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中国农业大学:《动物育种学》课程PPT教学课件(家畜育种学)个体遗传评定(BLUP法)线性模型、基础知识

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个体遗传评定一-BLUP法 线性模型 基础知识

线性模型 基础知识 个体遗传评定--BLUP法

线性! 模型? 线性模型? 《畜禽育种中的线性模型》 张沅、张勤,1993

线性! 模型? 线性模型? 《畜禽育种中的线性模型》 张沅、张勤,1993

线性 Y与Ⅹ之间 Y=a+bX Y=aX 线性关系:直线关系 非线性关系:曲线关系 例如:育种值与表型 例如:产奶曲线、生长 观察值 A=b4P(P*-P) 曲线

X Y Y=a+bX 线性关系:直线关系 例如:育种值与表型 观察值 Y与X之间 X Y Y=aXß 非线性关系:曲线关系 例如:产奶曲线、生长 曲线 线 性 ( * ) A ˆ = bAP P −P

模型的定义 >模型:数学表达式,科学合理地描述数据 >直接影响数据统计分析的效果 >数据:来自试验结果;来自调查测定结果 数据统计分析: 一般分析:均数、方差等统计分布特征 特殊分析:遗传参数、个体育种值 模型表达了数据的特性;反映了生物 学问题的规律

模型的定义 ➢模型:数学表达式,科学合理地描述数据 ➢直接影响数据统计分析的效果 ➢数据:来自试验结果;来自调查测定结果 ➢数据统计分析: 一般分析:均数、方差等统计分布特征 特殊分析:遗传参数、个体育种值 模型表达了数据的特性;反映了生物 学问题的规律

参数:总体分布中的未知常数。如:总体均数、 总体标准差、总体方差 统计量:反映样本特征的数值。如:样本均数、 样本标准差、样本方差 均值:反映性状变量集中性的数值 方差:反映性状变量离散性的数值 群体均值 图5-6实际育种工作中的选择分布图 P=性状表型值;Ps=被选中种畜的表型值平均数 P=群体中经性能测定动物表型值平均数阴影部分=被选中的种畜所占的份额

参 数:总体分布中的未知常数。如:总体均数、 总体标准差、总体方差 统计量:反映样本特征的数值。如:样本均数、 样本标准差、样本方差 均值:反映性状变量集中性的数值 方差:反映性状变量离散性的数值 群体均值

模型的定义 模型( mode):数学表达式,(随机变量,数 学变量,参数) 例: S=BT2自由落体运动模型,T为时间 S为距离 S,7一数学变量,B一未知参数 S=BT +eS为S的一个观察值,e为随 3机误差 Sy,e一随机变量,7数学变量, B一未知参数 N(0,a2).S~N(4,.2)

模型的定义 模 型(model):数学表达式,(随机变量,数 学变量,参数) 例: 2 S = T , S,T —数学变量, —未知参数 S = T + e 2 '  , S',e —随机变量,T—数学变量,  —未知参数 ~ (0, ) 2 e N  , '~ ( , ) 2 S N   自由落体运动模型,T为时间 S为距离 S’为S的一个观察值,e为随 机误差

线性模型的概念 观察值(记录):对试验个体直接测量的结果, 包括客观和主观获得的测量结果。 观察值一般都是具有多元分布的随机变量 当观察值分布的形式已知(正态分布、卡方 分布),则需要详尽地了解分布的参数(平均 数、方差) 参数是对分布的 数据说明

线性模型的概念 观察值(记录):对试验个体直接测量的结果, 包括客观和主观获得的测量结果。 观察值一般都是具有多元分布的随机变量 当观察值分布的形式已知(正态分布、卡方 分布),则需要详尽地了解分布的参数(平均 数、方差) 参数是对分布的 数据说明

X~N(50,202) X~N(100202) 4=50 =100 0=20 0=20 305070100120 不同平均数、相同标准差的正态分布(X~N(,a2) 随机变量X符 合正态分布

30 50 70 100 120 μ=50 σ =20 不同平均数、相同标准差的正态分布(X~N (μ, σ 2 )) X~N (50,202 ) μ=100 σ =20 X~N (100,202 ) 随机变量X符 合正态分布

p=50 =5 p=50 =20 305070 不同标准差、相同平均数的正态分布

30 50 70 μ=50 σ =20 不同标准差、相同平均数的正态分布 μ=50 σ =5

线性模型的概念 建立线性模型的目的:为了分析影响观 察值的各因素(因子) 建立模型时需考虑所有的影响因素 因子:直接或间接影响观察值的因素 例如:影响母牛产奶的因素有:头胎产犊年龄、 产犊季节、本身的遗传潜力、空怀天数等等

线性模型的概念  建立线性模型的目的:为了分析影响观 察值的各因素(因子)  建立模型时需考虑所有的影响因素 因子:直接或间接影响观察值的因素 例如:影响母牛产奶的因素有:头胎产犊年龄、 产犊季节、本身的遗传潜力、空怀天数等等

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