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,406 北京科技大学学报 第35卷 2.3细菌群落的多样性分析 四个泳道中条带的位置、灰度以及数日各有不同, 2.3.1DGGE图谱分析 每个样品都有3~4个较亮的条带,表明在不同的反 微生物制剂活化后的样品以及同一时期下从 应区均存在一定数量的优势种群,某些特征种属仅 不同反应区内取得样品的DGGE分离图谱如图 在特定生态条件下存在,随着环境条件的变化,其 7(a)所示.根据DGGE的原理可知,图谱中的每 种群数量也随之改变(如图7(b)中13号条带):各 一个条带代表一种可能的细菌类群,或者可操作分 样品也存在相同位置但信号强度不同的条带(如图 类单元(operation taxonomy unit,.OTU)l).这些条 7(b)中25号条带):相对于原始微生物制剂,在不 带明暗程度不同,粗细不一,对应在胶上的密度也 同的反应区也冇新的条带出现(如图7(b)中2和28 不同:泳道内的条带数目越多,说明该泳道对应的 号条带),表明随着环境条件的变化,出现了新的降 样品中微生物种类越半富:条带亮度越强,表明该 解污染物的微生物种群 种属微生物的数量越多. 2.3.2菌落结构多样性及相似性分析 利用凝胶定量分析软件Quantity One分析图 利用Quantity One软件,结合 谱,得到DGGE的泳道分析图(见图7(b).泳道分 析是以制剂活化后的样品为标尺放在图的左边作为 H=- 参照.从图中可以看出,不同反应区的样品条带数 (1) 不等,粗细灰度不一,所处位置也不同,由此可较 D=1- 为直观地了解各样品中群落的多样性及分布情况. 从图7(b)中可以看出,制剂中微生物种类丰富,条 2j 带数量较多,为18条.比较A1、A2、O和S发现这 Cs=- ×100. a+b (2) (b) 始 3 4 y 5 6 10叶 11+ 234 王 12 王 2 222452878 2 原始A1A20S 100.0%69.2%68.6%66.0%61.4% 图7不同样品的DGGE结果.(a)DGGE分离图谱:(b)DGGE图谱的泳道图 Fig.7 DGGE patterns of different samples:(a)DGGE profile of different samples;(b)DGGE sketch map of different samples· · 北 京 科 技 大 学 学 报 第 卷 细菌群落的多样性分析 图谱分析 微生物 制剂活化后 的样 品以及同一 时期 下从 不 同反应 区内取得样 品的 分 离图谱 如图 所示 根据 的原理可知 , 图谱中的每 一个条带代表一种可能的细菌类群, 或者可操作分 类单元 哪 , ` 这些条 带明暗程度不 同, 粗细不一 , 对应在胶上的密度也 不同 泳道 内的条带数 目越多, 说明该泳道对应的 样品中微生物种类越丰富 条带亮度越强, 表明该 种属微生物 的数量越多 利用凝胶定量分析软件 分析图 谱, 得到 的泳道分析图 见图 泳道分 析是以制剂活化后的样品为标尺放在图的左边作为 参照 从图中可 以看出, 不 同反应区的样 品条带数 量不等, 粗细灰度不一, 所处位置也不同, 由此可较 为直观地 了解各样品中群落的 多样性及分布情况 从图 中可以看出, 制剂中微生物种类丰 富, 条 带数量较 多, 为 条 比较 、 、 和 发现这 四个泳道 中条带 的位置 、 灰度 以及数 目各有不 同, 每个样品都有 、 个较亮的条带, 表明在不同的反 应区均存在一定数量的优势种群 某些特征种属仅 在特定生态条件下存在 , 随着环境条件的变 化, 其 种群数量也随之改变 如图 中 号条带 各 样品也存在相 同位置但信号强度不同的条带 如图 中 号条带 相对于原始微生物制剂, 在不 同的反应区也有新的条带出现 如图 中 和 号条带 , 表明随着环境条件 的变化 , 出现 了新的降 解污染物的微生物种群 菌落结构多样性及相似性分析 利用 软件, 结合 一睿资资 一`一睿资' ︸` 任污勺凸甘`︸八 勺心,︸山`自任合兄口内月了一 干牛土不丰十卞 孟,勺自山卫山几了廿自﹄︵ 匕污月` 白`山自 原始 图 不同样品的 结果 分离图谱 图谱的泳道图 即
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