DNA序列自身编码特征的分析是基因组信息学研究的基础,特别是随着大规模测序的日 益增加,它的每一个环节都与信息分析紧密相关。从测序仪的光密度采样与分析、碱基读出、 载体标识与去除、拼接、填补序列间隙、到重复序列标识、读框预测和基因标注的每一步都 是紧密依赖基因组信息学的软件和数据库。特别是拼接和填补序列间隙更需要把实验设计和 信息分析时刻联系在一起

本章介绍序列比对时常用的几个概念,包括同一性identity)、相似性(《dcnysimilaiy《)同 源性( homology)等。这些概念,在蛋白质和核酸序列比对时经常使用。双序列比对(pairwise alignement)是指通过一定的算法对两个DNA或蛋白质序列进行比对分析,从而找出两者 之间最大相似性匹配。双序列比对是序列分析常用方法之一,是多序列比对和数据库搜索的 基础

2.1本章简介 本章介绍因特网(Internet)和万维网(《ntemctWorIdWidcWcbWWW,《,简称www),介绍世界各国生物信息中心和服务机构。因特网的诞生,国际生物信息中心的建立,大大推动了生物信息学革命。基于因特网的浏览器的出现,为生物信息资源的开发和应用提供了有效途径。本章将简单介绍浏览器和通过浏览器进行数据库查询的方法,并给出一些重要生物信息中心的网址

实验一 WINDOWS2000 SERVER IIS的安装与配置 实验二HTML标记符的使用(表格、表单对象、c样式 实验三 JAVASCRIPT语言 实验四 VBSCRIPT编程 实验五ASP内建对象 实验六可安装组件和脚本对象 实验七数据管理的存取操作

6.1 Definition Definition: A queue is a linear list in which additions and deletions take place at different ends. It is also called a first-in-first-out list. The end at which new elements are added is called the rear. The end from which old elements are deleted is called the front

Two kinds of data structure Linear: list, stack, queue, string Non-linear: tree, graph

11.1 Binary Search Trees 1.Definition: A binary search tree is a binary tree that may be empty. nonempty binary search tree satisfies the following properties: 1)Every element has a key and no two elements have the same key: therefore,all keys are distinct

Main topics Definition of graphs and some terminology Three common graph representations Some algorithms

9.1 Introduction A priority queue is a collection of zero or more elements. Each element has a priority or value

7.1 Dictionaries A dictionary is a collection of elements each element has a field called key, and no two elements have the same key value. Operations: Insert(x): insert an element with a specified key value Search(k,x): search an element with a specified key