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实验一醋酸纤维薄膜电泳分离核苷酸 一.目的 学习核糖核酸碱水解的原理和方法,掌握核糖核苷酸的醋酸纤维薄膜电泳的原理和方 法。 二原理 RNA在稀碱条件下水解,先形成中间物2',3-环状核苷酸,进一步水解得到2'和3 ·核苷酸的混合物。 在PH3.5时,各核苷酸的第一磷酸基(PK0.7一1.0)完全解离,第二磷酸基(PK6.0) 和稀醇基(PK9.5以上)不解离,而含氨环的解离程度差别很大。(见附表)因此在PH3.5 条件下进行电泳可将这四种核苷酸分开 四种核苷酸在PHB.5时的离子化程 核苷酸 含氮环的PK值 离子化程度 净负电荷 AMP 3.70 0.54 0.46 GMP 230 005 095 CMP 4.24 0.84 0.16 UMP 1.00 本实验先用稀氢氧化钾溶液将RNA水解,再加高氯酸将水解液调至PHB.5,同时生成 高氯酸钾沉淀以除去K,然后用电泳法分离水解液中各核苷酸,并在紫外分析灯下确定RNA 碱水解液的电泳图谱。 三仪器、试剂、材料 1仪器 电热恒温水浴锅:紫外分析灯(波长为254m)点样器:离心机:电泳仪和电泳槽 2.试剂 100ml0.3molL氢氧化钾溶液:40ml200gL高氯酸溶液:4g核糖核酸(粉末):1000m 0.02 mol/L.PH3.5柠檬酸缓冲液: 3.材料 醋酸纤维薄膜(2×8cm) 四操作方法 .RNA的碱水解 称取0.2gRNA,溶于5ml0.3molL氢氧化钾溶液中,使RNA的浓度达到20 30mgml。在37度下保温18小时(或沸水浴30分钟)。然后将水解液转移到锥形瓶内, 在水浴中用高氯酸溶液滴定到水解液的PH为3.5.2000转/分离心10分钟,除去沉淀 上清液即为样品液。 点样 将醋酸纤维薄膜在PH3.50.02molL柠檬酸缓冲液中浸湿后,用滤纸吸去多余的缓冲 液。然后将膜条无光泽面向上平铺在玻璃板上,用电样器在距膜条一端2一3cm处点样。 3.电泳 珍好样的满限小心益放入电法结内.注意点样的一应客近负极。调节电 度为 0.4 mA/cm,.电泳25分钟 实验一 醋酸纤维薄膜电泳分离核苷酸 一.目的 学习核糖核酸碱水解的原理和方法,掌握核糖核苷酸的醋酸纤维薄膜电泳的原理和方 法。 二.原理 RNA 在稀碱条件下水解,先形成中间物 2',3'-环状核苷酸,进一步水解得到 2'和 3' -核苷酸的混合物。 在 PH3.5 时,各核苷酸的第一磷酸基(PK0.7-1.0)完全解离,第二磷酸基(PK6.0) 和稀醇基(PK9.5 以上)不解离,而含氮环的解离程度差别很大。(见附表)因此在 PH3.5 条件下进行电泳可将这四种核苷酸分开。 四种核苷酸在 PH3.5 时的离子化程度: 核苷酸 含氮环的 PK 值 离子化程度 净负电荷 AMP 3.70 0.54 0.46 GMP 2.30 0.05 0.95 CMP 4.24 0.84 0.16 UMP - 1.00 本实验先用稀氢氧化钾溶液将 RNA 水解,再加高氯酸将水解液调至 PH3.5,同时生成 高氯酸钾沉淀以除去 K+ ,然后用电泳法分离水解液中各核苷酸,并在紫外分析灯下确定 RNA 碱水解液的电泳图谱。 三.仪器、试剂、材料 1. 仪器 电热恒温水浴锅;紫外分析灯(波长为 254nm)点样器;离心机;电泳仪和电泳槽 2. 试剂 100ml 0.3mol/L 氢氧化钾溶液;40ml 200g/L 高氯酸溶液;4g 核糖核酸(粉末);1000ml 0.02mol/L PH3.5 柠檬酸缓冲液; 3. 材料 醋酸纤维薄膜(2×8cm) 四.操作方法 1. RNA 的碱水解: 称取 0.2g RNA,溶于 5ml 0.3mol/L 氢氧化钾溶液中,使 RNA 的浓度达到 20- 30mg/ml。在 37 度下保温 18 小时(或沸水浴 30 分钟)。然后将水解液转移到锥形瓶内, 在水浴中用高氯酸溶液滴定到水解液的 PH 为 3.5。2000 转/分离心 10 分钟,除去沉淀, 上清液即为样品液。 2. 点样 将醋酸纤维薄膜在 PH3.5 0.02mol/L 柠檬酸缓冲液中浸湿后,用滤纸吸去多余的缓冲 液。然后将膜条无光泽面向上平铺在玻璃板上,用电样器在距膜条一端 2-3cm 处点样。 3. 电泳 将点好样的薄膜小心地放入电泳槽内,注意点样的一端应靠近负极。调节电压至 160V,电流强度为 0.4mA/cm,电泳 25 分钟
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