碱性 a.a(Lys、Arg)的碱性蛋白质，根据 Lys/Arg 比值不同，可分为 H1、H2A、H2B、H3、H4五种，均为 单链蛋白质，分子量11000-21000。 H2A、H2B、H3、H4各两分子对称聚集成组蛋白八聚体。 146bp 长度的DNA双螺旋盘绕在八聚体上形成核小体。 核小体间DNA 长度15-100bp（一般60bp）其上结合有H1 图 2H2A、2H2B、2H3、2H4组蛋白八聚体 146bpDNA 核小体 串联 染色质 折叠 染色体 DNA（直径2nm） 盘绕组蛋白八聚体上，结合H1，压缩比1/7 核小体（一级结构） 螺旋化，压缩比1/6 螺线管（二级结构） 再螺旋化，压缩比1/40 超螺线管（三级结构） 折叠，压缩比1/5 染色单体（四级结构） 总压缩比：1/8400~1/10000
六、DNA的生物学功能 首次直接证明DNA的遗传功能的是 Avery的肺炎双球菌转化实验。 P3421-4 Avery的肺炎双球菌转化实验 第三节 RNA的结构 RNA的一级结构 RNA是AMP、GMP、CMP、UMP通过3、5/磷酸二酯键形成的线形多聚体。 P343图5-10RNA基本结构 ①组成RNA的戊糖是核糖 ②碱基中RNA的U替代DNA中的T,此外,RNA中还有一些稀有碱基。 ③天然RNA分子都是单链线形分子,只有部分区域是A-型双螺旋结构。双螺旋区一般占RNA分子的50%左右 RNA的类型 细胞中的RNA,按其在蛋白质合成中所起的作用,主要可分为三种类型。 核糖体 RNA TRNA 转 RNa tRNA 信使 RNA mRNA 此外,真核生物细胞中有少量核内小RNA( small nuclear rnasnrna) P344表5-7大肠杆菌中的RNA 沉降系数 离心场中的沉降速度,以S为单位,即103秒。 如23 S rRNA,单位离心场中沉降23×1013秒 5 SIrNA,单位离心场中沉降5×1013秒 、tRNA的结构 tRNA约占全部RNA的15% 主要功能:在蛋白质生物合成过程中转运氨基酸 已知一级结构的tRNA有160种,每种NA可运载一种特定的a,一种aa可由一种或多种tRNA运载 结构特点 ①分子量在25kd左右,7090b,沉降系数4sS左右 ②碱基组成中有较多稀有碱基 图 ③3’末端为 pCpA-OH,用来接受活化的氨基酸,此木称接受末端。 ④5末端大多为pG…或pC…
六、 DNA 的生物学功能 首次直接证明DNA的遗传功能的是Avery的肺炎双球菌转化实验。 P342 1~4 Avery的肺炎双球菌转化实验 第三节 RNA 的结构 一、 RNA 的一级结构 RNA 是 AMP、GMP、CMP、UMP通过3/、5/磷酸二酯键形成的线形多聚体。 P343 图 5-10 RNA 基本结构 ① 组成 RNA 的戊糖是核糖 ② 碱基中 RNA 的U替代DNA 中的T，此外，RNA中还有一些稀有碱基。 ③ 天然 RNA 分子都是单链线形分子，只有部分区域是A-型双螺旋结构。双螺旋区一般占RNA分子的50%左右。 二、 RNA 的类型 细胞中的RNA，按其在蛋白质合成中所起的作用，主要可分为三种类型。 核糖体 RNA rRNA 转运 RNA tRNA 信使 RNA mRNA 此外，真核生物细胞中有少量核内小RNA（small nuclear RNA snRNA） P344 表 5-7 大肠杆菌中的RNA 沉降系数：单位离心场中的沉降速度，以S 为单位，即10-13秒。 如 23S rRNA ，单位离心场中沉降 23×10-13秒 5S rRNA ，单位离心场中沉降 5×10-13秒 三、 tRNA 的结构 tRNA 约占全部RNA 的15% 主要功能：在蛋白质生物合成过程中转运氨基酸。 已知一级结构的tRNA 有160种，每种tRNA 可运载一种特定的a.a，一种a.a可由一种或多种tRNA运载。 结构特点 ①分子量在25kd 左右，70-90b，沉降系数4S左右 ②碱基组成中有较多稀有碱基 图 ③3’末端为…CpCpA-OH，用来接受活化的氨基酸，此末端称接受末端。 ④5’末端大多为pG…或pC…
⑤二级结构是三叶草形 P345图5-12tRNA的二级结构(三叶草模型) 1966年Crk对于RNA能识别几种密码子的现象,提出碱基配对的“摆动学说”: 认为除A-U、G-C配对外,还有非标准配对,I-A、I-C、IU,并强调密码子的5’端第1、2个碱基严格遵循标准配对, 而第3个碱基可以非标准配对,具有一定程度的摆动灵活性 四、mRNA的结构 mRNA是从DNA上转录而来的,其功能是依据DNA的遗传信息,指导各种蛋白质的生物合成,每一种蛋白质都由 种相应的mRNA编码,细胞内mRNA种类很多,大小不一,每种含量极低 从功能上讲,一个基因就是一个顺反子,原核生物的mRNA是多顺反子,真核mRNA是单顺反子。 顺反子:是由顺反试验所规定的遗传单位,相当于一种蛋白质的基因。 l、真核mRNA (1)、3-端有段约30300核苷酸的pdyA。 PolyA是转录后,经poA聚合酶添加上, polyA聚合酶对mRNA专一。 原核mRNA一般无 poly Ao polyA与mRNA半寿期有关,新合成的mRNA,其polA较长;而衰老的mRNA,其poyA 较短。 polyA功能 PolyA是mRNA由核进入胞质所必需的形式 PolyA大大提高mRNA在胞质中的稳定性 (2)、5帽子帽子 5ˆ末端的鸟嘌呤N被甲基化,鸟嘌呤核苷酸经焦磷酸与相邻的一个核苷酸相连,形成5ˆ-5-磷酸二酯键。 P346帽子结构 帽子的功能: 可抵抗5核酸外切酶降解mRNA 可为核糖体提供识别位点,使mRNA很快与核糖体结合,促进蛋白质合成起始复合物的形成。 2、原核mRNA(多顺反子) 原核mRNA由先导区、插入序列、翻译区和末端序列组成。没有5帽子和3poyA 举列:MS2病毒mRNA,3569b,有三个顺反子,分别编码A蛋白、外壳蛋白和复酶三种蛋白质 图MS2病mRNA 5端先导区中,有一段富含嘌呤的碱瑊基序列,典型的为5- AGGAGGU-3,位于起始密码子AUG前约10核苷酸处
⑤二级结构是三叶草形 P345 图 5-12 tRNA 的二级结构（三叶草模型） 1966 年 Crick 对于tRNA 能识别几种密码子的现象，提出碱基配对的“摆动学说”： 认为除A-U、G-C配对外，还有非标准配对，I-A、I-C、I-U，并强调密码子的5’端第1、2个碱基严格遵循标准配对， 而第 3 个碱基可以非标准配对，具有一定程度的摆动灵活性。 四、 mRNA 的结构 mRNA是从 DNA上转录而来的，其功能是依据DNA的遗传信息，指导各种蛋白质的生物合成，每一种蛋白质都由一 种相应的mRNA编码，细胞内mRNA种类很多，大小不一，每种含量极低。 从功能上讲，一个基因就是一个顺反子，原核生物的mRNA是多顺反子，真核mRNA是单顺反子。 顺反子：是由顺反试验所规定的遗传单位，相当于一种蛋白质的基因。 1、真核 mRNA （1）、 3’-端有一段约30-300 核苷酸的polyA。 PolyA 是转录后，经polyA 聚合酶添加上，polyA 聚合酶对mRNA专一。 原核mRNA一般无polyA。polyA与mRNA半寿期有关，新合成的mRNA，其polyA较长；而衰老的mRNA，其polyA 较短。 polyA 功能： PolyA 是mRNA 由核进入胞质所必需的形式。 PolyA 大大提高mRNA在胞质中的稳定性。 （2）、 5’-帽子帽子 5’末端的鸟嘌呤N7被甲基化，鸟嘌呤核苷酸经焦磷酸与相邻的一个核苷酸相连，形成5’-5’-磷酸二酯键。 P346 帽子结构 帽子的功能： 可抵抗 5’核酸外切酶降解mRNA。 可为核糖体提供识别位点，使mRNA 很快与核糖体结合，促进蛋白质合成起始复合物的形成。 2、原核 mRNA（多顺反子） 原核 mRNA 由先导区、插入序列、翻译区和末端序列组成。没有5/帽子和3/polyA。 举列：MS2病毒mRNA，3569 b，有三个顺反子，分别编码A蛋白、外壳蛋白和复制酶三种蛋白质。 图 MS2 病mRNA 5’端先导区中，有一段富含嘌呤的碱基序列，典型的为 5’-AGGAGGU-3’，位于起始密码子 AUG 前约 10 核苷酸处
此序列由She和 Dalgamo发现,称SD序列 SD序列和核糖体16S的rRNA的3末端富含嘧啶碱基的序列互补,这种互补序列与mRNA对核糖体的识别有关。 原核mRNA代谢很快,半寿期几秒至十几分钟。 rRNA的结构 rRNA占总RNA的80%左右。 功能:rRNA是构成核糖体的骨架,与核糖体结合蛋白一起构成核糖体,为蛋白质的合成提供场所。 大肠杆菌中有三类rRNA(原核) SS rRNA 16S rRNA 23S rRNA 真核细胞有四类rRNA SIRNA 5. 8S rRNA 1 8S rRNA 28S rRNA 图原核核糖体(GRNA部分) 图真核核糖体(rRNA部分) P346图5-14大肠杆菌5 SrRNA结构 第四节 核酸的性质 解离性质 多聚核苷酸有两类可解离的基团:磷酸和碱基能发生两性解离。 磷酸是中等强度的酸,碱基的碱性较弱,因此,核酸等电点在较低的pH范围内 DNA等电点4-45 RNA等电点2-25 RNA链中,核糖C'2OH的氢能与磷酸酯中的羟基氧形成氢链,促进磷酸酯羟基氢原子的解离 水解性质 1、碱水解 室温,0.lmoⅥ^NaOH可将RNA完全水解,得到2-或3-磷酸核苷的混合物
此序列由Shine和Dalgarno 发现，称SD 序列。 SD 序列和核糖体16S的rRNA 的3’末端富含嘧啶碱基的序列互补，这种互补序列与mRNA对核糖体的识别有关。 原核 mRNA 代谢很快，半寿期几秒至十几分钟。 五、 rRNA 的结构 rRNA 占总RNA 的80%左右。 功能：rRNA是构成核糖体的骨架，与核糖体结合蛋白一起构成核糖体，为蛋白质的合成提供场所。 大肠杆菌中有三类rRNA（原核） 5S rRNA 16S rRNA 23S rRNA 真核细胞有四类rRNA 5S rRNA 5.8S rRNA 18S rRNA 28S rRNA 图 原核核糖体（rRNA部分） 图 真核核糖体（rRNA 部分） P346 图 5-14 大肠杆菌 5S rRNA 结构 第四节 核酸的性质 一、 解离性质 多聚核苷酸有两类可解离的基团：磷酸和碱基能发生两性解离。 磷酸是中等强度的酸，碱基的碱性较弱，因此，核酸等电点在较低的pH 范围内。 DNA 等电点 4—4.5 RNA 等电点 2—2.5 RNA 链中，核糖C’2-OH的氢能与磷酸酯中的羟基氧形成氢链，促进磷酸酯羟基氢原子的解离。 二、 水解性质 1、碱水解 室温，0.1mol/LNaOH可将RNA完全水解，得到2’-或3’-磷酸核苷的混合物。 图