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134 遗传HEREDITAS(Beijing)200 27卷 (2)对大豆抗豆秆黑潜蝇的遗传研究,原采用抗 步还研究了分离分析方法的测验能力问题2。 感定性的孟德尔分析方法为一对显性主基因控制经 3.2应用实例 PP235世代联合分离分析结果发现有一 为说明分析方法的全过程,以下列出一个实际 对主基因,并有多基因共同控制,主基因遗传率在五 实验分析的步骤和结果】 为44.2%72.9%,多基因遗传率0~13%。 ()实验数据以南京农业大学朱立宏教授提 (3)对油菜芥酸含量的遗传研究,以往按孟德尔 供的南京6号(P)广丛(P2)杂交组合6世代的株 分析方法结果为2对主基因控制,经P1、P2、F 高数据为例,其次数分布如表4。最初按孟德尔方 23B12B226家系世代联合分离分析,证实有2 法分析,认为高亲为显性,人工地在125cm(峰谷) 对主基因控制但一对效应较大另一对约为其1/2 处将个体归为二组B,归入显性组B2为11分离 主基因遗传率在F23为51.33%,同时还受多基因控 2呈3】分离,因而认为矮秆由1对隐性基因控 制,多基因遗传率为47.81% 制。这种人为划线分组方法不尽合理,因而采用主 近3年有30多位外单位研究者索要本方法分析 基因多基因模型分离分析法。 软件用于博、硕士学位论文及博士后研究,内容涉及 (2)模型配合(对数似然函数值和AC值)对 不结球白菜维生素C和可溶性糖含量、小麦赤需酸不 以上数据按5类24种模型进行极大对数似然估计 敏感性、云南稻种小白谷耐冷性指标性状、小麦品种 的配合,采用ECM算法得相应的极大对数似然函 纹枯病抗性玉米雄穗性状与产量性状、花生种子抗 数值和AC值如表5。巳2模型(两对主基因+多基 黄曲霉侵染性状棉花品质纤维性状等的主基因与多 因的混合遗传模型)具有最小AC值,为可能最佳 基因遗传分析II。Wang,Podhch,Cooper等进 模型。与之相近的还有D2、D1D、E1等。 表4水稻南京6号(P)广丛(P)的6世代株高次数分布 Table 4 Distributions of plant height of six generations of the rice cross studied 80-859095-100105110115120125-130135-140145150-155-160-165-170175-180-185 32 2 317 8 1111318 5 20142413123 110182718112 131419221141 5 915131311141482994130698572502362 表了用IECM算法估计各种遗传模型的极大对数似然函数值和AIC值 Table 5 The values of maximum likelihood function and values of AIC obtained from IECM algorithm 模型 极大对数似然值 积型 极大对数似然值 AIC AIC d Model aamnikelihood 6523.8 ·3185.9 6395.90 3460.4 926.9 10 324g 6469.6d 3433 .3381.1 113 6864.46 E2 .117.0 6166.13 34d40 600.13 E3 326.75 641.0 B-6 .3389.06 6784.12 E4 .3254.5 6525.03 .3287.47 6582.93 E5 .3195.23 6408.46 ,3290.6 6587.30 E6 3337.26 6690.51 1994-2009 China academic Journal electronie publishins House all rights reserved. http://www.cnki.ne(2)对大豆抗豆秆黑潜蝇的遗传研究 ,原采用抗、 感定性的孟德尔分析方法为一对显性主基因控制 ,经 P1、P2、F1、F2、F2∶3 5 世代联合分离分析结果发现有一 对主基因 ,并有多基因共同控制 ,主基因遗传率在 F2 为 4412 %~7219 % ,多基因遗传率 0~13 %。 (3) 对油菜芥酸含量的遗传研究 ,以往按孟德尔 分析方法结果为 2 对主基因控制 ,经 P1 、P2 、F1 、 F2∶3、B1∶2 、B2∶2 6 家系世代联合分离分析 ,证实有 2 对主基因控制 ,但一对效应较大 ,另一对约为其1/ 2 , 主基因遗传率在 F2∶3为 51133 % ,同时还受多基因控 制 ,多基因遗传率为 47181 %。 近 3 年有 30 多位外单位研究者索要本方法分析 软件用于博、硕士学位论文及博士后研究 ,内容涉及 不结球白菜维生素 C和可溶性糖含量、小麦赤霉酸不 敏感性、云南稻种小白谷耐冷性指标性状、小麦品种 纹枯病抗性、玉米雄穗性状与产量性状、花生种子抗 黄曲霉侵染性状、棉花品质纤维性状等的主基因与多 基因遗传分析[9~11 ]。Wang , Podhch , Cooper 等进一 步还研究了分离分析方法的测验能力问题[12 ]。 312 应用实例 为说明分析方法的全过程 ,以下列出一个实际 实验分析的步骤和结果[1 ] 。 (1) 实验数据 以南京农业大学朱立宏教授提 供的南京 6 号(P1 ) ×广丛(P2 ) 杂交组合 6 世代的株 高数据为例 ,其次数分布如表 4。最初按孟德尔方 法分析 ,认为高亲为显性 ,人工地在 125 cm (峰谷) 处将个体归为二组 ,B1 归入显性组 ,B2 为 1∶1 分离 , F2 呈 3∶1 分离 ,因而认为矮秆由 1 对隐性基因控 制。这种人为划线分组方法不尽合理 ,因而采用主 基因2多基因模型分离分析法。 (2) 模型配合(对数似然函数值和 AIC 值) 对 以上数据按 5 类 24 种模型进行极大对数似然估计 的配合 ,采用 IECM 算法得相应的极大对数似然函 数值和 AIC 值如表 5。E22 模型(两对主基因 + 多基 因的混合遗传模型) 具有最小 AIC 值 ,为可能最佳 模型。与之相近的还有 D22、D21、D、E21 等。 表 4 水稻南京 6 号( P1 ) ×广丛( P2 ) 的 6 世代株高次数分布 Ta ble 4 Distri buti ons of pla nt height of six ge ne r a ti ons of t he ric e c r oss st udie d 80~ 85~ 90~ 95~ 100~ 105~ 110~ 115~ 120~ 125~ 130~ 135~ 140~ 145~ 150~ 155~ 160~ 165~ 170~ 175~ 180~ 185 P1 4 5 32 22 2 F1 3 17 8 4 P2 1 11 13 18 5 B1 20 14 24 13 12 3 B2 1 10 18 27 18 11 2 1 3 14 19 22 11 4 1 F2 5 9 15 13 13 11 14 14 8 2 9 9 41 30 69 85 72 50 23 6 2 表 5 用 IECM 算法估计各种遗传模型的极大对数似然函数值和 AIC 值 Ta ble 5 The value s of ma ximum likelihood f unc ti on a nd value s of AIC obt aine d fr om IECM al gorit hm 模型 Model 极大对数似然值 Maximum likelihood AIC 模型 Model 极大对数似然值 Maximum likelihood AIC A21 - 3257194 6523187 D - 3185195 6395190 A22 - 3460148 6926197 D21 - 3185130 6388160 A23 - 3300169 6607137 D22 - 3185130 6386160 A24 - 3631170 7269140 D23 - 3264198 6545197 B21 - 3224181 6469163 D24 - 3422124 6860148 B22 - 3225194 6463188 E - 3185193 6407187 B23 - 3381116 6770132 E21 - 3183180 6397160 B24 - 3422123 6864146 E22 - 3172106 6366112 B25 - 3444106 6902112 E23 - 3226175 6471150 B26 - 3389106 6784112 E24 - 3254151 6525103 C - 3287147 6582193 E25 - 3195123 6408146 C21 - 3290165 6587130 E26 - 3337126 6690151 134 遗 传 HEREDITAS ( Beijing) 2005 27 卷
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