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随着人类基因组计划的实施,通过基因组测序,蛋白质序列测定结构解析等实 验,分子生物学家提供了大量的有关生物分子的原始数据,需要利用现代计算技 术对这些原始数据进行收集、整理、管理以便于检索使用。而为了解释和理解这 些数据,还需要对数据进行比对、分析,建立计算模型,进行仿真、预测与验 证,因而出现生物信息学,它的出现,极大的促进了分子生物学的发展
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一、引言 快速、经济的核酸序列测序方法的出现使包括分子生物学、遗传学以及生物化学在内的许多 科学领域发生了革命。(Gi bert,1981: Sanger,1981)这项技术的发展同时也使人们需 要构建公用数据库来存储在全世界范围的实验室内得到的序列信息(Benson et al.1997 Stoesser et al.1997)。由于提交到数据库中的序列需要进行分析和解释,同时已经存在 的数据库中的条目需要进行辨识和修补以供研究人员进一步研究之用,因此随着公用数据库 的建立,生物信息学和计算生物学逐渐走向成熟
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6.4逻辑结构设计 一、逻辑结构设计的任务 1.概念结构是各种数据模型的共同基础。 2.为了能够用某一DBMS实现用户需求,还必须将概念结构进一步转化为相应的数据模型,这正是数据库逻辑结构设计所要完成的任务
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如第二章所述,建立 GenBank是为了适应人类基应组工程等科学研究产生的大量序列数据的信 息爆炸。总的来说, GenBank是带有注释的公用DNA蛋白质序列的集合。写作本书时, GenBank中有160万条链的纪录,含超过10亿个核苷酸碱基。向GenBank存入新的序列有两种方 法:通过 Sequi nBankl和等工具直接提交,或通过国际核苷酸序列数据库的组成部分 GenBank,eml,和DDB等相互之间传递数据的共享协议
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3.1数据库的存储结构 3.2创建和删除数据库 3.3修改数据库
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输入输出方法 AVA 只有缓冲区满时才会将数据送到输出流 Java在输出数据流中,当对方尚未将数据取走 时,程序就会被阻塞. 有时要人为地将尚未填满的缓冲区中的数据 送出,使用 flusho方法
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第三章数据输入与输出 一、数据输出 二、数据输入
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第二章数据描述 本章知识点: 一、预备知识 二、数据类型 三、常量与变量 四、不同类型数据间的转换 五、运算符和表达式
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一、什么是数据结构 二、抽象数据类型及面向对象概念 三、数据结构的抽象层次 四、用C++描述面向对象程序 五、算法定义 六、模板 七、性能分析与度量
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静态数据表类定义 #include const int DefaultSize = 100; template class dataList //数据表的前视声明 template class Element { //数据表元素类的定义
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