肥胖、BD和癌症等相关的肠道微生物。当然,有些生物标记物并不具体涉 及某个菌,可能是在某一类别或者某几类菌,也可能是其它分类标准,如 肠型。仅从微生物分类的水平寻找生物标记物是不够的,宏基因组分析能 够发现一些与疾病相关的微生物功能基因,从微生物实际参与的代谢过程 来发现疾病的特异生物标记物似乎离摸清楚微生物与疾病的关系更近一 步。但是很多硏究只是停留在人体微生物与疾病的相关上,建立疾病与人 体微生物的因果关系才能更好应用于临床。 此外,微生物的代谢产物对人体的影响广泛,寻找和鉴定与人的健康和疾 病密切相关的代谢产物能够帮助人们了解具体的分子机制,从而为干预和 治疗疾病提供有效的靶点 事实上,人体微生物并不是一成不变的,它们始终处在动态变化中,摸清 其变化规律十分必要。目前所有的努力并不是为了解释健康和疾病发生的 原因,最终目的是为了预防疾病,为了预测未来的健康走向,这就需要结 合多组学的信息,采用MWAS的方法对疾病进行精准的诊断和治疗 在这篇文章中,作者还提出了大量具体的原则和建议,并且提出了一个叫 做微生物全球定位系统的设想,希望能够把全球不同地区、不同种族、不 同饮食和生活习惯的人群进行详细区分,然后根据他们体内微生物,提供 个性化的、精准的诊治方案。 Knight教授实验室致力于使用和发展最先进的计算和实验技术,来解答 些基本生物学问题,包括生物分子的组成,不同生态系统基因组和菌群, 包括复杂的人体微生物生态系统的进化过程。他们实验室做了很多开放订 阅和访问的科学模型,提供免费、开放源码的软件工具和公开所有可用的 协议和数据,以提高大众了解微生物生态的兴趣,并进一步努力促使公众 更积极地参与科学硏究。目前,世界各地分析微生物测序数据最常用的免 费开源软件QME就是来自 Knight教授实验室。此外他还主持了 个" American gut”项目,旨在让美国大众了解自己的肠道微生物组成 参考文献 1. Charbonneau MR et al. 2016. A microbial perspective of human developmental biology. Nature 535, 48-55