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DNA条形码研究进展751 Current Progress of DNA Barcoding 学等学科领域。 文4篇,其余为正式发表论文。发表的论文综述约占 DNA条形码分类高效简便,能够可靠评估物种一半,为45篇。综述和研究论文发表数量按年份总 多样性和遗传多样性,开展生态学以及生物地理学体上均呈逐年递增趋势,研究论文增长较快(表1;图1)。 研究。DNA条形码能够区分近缘种,使生物多样性112篇国内期刊论文中,动物类的论文为55篇,植物 分析更加细致全面( Bucklin et al,2010)。通过分析类的论文为35篇,真菌和微生物论文7篇。 DNA条形码的种内和种间多态性与遗传距离等可 以准确揭示生物的遗传多样性( Valdez-Moreno et al,表1国内期刊发表的DNA条形码文章数量 2009; Yuan et al,2009)。生态学研究首先需要对取样 Table 1 Numbers of dNa barcoding paper published in inland professional periodicals each year 区内的生物种类进行鉴定,采用传统方法时,要求研 究人员具有很高的专业分类学水平,而生态学家往 200620072008200920102011 往很难达到这一要求:DNA条形码技术则很好地解研究论文 决了这个问题,具有基本的生物学知识就可以很容 Research paper 综述论文 易地掌握DNA条形码鉴定方法 Review paper 在保护生物学中,DNA条形码可以正确评价濒会议论文 危物种的遗传多样性,为其科学保护和种群恢复提 Meeting paper 供可靠依据( Vogler and Monaghan,2007; Naro- Maciel学位论文 etal,2009)。同时,应用DNA条形码进行生物食谱 Degree paper 分析,可以了解生态系统中形成的食物链关系,促进合计 珍稀生物保护( Witt et al,2006)。采用粪便和毛发等oa 样品进行DNA条形码分析,可以在不伤害动物的同 时进行保护生物学研究,例如, Valiere等(2003)利用 Research 粪便和毛发样品,在法国和瑞士进行了狼范围扩大 的跟踪研究。 监督动植物产品的非法交易,提升海关等政府組 部门对珍稀物种的有效监控和保护(Naro- Maciel et al,2009)。许多动植物产品只能观察到毛发等局部组 年份 织,很难通过极其有限的局部形态结构特征来判断 产品是否为禁止交易生物,DNA条形码分析使这些维普资讯网) 图1国内期刊每年发表的DNA条形码论文数量(综合CNKI和 问题迎刃而解。例如,美国应用DNA条形码分析发 Figure 1 Paper numbers about dna barcoding searched from 现23%的鱼子酱标注的鱼类名称错误,有的还有濒 CNKI and vIP information 危鱼类成分 Birstein et al,2000)。 3.1.1国内动物DNA条形码文献 此外,DNA条形码技术还可以应用于食品安全 领域,实现食品的快速检测和鉴别( Smith et al,2008b 55篇动物类论文主要是水生动物和昆虫的研究 1g and Ha200生物安全领域DNA条形和综述论文,各有18篇。昆虫条形码论文主要是关 码可以科学准确鉴定外来物种,尤其是难以用形态于鞘翅目( Coleoptera)、直翅目 Orthoptera)、半翅目 学分类鉴定的卵和幼虫的鉴定。 ( Hemiptera)鳞翅目( Lepidoptera)的天蛾和卷蛾、双翅 目( Diptera)实蝇与寄蝇、膜翅目中国榕小蜂的相关研 3国内外DNA条形码研究文献现状 究或者进展。水生动物的18篇论文中,有5篇是中 国鲚属( Coilia)、鲟鱼( Acipenser sturio L.)、亚东鲑 3.1国内DNA条形码研究文献现状 ( Salmo trutta fraio)东亚特有鲤科( Cyprinidae)类群和 2011年12月4日在CNK中国知网htp210.鲤科鲐属( Culter淡水鱼类DNA条形码的研究论文; 3732.25/knso/ index.aspx/)和维普资讯网(htp:/210.有关海水鱼类的论文有4篇,分别研究石首鱼科 373223:8080 /index. asp.)上输入“条形码”后再输入( Sciaenidae)鱼类、中国南海裸胸鳝属( Gymnothorax)鱼 “DNA进行搜索,共得到2006年以来的论文112篇,类、台湾鲻科( mugilidae)的分类和卵形鲳鲹( Trach- 其中硕士学位论文和博士学位论文各1篇,会议论 inotus ovatus L)线粒体COI基因全长序列的克隆与分 91994-2012ChinaAcademicJournalElectronicPublishingHouse.Allrightsreservedhttp:/www.cnki.netDNA 条形码研究进展 Current Progress of DNA Barcoding 学等学科领域。 DNA 条形码分类高效简便,能够可靠评估物种 多样性和遗传多样性,开展生态学以及生物地理学 研究。DNA 条形码能够区分近缘种,使生物多样性 分析更加细致全面(Bucklin et al., 2010)。通过分析 DNA 条形码的种内和种间多态性与遗传距离等可 以准确揭示生物的遗传多样性(Valdez-Moreno et al., 2009; Yuan et al., 2009)。生态学研究首先需要对取样 区内的生物种类进行鉴定,采用传统方法时,要求研 究人员具有很高的专业分类学水平,而生态学家往 往很难达到这一要求;DNA 条形码技术则很好地解 决了这个问题,具有基本的生物学知识就可以很容 易地掌握 DNA 条形码鉴定方法。 在保护生物学中,DNA 条形码可以正确评价濒 危物种的遗传多样性,为其科学保护和种群恢复提 供可靠依据(Vogler and Monaghan, 2007; Naro-Maciel et al., 2009)。同时,应用 DNA 条形码进行生物食谱 分析,可以了解生态系统中形成的食物链关系,促进 珍稀生物保护(Witt et al., 2006)。采用粪便和毛发等 样品进行 DNA 条形码分析,可以在不伤害动物的同 时进行保护生物学研究,例如,Valière 等(2003)利用 粪便和毛发样品,在法国和瑞士进行了狼范围扩大 的跟踪研究。 监督动植物产品的非法交易,提升海关等政府 部门对珍稀物种的有效监控和保护(Naro-Maciel et al., 2009)。许多动植物产品只能观察到毛发等局部组 织,很难通过极其有限的局部形态结构特征来判断 产品是否为禁止交易生物,DNA 条形码分析使这些 问题迎刃而解。例如,美国应用 DNA 条形码分析发 现 23%的鱼子酱标注的鱼类名称错误,有的还有濒 危鱼类成分(Birstein et al., 2000)。 此外,DNA 条形码技术还可以应用于食品安全 领域,实现食品的快速检测和鉴别(Smith et al., 2008b; Wong and Hanner, 2008);在生物安全领域 DNA 条形 码可以科学准确鉴定外来物种,尤其是难以用形态 学分类鉴定的卵和幼虫的鉴定。 3 国内外 DNA 条形码研究文献现状 3.1 国内 DNA 条形码研究文献现状 2011 年 12 月 4 日在 CNKI 中国知网(http://210. 37.32.25/kns50/index.aspx/)和维普资讯网(http://210. 37.32.23:8080/index.asp/)上输入“条形码”后再输入 “DNA”进行搜索,共得到 2006 年以来的论文 112篇, 其中硕士学位论文和博士学位论文各 1 篇,会议论 文 4 篇,其余为正式发表论文。发表的论文综述约占 一半,为 45 篇。综述和研究论文发表数量按年份总 体上均呈逐年递增趋势,研究论文增长较快(表 1;图1)。 112 篇国内期刊论文中,动物类的论文为 55 篇,植物 类的论文为 35 篇,真菌和微生物论文 7 篇。 3.1.1 国内动物 DNA 条形码文献 55 篇动物类论文主要是水生动物和昆虫的研究 和综述论文,各有 18 篇。昆虫条形码论文主要是关 于鞘翅目(Coleoptera)、直翅目(Orthoptera)、半翅目 (Hemiptera)、鳞翅目(Lepidoptera)的天蛾和卷蛾、双翅 目(Diptera)实蝇与寄蝇、膜翅目中国榕小蜂的相关研 究或者进展。水生动物的 18 篇论文中,有 5 篇是中 国 鲚 属 (Coilia)、鲟 鱼 (Acipenser sturio L.)、亚 东 鲑 (Salmo trutta fraio)、东亚特有鲤科(Cyprinidae)类群和 鲤科鲌属(Culter)淡水鱼类 DNA 条形码的研究论文; 有关海水鱼类的论文有 4 篇,分别研究石首鱼科 (Sciaenidae)鱼类、中国南海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼 类、台湾鲻科(mugilidae)的分类和卵形鲳鲹(Trach￾inotus ovatus L.)线粒体 COⅠ基因全长序列的克隆与分 表 1 国内期刊发表的 DNA 条形码文章数量 Table 1 Numbers of DNA barcoding paper published in inland professional periodicals each year 研究论文 Research paper 综述论文 Review paper 会议论文 Meeting paper 学位论文 Degree paper 合计 Total 2006 1 1 2007 2 2 2008 3 4 1 8 2009 6 6 1 1 14 2010 24 20 2 1 47 2011 25 15 40 图 1 国内期刊每年发表的 DNA 条形码论文数量(综合 CNKI和 维普资讯网) Figure 1 Paper numbers about DNA barcoding searched from CNKI and VIP information 751
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