第一节 统计学习与推理基础 第二节 统计模型与参数推断 第三节 聚类分析、主成分分析与Fisher判别 第四节 贝叶斯推理 第五节 隐马尔可夫模型 第六节 动态神经网络 第七节 支持向量机 第八节 MATLAB的应用实例

第一节 分子进化与系统发育 第二节 分子系统发育树的构建方法 第三节 系统发育树构建及应用

第一节 合成生物学概述 第二节 合成生物学基础研究经典实例 第三节 合成生物学应用研究经典实例

第一节 系统生物学基本概念 第二节 系统生物学基本技术与方法 第三节 先进的成像技术 第四节 基因表达调控网络（图7.11-12） 第五节 代谢网络 第六节 信号转导途径 第七节 蛋白质一蛋白质相互作用网络 第八节 虚拟细胞

第一节 蛋白质组学概述 第二节 蛋白质的大规模分离鉴定技术 第三节 蛋白质的翻译后修饰 第四节 蛋白质分选 第五节 蛋白质相互作用

第一节 蛋白质编码基因的注释 第二节 RNA基因的注释 第三节 重复序列的注释 第四节 假基因的注释 第五节 案例分析：黄瓜基因组的注释

第一节 蛋白质结构组织层次 第二节 蛋白质结构的测定与理论预测 第三节 蛋白质折叠与疾病

第一节 序列比对相关概念 第二节 序列比对打分方法 第三节 序列比对算法 第四节 序列比对工具 第五节 多序列比对

第一节地貌的基本特征 第二节地貌形成因素

第一节 生物信息学的发展历史 第二节 生物信息学的研究领域 第三节 生物信息学的主要应用 第四节 生物信息学面临的挑战